Myomegalin - Myomegalin
Myomegalin, také známý jako protein interagující s fosfodiesterázou 4D nebo protein spojený s kardiomyopatií 2, je protein že u lidí je kódován PDE4DIP gen.[5][6][7] Má role v formace z mikrotubuly z centrosome.[8] Jeho název je odvozen od skutečnosti, že je vysoce vyjádřen v jednotkách tubular myofibrily známý jako sarkomery a je velkým proteinem s 2 324 aminokyselinami.[9] Poprvé byl charakterizován v roce 2000.[9]
Struktura a funkce
Myomegalin se většinou skládá z alfa-šroubovice a svinutá cívka struktur a má sdílené domény proteiny spojené s mikrotubuly.[9] Má několik izoformy, z nichž alespoň dvě byly charakterizovány, CM-MMG a EB-MMG.[8]
Myomegalin je nezbytný pro dostatečné množství růst z mikrotubuly z centrosomy. Izoforma CM-MMG se váže na centrosom s y-tubulin v AKAP9 -závislým způsobem a na blízké straně Golgiho aparát, zatímco izoforma EB-MMG se váže na MAPRE1 v Golgiho aparátu a zvyšuje účinky MAPRE1 na růst mikrotubulů.[8]
Myomegalin, konkrétně izoforma CM-MMG, je paralog z CDK5RAP2.[8][10][11] Deplece myomegalinu v buňkách nevede na rozdíl od deplece CDK5RAP2 ke snížení y-tubulinu nebo CDK5RAP2 a nezdá se, že by ovlivňovala mitóza prostřednictvím různých vřeteno vady kotvení a orientace, na rozdíl od CDK5RAP2. To naznačuje, že CDK5RAP2 může do jisté míry sloužit k vyrovnání nepřítomnosti myomegalinu. Buňky zbavené myomegalinu mají však pomaleji migrace, protože mikrotubuly jsou rozhodující pro motilitu buněk.[8]
Ortology myomegalinu jsou vidět v obratlovců tak daleko jako kostnatá ryba, asi před 450 miliony let. v savci přibližně před 200 miliony let získal myomegalin Olduvai doména. Domény Olduvai byly dosud nalezeny pouze jinde NBPF geny v placentární savci, z nichž mnohé sousedí s myomegalinem na chromozomu 1, předpokládá se tedy, že tyto geny pocházejí z duplikace myomegalinu.[12] Zvýšené duplikace domén NPBF Olduvai u lidí se podílejí na vývoji velikosti lidského mozku.[13]
Interakce
Bylo prokázáno, že myomegalin (PDE4DIP) komunikovat s PDE4D.[6]
Dějiny
Protein byl objeven v roce 2000 a byl tak pojmenován, protože byl vysoce exprimován u potkanů srdeční sval sarkomery (jednotky trubkové myofibrily ) a je to velký protein s 2 324 aminokyselinami.[9]
Viz také
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000178104 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038170 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Seki N, Ohira M, Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Nakajima D a kol. (Říjen 1997). "Charakterizace cDNA klonů v knihovnách cDNA s frakcionací podle velikosti z lidského mozku". Výzkum DNA. 4 (5): 345–9. doi:10.1093 / dnares / 4.5.345. PMID 9455484.
- ^ A b Verde I, Pahlke G, Salanova M, Zhang G, Wang S, Coletti D a kol. (Duben 2001). „Myomegalin je nový protein golgi / centrosomu, který interaguje s cyklickou nukleotidovou fosfodiesterázou“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (14): 11189–98. doi:10,1074 / jbc.M006546200. PMID 11134006.
- ^ „Entrez Gene: PDE4DIP fosfodiesteráza 4D interagující protein (myomegalin)“.
- ^ A b C d E Roubin R, Acquaviva C, Chevrier V, Sedjaï F, Zyss D, Birnbaum D, Rosnet O (únor 2013). „Myomegalin je nezbytný pro tvorbu centrosomálních a Golgiho derivovaných mikrotubulů“. Biologie otevřená. 2 (2): 238–50. doi:10.1242 / bio.20123392. PMC 3575658. PMID 23430395.
- ^ A b C d Verde I, Pahlke G, Salanova M, Zhang G, Wang S, Coletti D a kol. (Duben 2001). „Myomegalin je nový protein golgi / centrosomu, který interaguje s cyklickou nukleotidovou fosfodiesterázou“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (14): 11189–98. doi:10,1074 / jbc.M006546200. PMID 11134006.
- ^ Dumas L, Kim YH, Karimpour-Fard A, Cox M, Hopkins J, Pollack JR, Sikela JM (září 2007). „Variace počtu genových kopií trvající 60 milionů let vývoje člověka a primátů“. Výzkum genomu. 17 (9): 1266–77. doi:10,1101 / gr. 657307. PMC 1950895. PMID 17666543.
- ^ O'Bleness MS, Dickens CM, Dumas LJ, Kehrer-Sawatzki H, Wyckoff GJ, Sikela JM (září 2012). „Evoluční historie a organizace genomu proteinových domén DUF1220“. G3. 2 (9): 977–86. doi:10,1534 / g3,112.003061. PMC 3429928. PMID 22973535.
- ^ O'Bleness MS, Dickens CM, Dumas LJ, Kehrer-Sawatzki H, Wyckoff GJ, Sikela JM (září 2012). „Evoluční historie a organizace genomu proteinových domén DUF1220“. G3. 2 (9): 977–86. doi:10,1534 / g3,112.003061. PMC 3429928. PMID 22973535.
- ^ Sikela JM, van Roy F (2018). „Změna názvu domény NBPF / DUF1220 na doménu Olduvai“. F1000Výzkum. 6 (2185): 2185. doi:10.12688 / F1000Research.13586.1. PMC 5773923. PMID 29399325.
Další čtení
- Soejima H, Kawamoto S, Akai J, Miyoshi O, Arai Y, Morohka T a kol. (Květen 2001). "Izolace nových genů specifických pro srdce pomocí databáze BodyMap". Genomika. 74 (1): 115–20. doi:10.1006 / geno.2001.6527. PMID 11374908.
- Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J a kol. (Září 2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Výzkum genomu. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R a kol. (Leden 2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF a kol. (Květen 2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569.
- Shimada H, Kuboshima M, Shiratori T, Nabeya Y, Takeuchi A, Takagi H a kol. (Leden 2007). "Protilátky proti myomegalinu v séru u pacientů s karcinomem dlaždicových buněk jícnu". International Journal of Oncology. 30 (1): 97–103. doi:10,3892 / ijo.30.1.97. PMID 17143517.