NFKBID - NFKBID
Nukleární faktor zesilovače genu polypeptidu lehkého polypeptidu kappa v inhibitoru B-buněk, delta také známý jako IκBNS je a protein u lidí, který je kódován NFKBID gen.[5]
IκBNS je členem atypických inhibitorů NF-κB (nazývaných také nukleární IκB). NF-kB je transkripční faktor, který reguluje expresi svých cílových genů v závislosti na intracelulárních a extracelulárních signálech. Protože NFKBID ovlivňuje dopad NF-kB na několik genů, podílí se na buněčných reakcích na podněty, jako je stres a bakteriální nebo virové antigeny.
Struktura
NFKBID je jaderný protein s 327 aminokyselinami. Obsahuje šest ankyrin se opakuje (ANK), které jsou obklopeny a signál jaderné lokalizace sekvence (NLS) na N-konec a krátký C-konec.[6][7] ANK jsou charakteristické pro všechny proteiny IκB. NLS je dalším charakteristickým strukturním prvkem pouze atypických proteinů IκB, který je zodpovědný za lokalizaci proteinu do jádra. Naproti tomu klasické inhibitory, např. IκBα a IκBβ jsou umístěny v cytoplazmě. Struktura NFKBID s vysokým rozlišením zatím není k dispozici.
Funkce
Zdá se, že NFKBID působí jako inhibitor kaskády NF-kB. Svými funkcemi, včetně podpory reakcí germinálních center a jeho požadavkem v imunosupresivní regulační T buňka generace, NFKBID reguluje homeostázu imunitního systému a má na ni další různé důsledky.[6] NFKBID dále podstatně ovlivňuje B buňky a plazmatické buňky, pokud jde o jejich funkce a vývoj.[8]
Výraz NFKBID je přesně regulován. Po aktivaci NF-kB jsou atypické IκB indukovány transkripčním faktorem [7] Atypické IκB mohou zase regulovat transkripci NF-kB buď jako induktory, nebo jako inhibitory. Naproti tomu klasické proteiny mohou potlačovat pouze transkripci NF-kB.[6]Ve zralých T buňkách (CD4 +) Receptor T buněk Stimulace (TCR) může vyvolat expresi NFKBID, zatímco v makrofágy, Ligandy TLR přijměte tento úkol.[9][10]
Aby ovlivnil transkripci genů, NFKBID má některé interakční proteinové partnery. Bylo oznámeno, že NFKBID interaguje s p50, což je podjednotka NF-κB, p52, p65, RelB, a c-Rel. NFKBID váže tyto proteiny pouze v jádře, s výjimkou p50, který může být vázán jak v cytoplazmě, tak v jádře [11][12]Vědci naznačují, že kromě toho může NFKBID také interagovat s homo- a heterodimery sestávajícími z některých z těchto podjednotek, např. p50 / p50 a p65 / p50.[13] V závislosti na cílovém genu a na tom, na který protein se váže NFKBID, může fungovat jako represor i aktivátor.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167604 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036931 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ "Entrez Gene: Nukleární faktor zesilovače genu pro polypeptid lehkého polypeptidu kappa v inhibitoru B-buněk, delta".
- ^ A b C Schuster M, Annemann M, Plaza-Sirvent C, Schmitz I (2013). „Atypické proteiny IκB - nukleární modulátory signalizace NF-κB“. Signál mobilní komunikace. 11 (1): 23. doi:10.1186 / 1478-811X-11-23. PMC 3639191. PMID 23578005.
- ^ A b Chiba T, Inoko H, Kimura M, Sato T (2013). "Role jaderných IκB v regulaci zánětu". Koncepty biomolu. 4 (2): 187–96. doi:10.1515 / bmc-2012-0039. PMID 25436575. S2CID 4544736.
- ^ Touma M, Keskin DB, Shiroki F, Saito I, Koyasu S, Reinherz EL, Clayton LK (2011). „Zhoršený vývoj a funkce B buněk při absenci IkappaBNS“. J. Immunol. 187 (8): 3942–52. doi:10,4049 / jimmunol. 1002109. PMC 3348541. PMID 21900180.
- ^ Schuster M, Glauben R, Plaza-Sirvent C, Schreiber L, Annemann M, Floess S, Kühl AA, Clayton LK, Sparwasser T, Schulze-Osthoff K, Pfeffer K, Huehn J, Siegmund B, Schmitz I (2012). „Protein IκB (NS) zprostředkovává vývoj regulačních T buněk indukcí transkripčního faktoru Foxp3“. Imunita. 37 (6): 998–1008. doi:10.1016 / j.immuni.2012.08.023. PMID 23200824.
- ^ Kuwata H, Matsumoto M, Atarashi K, Morishita H, Hirotani T, Koga R, Takeda K (2006). „IkappaBNS inhibuje indukci podskupiny genů závislých na Toll receptorech a omezuje zánět.“ Imunita. 24 (1): 41–51. doi:10.1016 / j.immuni.2005.11.004. PMID 16413922.
- ^ Hirotani T, Lee PY, Kuwata H, Yamamoto M, Matsumoto M, Kawase I, Akira S, Takeda K (2005). „Jaderný protein IkappaB IkappaBNS selektivně inhibuje produkci IL-6 indukovanou lipopolysacharidem v makrofázích lamina propria tlustého střeva“. J. Immunol. 174 (6): 3650–7. doi:10,4049 / jimmunol.174.6.3650. PMID 15749903.
- ^ Fiorini E, Schmitz I, Marissen WE, Osborn SL, Touma M, Sasada T, Reche PA, Tibaldi EV, Hussey RE, Kruisbeek AM, Reinherz EL, Clayton LK (2002). „Peptidem indukovaná negativní selekce thymocytů aktivuje transkripci inhibitoru NF-kappa B“. Mol. Buňka. 9 (3): 637–48. doi:10.1016 / s1097-2765 (02) 00469-0. PMID 11931770.
- ^ A b Manavalan B, Basith S, Choi YM, Lee G, Choi S (2010). „Vztah mezi strukturou a funkcí cytoplazmatických a jaderných proteinů IκB: analýza in silico“. PLOS ONE. 5 (12): e15782. doi:10.1371 / journal.pone.0015782. PMC 3009747. PMID 21203422.