NDUFA10 - NDUFA10

NDUFA10
Identifikátory
AliasyNDUFA10, CI-42KD, CI-42k, NADH: podjednotka ubichinon oxidoreduktázy A10, MC1DN22
Externí IDOMIM: 603835 MGI: 1914523 HomoloGene: 15342 Genové karty: NDUFA10
Umístění genu (člověk)
Chromozom 2 (lidský)
Chr.Chromozom 2 (lidský)[1]
Chromozom 2 (lidský)
Genomické umístění pro NDUFA10
Genomické umístění pro NDUFA10
Kapela2q37.3Start239,892,450 bp[1]
Konec240,025,345 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE NDUFA10 217860 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

4705

67273

Ensembl

ENSG00000130414

ENSMUSG00000026260

UniProt

O95299

Q99LC3

RefSeq (mRNA)

NM_004544
NM_001322019
NM_001322020

NM_024197

RefSeq (protein)

NP_001308948
NP_001308949
NP_004535

NP_077159

Místo (UCSC)Chr 2: 239,89 - 240,03 Mbn / a
PubMed Vyhledávání[2][3]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 subkomplexní podjednotka alfa 10 je enzym že u lidí je kódován NDUFA10 gen.[4][5] Protein NDUFA10 je podjednotkou NADH dehydrogenáza (ubichinon), který se nachází v mitochondriální vnitřní membrána a je největším z pěti komplexů elektronový transportní řetězec.[6][7] Mutace v podjednotkách NADH dehydrogenázy (ubichinon), také známé jako Komplex I. často vedou ke komplexním neurodegenerativním onemocněním, jako je Leighův syndrom.[4] Dále snížené hladiny exprese NDUFA10 v důsledku FOXM1 - zaměřená hypermethylace je spojena s člověkem spinocelulární karcinom a mohou souviset s jinými formami rakoviny.[8]

Struktura

Gen NDUFA10 je umístěn na q rameni chromozom 2 na pozici 37,3 a pokrývá 68 031 párů bází.[4] Tento gen produkuje 41 kDa protein složený z 355 aminokyseliny.[9][10] NDUFA10 je podjednotka enzymu NADH dehydrogenáza (ubichinon), největší z dýchacích komplexů. Konstrukce je ve tvaru L s dlouhou, hydrofobní transmembránový doména a hydrofilní doména pro periferní rameno, která zahrnuje všechna známá redoxní centra a vazebné místo NADH.[6] Bylo poznamenáno, že N-terminál hydrofobní doména má potenciál být složena do alfa šroubovice přes vnitřní mitochondriální membrána s C-terminál hydrofilní doména interagující s globulárními podjednotkami komplexu I. Vysoce konzervovaný dvoudoménová struktura naznačuje, že tato vlastnost je zásadní pro funkci proteinu a že hydrofobní doména působí jako kotva pro NADH dehydrogenáza (ubichinon) komplex na vnitřní mitochondriální membráně. NDUFA10 je jednou z přibližně 31 hydrofobních podjednotek, které tvoří transmembránovou oblast komplexu I, ale jedná se o doplňkovou podjednotku, o které se předpokládá, že se nepodílí na katalýze.[11] Předpovězeno sekundární struktura je primárně alfa šroubovice, ale karboxy-terminální polovina proteinu má vysoký potenciál přijmout formu stočené cívky. Aminoterminální část obsahuje domnělou beta vrstvu bohatou na hydrofobní aminokyseliny, která může sloužit jako mitochondriální importní signál.[4][7][12]

Funkce

Gen lidského NDUFA10 kóduje podjednotku Komplex I. z dýchací řetězec, který přenáší elektrony z NADH na ubichinon.[4] NADH váže se na komplex I a přenáší dva elektrony na isoalloxazinový kruh z flavin mononukleotid (FMN) protetické rameno k vytvoření FMNH2. Elektrony jsou přenášeny řadou klastry železo-síra (Fe-S) v protetické paži a nakonec do koenzym Q10 (CoQ), který je snížen na ubichinol (CoQH2). Tok elektronů mění redoxní stav proteinu, což vede ke konformační změně a strK. posun ionizovatelného postranního řetězce, který odčerpává čtyři ionty vodíku z mitochondriální matice.[6]

Klinický význam

NDUFA10 prokázal významně sníženou hladinu exprese mRNA u člověka spinocelulární karcinom, kvůli FOXM1 -indukovaná hypermethylace. FOXM1 je známý onkogen, který se podílí na všech typech rakoviny u lidí. Funguje inhibicí supresor nádoru geny prostřednictvím hypermethylace promotoru, mimo jiné mechanismy.[8] Mutace v NDUFA10 byly také spojeny s Leighova choroba vyplývající z komplexního deficitu I.[13]

Interakce

Ukázalo se, že NDUFA10 má 56 binárních souborů interakce protein-protein včetně 55 společných interakcí. Zdá se, že NDUFA10 interaguje RAB8A.[14]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130414 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  3. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ A b C d E "Entrez Gene: NDUFA10 NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 alfa subkomplex, 10".
  5. ^ Loeffen JL, Triepels RH, van den Heuvel LP, Schuelke M, Buskens CA, Smeets RJ, Trijbels JM, Smeitink JA (prosinec 1998). "cDNA osmi nukleárních kódovaných podjednotek NADH: ubichinon oxidoreduktáza: charakterizace cDNA lidského komplexu dokončena". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 253 (2): 415–22. doi:10.1006 / bbrc.1998.9786. PMID  9878551.
  6. ^ A b C Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). „Kapitola 18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN  978-0-470-54784-7.
  7. ^ A b Emahazion T, Beskow A, Gyllensten U, Brookes AJ (listopad 1998). "Intronové radiační hybridní mapování 15 komplexních I genů řetězce transportu lidských elektronů". Cytogenetika a genetika buněk. 82 (1–2): 115–9. doi:10.1159/000015082. PMID  9763677. S2CID  46818955.
  8. ^ A b Teh MT, Gemenetzidis E, Patel D, Tariq R, Nadir A, Bahta AW, Waseem A, Hutchison IL (2012). „FOXM1 indukuje globální methylační podpis, který napodobuje rakovinový epigenom v karcinomu dlaždicových buněk hlavy a krku“. PLOS ONE. 7 (3): e34329. doi:10.1371 / journal.pone.0034329. PMC  3312909. PMID  22461910.
  9. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  10. ^ „NDUFA10 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 podkomplexní podjednotka 10“. Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).
  11. ^ „NDUFA10 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 podkomplexní podjednotka 10“. UniProt.org. Konsorcium UniProt.
  12. ^ Ton C, Hwang DM, Dempsey AA, Liew CC (prosinec 1997). "Identifikace a primární struktura pěti lidských podjednotek NADH-ubichinon oxidoreduktázy". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 241 (2): 589–94. doi:10.1006 / bbrc.1997.7707. PMID  9425316.
  13. ^ Hoefs SJ, van Spronsen FJ, Lenssen EW, Nijtmans LG, Rodenburg RJ, Smeitink JA, van den Heuvel LP (březen 2011). „Mutace NDUFA10 způsobují u pacienta s Leighovou chorobou komplexní deficit I.“. European Journal of Human Genetics. 19 (3): 270–4. doi:10.1038 / ejhg.2010.204. PMC  3061993. PMID  21150889.
  14. ^ „Bylo nalezeno 56 binárních interakcí pro hledaný výraz NDUFA10“. Databáze molekulárních interakcí IntAct. EMBL-EBI. Citováno 2018-08-25.

Další čtení

  • Smeitink J, van den Heuvel L (červen 1999). "Lidský mitochondriální komplex I ve zdraví a nemoci". American Journal of Human Genetics. 64 (6): 1505–10. doi:10.1086/302432. PMC  1377894. PMID  10330338.
  • Ma J, Dempsey AA, Stamatiou D, Marshall KW, Liew CC (březen 2007). "Identifikace vzorců exprese genu leukocytů spojená s hladinami lipidů v plazmě u lidských subjektů". Ateroskleróza. 191 (1): 63–72. doi:10.1016 / j.atheroskleróza.2006.05.032. PMID  16806233.
  • Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (květen 2003). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Přírodní biotechnologie. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
  • Baens M, Chaffanet M, Aerssens J, Cassiman JJ, Marynen P (květen 1994). „Přiřazení genu pro lidský proliferující buněčný nukleolární protein P120 (NOL1) k chromozomu 12p13 fluorescenční in situ hybridizací a polymerázovou řetězovou reakcí s hybridy somatických buněk“. Genomika. 21 (1): 296–7. doi:10.1006 / geno.1994.1267. PMID  8088812.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.