LEKTI - LEKTI

SPINK5
Protein SPINK5 PDB 1h0z.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasySPINK5, LEKTI, LETKI, NETS, NS, VAKTI, inhibitor serinové peptidázy, Kazal typu 5, inhibitor serinové peptidázy Kazal typu 5
Externí IDOMIM: 605010 MGI: 1919682 HomoloGene: 4987 Genové karty: SPINK5
Umístění genu (člověk)
Chromozom 5 (lidský)
Chr.Chromozom 5 (lidský)[1]
Chromozom 5 (lidský)
Genomické umístění pro SPINK5
Genomické umístění pro SPINK5
Kapela5q32Start148,025,683 bp[1]
Konec148,137,289 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE SPINK5 205185 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001127698
NM_001127699
NM_006846

NM_001081180

RefSeq (protein)

NP_001121170
NP_001121171
NP_006837

NP_001074649

Místo (UCSC)Chr 5: 148,03 - 148,14 MbChr 18: 43,96 - 44,02 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Lymphoepiteliální inhibitor související s kazalským typem (LEKTI) také známý jako inhibitor serinové proteázy Kazal typu 5 (SPINK5) je a protein že u lidí je kódován SPINK5 gen.[5][6]

Struktura a funkce

LEKTI je velká multidoména serinová proteáza inhibitor exprimován ve stratifikované epiteliální tkáni. Skládá se z 15 domén, které jsou proteázou štěpeny na menší, funkční fragmenty furin. Pouze dvě z těchto domén (2 a 15) obsahují 6 rovnoměrně rozmístěných cysteiny zodpovědný za 3 intramolekulární disulfidové vazby charakteristické pro Inhibitory související s kazalským typem. Zbývající domény obsahují 4 cysteiny.[7] Tyto disulfidové vazby nutí molekulu do rigidní konformace, která umožňuje proteinu interagovat s cílovou proteázou prostřednictvím prodlouženého beta-list. Všechny domény (kromě 1, 2 a 15) obsahují doménu arginin na P1, což naznačuje, že pravděpodobnými cíli jsou proteázy podobné trypsinu.[7]

V epidermis je LEKTI zapojen do regulace deskvamace prostřednictvím své schopnosti selektivně inhibovat KLK5, KLK7 a KLK14.[8] Rekombinantní celá délka LEKTI inhibuje exogenní serinové proteázy trypsin, plasmin, subtilisin A, katepsin G. a lidský neutrofil elastáza.[9]

LEKTI může hrát roli v morfogenezi kůže a vlasů a protizánětlivé a / nebo antimikrobiální ochraně slizničních epitelů.[6]

Gen

SPINK5 je členem klastru genové rodiny umístěného na chromozomu 5q32,[10] které kódují inhibitory serinových proteáz. To zahrnuje další epidermální proteiny SPINK6 a LEKTI-2 (SPINK9). The SPINK5 gen má délku 61 kb a obsahuje 33 exonů.[7] Alternativní zpracování SPINK5 vede k tvorbě tří různých genových produktů, které byly identifikovány v diferencovaných keratinocytech.[11]

Klinický význam

Výsledkem jsou mutace v genu SPINK5 Nethertonův syndrom porucha charakterizovaná ichtyóza a specifické defekty imunitního systému.[6]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000133710 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000055561 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Magert HJ, Standker L, Kreutzmann P, Zucht HD, Reinecke M, Sommerhoff CP, Fritz H, Forssmann WG (srpen 1999). „LEKTI, nový 15-doménový typ inhibitoru lidské serinové proteinázy“. J Biol Chem. 274 (31): 21499–502. doi:10.1074 / jbc.274.31.21499. PMID  10419450.
  6. ^ A b C „Entrez Gene: SPINK5 serin peptidase inhibitor, Kazal type 5“.
  7. ^ A b C Furio L, Hovnanian A (listopad 2011). „Když aktivita vyžaduje rozchod: LEKTI proteolytická aktivační kaskáda pro specifickou inhibici proteinů“. J Invest Dermatol. 131 (11): 2169–73. doi:10.1038 / jid.2011.295. PMID  21997416.
  8. ^ Deraison C, Bonnart C, Lopez F, Besson C, Robinson R, Jayakumar A, Wagberg F, Brattsand M, Hachem JP, Leonardsson G, Hovnanian A (září 2007). „Fragmenty LEKTI specificky inhibují KLK5, KLK7 a KLK14 a kontrolují deskvamaci prostřednictvím interakce závislé na pH“. Mol. Biol. Buňka. 18 (9): 3607–19. doi:10,1091 / mbc.E07-02-0124. PMC  1951746. PMID  17596512.
  9. ^ Mitsudo K, Jayakumar A, Henderson Y, Frederick MJ, Kang Y, Wang M, El-Naggar AK, Clayman GL (duben 2003). „Inhibice serinových proteináz plazminu, trypsinu, subtilisinu A, katepsinu G a elastázy pomocí LEKTI: kinetická analýza“. Biochemie. 42 (13): 3874–81. doi:10.1021 / bi027029v. PMID  12667078.
  10. ^ "SPINK5 inhibitor serinové peptidázy, Kazal typu 5 [Homo sapiens (člověk)] - gen - NCBI".
  11. ^ Tartaglia-Polcini A, Bonnart C, Micheloni A, Cianfarani F, Andrè A, Zambruno G, Hovnanian A, D'Alessio M (únor 2006). „SPINK5, defektní gen v nethertonově syndromu, kóduje více izoforem LEKTI odvozených z alternativního zpracování pre-mRNA“. J Invest Dermatol. 126 (2): 315–24. doi:10.1038 / sj.jid.5700015. PMID  16374478.

Další čtení

externí odkazy

  • Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9NQ38 (Inhibitor serinové proteázy Kazal typu 5) na PDBe-KB.