La doména - La domain
| La doména | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 struktura řešení la domény proteinu vázajícího c-mpl | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Los Angeles | ||||||||
| Pfam | PF05383 | ||||||||
| InterPro | IPR006630 | ||||||||
| CHYTRÝ | TSPN | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00280 | ||||||||
| MEROPS | I75 | ||||||||
| SCOP2 | 2 mil / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 1.B.3 | ||||||||
| CDD | cd07323 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se La doména je konzervovaný proteinová doména.
Člověk 60 kDa SS-A / Ro ribonukleoproteiny (RNP) se skládají z jedné ze čtyř malých Y RNA a alespoň dva bílkoviny, Ro60 a Los Angeles. La protein je 47 kDa polypeptid který často funguje jako autoantigen v systémový lupus erythematodes a Sjögrenův syndrom.[1] V jádro, La působí jako RNA polymeráza III (RNAP III) transkripční faktor, zatímco v cytoplazma, La působí jako překlad faktor.[2] V jádru La váže do 3'UTR rodícího se RNAP III přepisy pomáhat při skládání a zrání.[3] V cytoplazmě La rozpoznává specifické třídy mRNA které obsahují a 5'-terminál oligopyrimidinový (5'TOP) motiv, o kterém je známo, že kontroluje proteosyntéza.[4] Specifické uznání zprostředkovává N-terminál doména La, která obsahuje La motiv a RNA rozpoznávací motiv (RRM). La motiv přijímá alfa / beta složit který zahrnuje a okřídlená spirála motiv.[5]
Homologní La obsahující doménu bílkoviny byly identifikovány v široké škále organismy až na Archaea, bakterie a viry.[6]
Reference
- ^ Izumi RE, Das S, Barat B, Raychaudhuri S, Dasgupta A (duben 2004). „Peptid z autoantigenu La blokuje překlad nezávislý na polioviru a viru hepatitidy C a odhaluje jediný tyrosin kritický pro vazbu La RNA a stimulaci translace“. J. Virol. 78 (7): 3763–76. doi:10.1128 / jvi.78.7.3763-3776.2004. PMC 371053. PMID 15016896.
- ^ Intine RV, Tenenbaum SA, Sakulich AL, Keene JD, Maraia RJ (listopad 2003). „Diferenciální fosforylace a subcelulární lokalizace La RNP spojených s prekurzorovými tRNA a translační mRNA“. Mol. Buňka. 12 (5): 1301–7. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00429-5. PMID 14636586.
- ^ Alfano C, Sanfelice D, Babon J, Kelly G, Jacks A, Curry S, Conté MR (duben 2004). "Strukturní analýza kooperativní vazby RNA La motivem a centrální RRM doménou lidského La proteinu". Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (4): 323–9. doi:10.1038 / nsmb747. PMID 15004549. S2CID 24034320.
- ^ Keene JD (prosinec 2003). "Posttranskripční generace makromolekulárních komplexů". Mol. Buňka. 12 (6): 1347–9. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00496-9. PMID 14690589.
- ^ Kenan DJ, Keene JD (duben 2004). „La dostane svá křídla“. Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (4): 303–5. doi:10.1038 / nsmb0404-303. PMID 15048103. S2CID 8623162.
- ^ Lin-Marq N, Clarkson SG (leden 1995). "Kvasinkový RNA vázající protein, který se podobá lidskému autoantigenu La". J. Mol. Biol. 245 (2): 81–5. doi:10.1006 / jmbi.1994.0008. PMID 7799435.