MethBase - MethBase
 | |
|---|---|
| Obsah | |
| Popis | Databáze pro jednotlivce cytosin rozlišení Methylace DNA data a související poznámky. |
| Organismy | Člověk Šimpanz Gorila Makak Rhesus Myš Arabidopsis |
| Kontakt | |
| Laboratoř | Andrew D. Smith |
| Primární citace | Qiang Song a kol. (2013) [1] |
| Datum vydání | 2013 |
| Přístup | |
| Datový formát | Trackhub na UCSC Genome Browser |
| webová stránka | http://smithlabresearch.org/software/methbase/ |
MethBase je databáze Methylace DNA data odvozená z sekvenování nové generace data.[1] MethBase poskytuje vizualizaci veřejně dostupných bisulfitové sekvenování a snížené zastoupení bisulfitového sekvenování experimenty prostřednictvím UCSC Genome Browser. Obsah MethBase zahrnuje single-CpG stránky úrovně methylace rozlišení pro každý CpG web v genom zájmu, anotace oblastí hypomethylace často spojených s promotory genů a anotace alela -specifická methylace spojená s genomový otisk.
Viz také
Reference
- ^ A b Song, Qiang; Decato Benjamin E; Hong Elizabeth; Zhou Meng; Fang Fang; Qu Jianghan; Garvin Tyler; Kessler Michael; Zhou Jun; Smith Andrew D (prosinec 2013). „Referenční databáze methylomu a analytický kanál k usnadnění integrační a srovnávací epigenomiky“. PLOS ONE. 8 (12): e81148. Bibcode:2013PLoSO ... 881148S. doi:10.1371 / journal.pone.0081148. PMC 3855694. PMID 24324667.
externí odkazy
 | Tento Biologická databáze související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |