Mezinárodní konsorcium pro rakovinový genom - International Cancer Genome Consortium

The Mezinárodní konsorcium pro rakovinový genom (ICGC) je dobrovolná vědecká organizace, která poskytuje fórum pro spolupráci mezi předními světovými výzkumníky rakoviny a genomů. ICGC byla zahájena v roce 2008 za účelem koordinace ve velkém měřítku studie genomu rakoviny v nádorech z 50 typů a / nebo podtypů rakoviny, které mají po celém světě hlavní význam.

Systematické studie o více než 25 000 genomech rakoviny na genomický, epigenomický a transkriptomický Úrovně odhalí repertoár onkogenních mutací, odhalí stopy mutagenních vlivů, definují klinicky relevantní podtypy pro prognózu a terapeutické řízení a umožní vývoj nových terapií rakoviny.[1]

ICGC zahrnuje data z Atlas rakovinového genomu (TCGA) a projekt genomu rakoviny Sanger.

Profesor Andrew Biankin AO, profesor Regius a ředitel Centra pro výzkum rakoviny Wolfson Wohl na University of Glasgow je výkonným ředitelem a předsedou od roku 2018.[2]

Cíle

ICGC je jedním z nejambicióznějších pokusů o biomedicínský výzkum od doby, kdy Projekt lidského genomu. Konsorcium pomůže koordinovat současné a budoucí rozsáhlé projekty s cílem porozumět genomickým změnám v rakovině globálního významu. Katalogy vytvořené členy ICGC budou rychle a volně dostupné kvalifikovaným výzkumným pracovníkům, což vědcům z celého světa umožní využívat nové informace k vývoji lepších způsobů diagnostiky, léčby a prevence mnoha typů rakoviny.

Cílem ICGC je poskytnout komplexní popis somatických (nezděděných) genomových abnormalit přítomných v široké škále lidských nádorů. Vzhledem k našim současným znalostem o heterogenitě typů a podtypů nádorů si ICGC stanovila cíl koordinovat přibližně 50 projektů, z nichž každý bude generovat genomické analýzy na přibližně 500 vzorcích rakoviny každé třídy. Je však dobře známo, že rakovina je vysoce heterogenní a lze definovat stovky typů / podtypů. Stanovený cíl 50 projektů ICGC proto není zamýšlen a nemůže vyčerpávajícím způsobem pokrýt celé spektrum typů rakoviny.

Členové ICGC Funding and Research, kteří navrhují projekt, musí souhlasit s politikami ICGC, které zahrnují požadavky na rychlé vydání dat, přísné standardy kvality a ochranu účastníků studie.

Úplný seznam cílů, struktury, zásad a pokynů ICGC je k dispozici na adrese http://icgc.org/

Struktura a financování

ICGC je financována zúčastněnými zeměmi, z nichž každá se zaměřuje na jednu nebo více forem rakoviny, s cílem zmapovat genomy nejméně 50 typů rakoviny.[3] Sekretariát konsorcia je u Ontario Institute for Cancer Research v Toronto, Kanada,[4] která bude rovněž provozovat datové koordinační centrum. Provinční Vláda Ontaria poskytl financování ve výši 40 milionů USD a očekává se, že každý účastnící se člen financování přispěje 20 milionů USD na každý projekt. V roce 2009 Německá rakovinová pomoc podpořila jeden projekt ICGC částkou 7,9 milionu EUR. Jednalo se o nejvyšší částku, kterou soukromá organizace poskytla. Peníze jsou darovány Němci.

Členství v ICGC je otevřené všem subjektům, které souhlasí s dodržováním jeho zásad a pokynů. ICGC obdržela od financujících organizací v Asii, Austrálii, Evropě a Severní Americe závazky pro 47 projektových týmů v 15 jurisdikcích studovat více než 21 000 nádorových genomů. Projekty, které jsou v současné době financovány, zkoumají nádory ovlivňující močový měchýř, krev, kosti, mozek, prsa, děložní hrdlo, tlusté střevo, hlavu a krk, ledviny, játra, plíce, ústní dutinu, vaječníky, slinivku břišní, prostatu, konečník, kůži, měkké tkáně, žaludek, štítná žláza a děloha. V průběhu času se očekává, že se k ICGC připojí další národy a organizace. Genomické analýzy nádorů prováděné členy ICGC v Austrálii a Kanadě (rakovina pankreatu), Číně (rakovina žaludku), Francii (rakovina jater), Německu (rakovina mozku), Japonsku (rakovina jater), Španělsku (rakovina krve), Velké Británii (rakovina krve, prsu, plic a kůže) a USA (rakovina krve, mozku, prsu, tlustého střeva, ledvin, plic, vaječníků, konečníku, žaludku a dělohy) jsou nyní k dispozici prostřednictvím datového koordinačního centra umístěného na webových stránkách ICGC na adrese http://www.icgc.org. Sady dat lze procházet a lze je stáhnout na https://dcc.icgc.org/.

Členové výkonného výboru

Zástupci se statusem pozorovatele:

Aktuální výzkumné projekty

Každá zúčastněná země má jako primární výzkumný cíl konkrétní typ nádoru:[5]

Budoucí práce

ICGCmed

V kontextu obrovského mezinárodního úsilí o sekvenování a v očekávání nové éry přesné medicíny The Mezinárodní konsorcium pro rakovinový genom pro medicínu (ICGCmed) propojí bohatství již shromážděných genomických dat i nové generované genomové údaje s klinickými a zdravotními informacemi, včetně životního stylu, anamnézy pacientů, diagnostických údajů o rakovině a reakcí a přežití po terapiích napříč rakovinou spektrum. S využitím těchto rozsáhlých integrovaných údajů budou vědci, vědci, tvůrci politik a kliničtí lékaři schopni spolupracovat s pacienty, poskytovateli zdravotní péče a dalšími na vývoji preventivních strategií, markerů pro včasné odhalení onemocnění, konkrétnějších kritérií a metod pro diagnózy a prognózy a intervence založené na porovnání molekulárního podtypu nemoci pacienta s nejúčinnějšími kombinacemi terapií.

To povede k objevení nových terapeutických cílů, přesnějších definic onemocnění a zlepšených strategií prevence rezistence na léky.

Viz také

Reference

  1. ^ Hudson TJ a kol. (Duben 2010). „Mezinárodní síť projektů genomu rakoviny“. Příroda. 464: 993–8. doi:10.1038 / nature08987. PMC  2902243. PMID  20393554.
  2. ^ „Oznámení ICGC na domovské stránce 16. května 2018“.
  3. ^ „Vědci tvoří mezinárodní konsorcium pro genom proti rakovině“. Národní institut zdraví. 2008-04-29. Citováno 2008-04-29.
  4. ^ Ogilvie, Megan (2008-04-29). „Konsorcium se sídlem v Torontu, které hledá genetický původ rakoviny“. Toronto Star. Citováno 2008-04-29.
  5. ^ Mezinárodní konsorcium pro genom pro rakovinu oznamuje zahájení 8 projektů na genom pro rakovinu
  6. ^ Oznámení australské národní rady pro zdraví a lékařský výzkum Archivováno 2009-03-23 ​​na Wayback Machine
  7. ^ Web projektu ICGC