RAB8A - RAB8A

RAB8A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3QBT, 3TNF, 4 LHV, 4LHW, 4LHX, 4LHY, 4 LHZ, 4LI0
Identifikátory
Aliasy	RAB8A, MEL, RAB8, člen rodiny onkogenů RAS
Externí ID	OMIM: 165040 MGI: 96960 HomoloGene: 100934 Genové karty: RAB8A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	16,134,234 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba na HDP; • Vazba GTP; • Vazba Rab GTPázy; • vazba myosinu V; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba protein kinázy; • Aktivita GTPázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • ciliární bazální tělo; • recyklace endosomu; • cytosol; • endozom; • centrosome; • membrána fagocytických vezikul; • Golgiho aparát; • buněčná projekce; • membrána; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • synaptický váček; • Golgiho membrána; • cilium; • řasnatá základna; • tělo neuronových buněk; • dendrit; • fagocytární váček; • centriole; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • cytoplazmatický váček; • extracelulární matrix; • buněčná membrána; • trans-Golgiho síťový transportní váček; • trans-Golgiho síťová membrána; • dendritická páteř; • recyklace endosomové membrány; • nepohyblivé cilium; • sekreční granulovaná membrána; • střední část těla; • synapse; • glutamátergická synapse;
Biologický proces	• regulace dlouhodobé neuronální synaptické plasticity; • regulace transportu bílkovin; • axonogeneze; • dokování vezikul zapojené do exocytózy; • sekrece bílkovin; • regulace lokalizace proteinů; • organizace projekce buněk; • G2 / M přechod mitotického buněčného cyklu; • Fúze Golgiho váčku do cílové membrány; • transport bílkovin; • lokalizace proteinu na plazmatickou membránu; • buněčná odpověď na inzulínový stimul; • cilium morfogeneze; • dokování řasnatého bazálního těla; • transport neurotransmiterového receptoru na postsynaptickou membránu; • regulace autofagie; • autofagie; • posttranslační modifikace; • regulace exocytózy; • doprava; • transport intracelulárních proteinů; • Rab proteinová signální transdukce; • transport neurotransmiterového receptoru, endosom na postsynaptickou membránu; • transport zprostředkovaný vezikuly v synapse;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4218
	17274
	ENSG00000167461
	ENSMUSG00000003037
	P61006
	P55258
	NM_005370
	NM_023126
	NP_005361; NP_005361.2
	NP_075615
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein související s Ras Rab-8A je protein že u lidí je kódován RAB8A gen.^[4]^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem nadrodiny RAS, což jsou malé proteiny vázající GTP / GDP s průměrnou velikostí 200 aminokyselin. RAS příbuzné proteiny rodiny RAB / YPT mohou hrát roli v transportu proteinů z endoplazmatického retikula do Golgiho a plazmatické membrány. Tento protein má 97%, 96% a 51% podobnost s psími proteiny RAB8, myší MEL a myší YPT1 a obsahuje 4 vazebná místa pro GTP / GDP, která jsou přítomna ve všech proteinech RAS. Předpokládané efektorové vazebné místo tohoto proteinu je podobné jako u RAB / YPT proteinů. Tento protein však obsahuje C-koncový motiv CAAX, který je charakteristický pro mnoho členů nadrodiny RAS, ale který se nenachází v YPT1 a ve většině proteinů RAB. Ačkoli byl tento gen izolován jako transformující gen z buněčné linie melanomu, nebyla prokázána žádná vazba mezi MEL a maligním melanomem. Tento onkogen se nachází 800 kb distálně od MY09B na chromozomu 19p13.1.^[6]

Interakce

RAB8A bylo prokázáno komunikovat s Optineurin^[7] a MAP4K2.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167461 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nimmo ER, Sanders PG, Padua RA, Hughes D, Williamson R, Johnson KJ (srpen 1991). „Gen MEL: nový člen třídy RAB / YPT genů souvisejících s RAS“. Onkogen. 6 (8): 1347–51. PMID 1886711.
^ Huber LA, Pimplikar S, Parton RG, Virta H, Zerial M, Simons K (říjen 1993). „Rab8, malá GTPáza zapojená do vezikulárního přenosu mezi TGN a bazolaterální plazmatickou membránou“. The Journal of Cell Biology. 123 (1): 35–45. doi:10.1083 / jcb.123.1.35. PMC 2119815. PMID 8408203.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RAB8A RAB8A, člen RAS onkogenní rodiny“.
^ Hattula K, Peränen J (2000). „FIP-2, protein ve svinuté cívce, spojuje Huntingtin s Rab8 a moduluje buněčnou morfogenezi“. Aktuální biologie. 10 (24): 1603–6. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 00864-2. PMID 11137014. S2CID 12836037.
^ Ren M, Zeng J, De Lemos-Chiarandini C, Rosenfeld M, Adesnik M, Sabatini DD (květen 1996). „Ve své aktivní formě interaguje protein GTP vázající GTP se stresově aktivovanou proteinkinázou“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (10): 5151–5. doi:10.1073 / pnas.93.10.5151. PMC 39423. PMID 8643544.

Další čtení

Newport J, Roemer MI (březen 1975). "Srovnávací perinatální úmrtnost v základech lékařské péče a dalších modelech porodu". Poptávka. 12 (1): 10–7. PMID 123217.
Nimmo E, Padova RA, Hughes D, Brook JD, Williamson R, Johnson KJ (březen 1989). "Potvrzení a upřesnění lokalizace lokusu c-MEL na chromozomu 19 fyzickým a genetickým mapováním". Genetika člověka. 81 (4): 382–4. doi:10.1007 / BF00283697. PMID 2564840. S2CID 25002878.
Zahraoui A, Joberty G, Arpin M, Fontaine JJ, Hellio R, Tavitian A, Louvard D (leden 1994). „Malá rab GTPáza je distribuována v cytoplazmatických váčcích v nepolarizovaných buňkách, ale kolokalizuje se značkou těsného spojení ZO-1 v polarizovaných epitelových buňkách“. The Journal of Cell Biology. 124 (1–2): 101–15. doi:10.1083 / jcb.124.1.101. PMC 2119893. PMID 8294494.
Joberty G, Tavitian A, Zahraoui A (září 1993). "Isoprenylace Rab proteinů majících C-koncový CaaX motiv". FEBS Dopisy. 330 (3): 323–8. doi:10.1016/0014-5793(93)80897-4. PMID 8375503. S2CID 29047580.
Ren M, Zeng J, De Lemos-Chiarandini C, Rosenfeld M, Adesnik M, Sabatini DD (květen 1996). „Ve své aktivní formě interaguje protein GTP vázající GTP se stresově aktivovanou proteinkinázou“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (10): 5151–5. doi:10.1073 / pnas.93.10.5151. PMC 39423. PMID 8643544.
Bähler M, Kehrer I, Gordon L, Stoffler HE, Olsen AS (červenec 1997). „Fyzické mapování lidského myosinu-IXB (MYO9B), lidského ortologu krysího myosinu myr 5, na chromozom 19p13.1“. Genomika. 43 (1): 107–9. doi:10.1006 / geno.1997.4776. PMID 9226381.
Wilson AL, Erdman RA, Castellano F, Maltese WA (srpen 1998). "Prenylace GTPázy Rab8 geranylgeranyl transferázami typu I a typu II". The Biochemical Journal. 333 (Pt 3): 497–504. doi:10.1042 / bj3330497. PMC 1219609. PMID 9677305.
Bao S, Zhu J, Garvey WT (listopad 1998). „Klonování Rab GTPáz exprimovaných v lidském kosterním svalu: studie u subjektů rezistentních na inzulín“. Hormonální a metabolický výzkum = Hormon- und Stoffwechselforschung = Hormony a metabolismus. 30 (11): 656–62. doi:10.1055 / s-2007-978953. PMID 9918381.
Shisheva A, Chinni SR, DeMarco C (září 1999). „Obecná role inhibitoru disociace GDP 2 v membránovém uvolňování proteinů Rab: modulace jeho funkčních interakcí strukturálními modifikacemi in vitro a in vivo“. Biochemie. 38 (36): 11711–21. doi:10.1021 / bi990200r. PMID 10512627.
Hattula K, Peränen J (2001). „FIP-2, protein ve svinuté cívce, spojuje Huntingtin s Rab8 a moduluje buněčnou morfogenezi“. Aktuální biologie. 10 (24): 1603–6. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 00864-2. PMID 11137014. S2CID 12836037.
Kuroda TS, Fukuda M, Ariga H, Mikoshiba K (březen 2002). „Doména Slp homologie synaptotagminových proteinů 1-4 a Slac2 funguje jako nová vazebná doména Rab27A“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (11): 9212–8. doi:10,1074 / jbc.M112414200. PMID 11773082.
Hattula K, Furuhjelm J, Arffman A, Peränen J (září 2002). „Výměnný faktor GDP / GTP specifický pro Rab8 je zapojen do remodelace aktinu a transportu polarizované membrány“. Molekulární biologie buňky. 13 (9): 3268–80. doi:10,1091 / mbc.E02-03-0143. PMC 124888. PMID 12221131.
Fukuda M (duben 2003). "Zřetelná Rabova vazebná specificita pro Rim1, Rim2, rabphilin a Noc2. Identifikace kritického determinantu rozpoznávání Rab3A / Rab27A pomocí Rim2". The Journal of Biological Chemistry. 278 (17): 15373–80. doi:10,1074 / jbc.M212341200. PMID 12578829.
Lau AS, Mruk DD (duben 2003). „Rab8B GTPáza a dynamika spojení ve varlatech“. Endokrinologie. 144 (4): 1549–63. doi:10.1210 / cs.2002-220893. PMID 12639940.
Linder MD, Uronen RL, Hölttä-Vuori M, van der Sluijs P, Peränen J, Ikonen E (leden 2007). „Recyklace závislá na Rab8 podporuje odstranění endozomálního cholesterolu v normálních buňkách a buňkách sfingolipidózy“. Molekulární biologie buňky. 18 (1): 47–56. doi:10,1091 / mbc.E06-07-0575. PMC 1751315. PMID 17050734.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000167461 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1886711-4] Nimmo ER, Sanders PG, Padua RA, Hughes D, Williamson R, Johnson KJ (srpen 1991). „Gen MEL: nový člen třídy RAB / YPT genů souvisejících s RAS“. Onkogen. 6 (8): 1347–51. PMID 1886711.

[pmid8408203-5] Huber LA, Pimplikar S, Parton RG, Virta H, Zerial M, Simons K (říjen 1993). „Rab8, malá GTPáza zapojená do vezikulárního přenosu mezi TGN a bazolaterální plazmatickou membránou“. The Journal of Cell Biology. 123 (1): 35–45. doi:10.1083 / jcb.123.1.35. PMC 2119815. PMID 8408203.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: RAB8A RAB8A, člen RAS onkogenní rodiny“.

[pmid11137014-7] Hattula K, Peränen J (2000). „FIP-2, protein ve svinuté cívce, spojuje Huntingtin s Rab8 a moduluje buněčnou morfogenezi“. Aktuální biologie. 10 (24): 1603–6. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 00864-2. PMID 11137014. S2CID 12836037.

[pmid8643544-8] Ren M, Zeng J, De Lemos-Chiarandini C, Rosenfeld M, Adesnik M, Sabatini DD (květen 1996). „Ve své aktivní formě interaguje protein GTP vázající GTP se stresově aktivovanou proteinkinázou“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (10): 5151–5. doi:10.1073 / pnas.93.10.5151. PMC 39423. PMID 8643544.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]