IFRD1 - IFRD1
| IFRD1 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasy | IFRD1, PC4, TIS7, vývojový regulátor související s interferonem 1 | ||||||||||||||||||||||||
| Externí ID | OMIM: 603502 MGI: 1316717 HomoloGene: 31043 Genové karty: IFRD1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortology | |||||||||||||||||||||||||
| Druh | Člověk | Myš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNA) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (protein) | |||||||||||||||||||||||||
| Místo (UCSC) | Chr 7: 112,42 - 112,48 Mb | Chr 12: 40,2 - 40,25 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed Vyhledávání | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Regulátor vývoje související s interferony 1 je protein že u lidí je kódován IFRD1 gen.[5][6] Gen je exprimován většinou v neutrofily, kosterní a srdeční sval, mozek, slinivka břišní.[5][6]Krysí a myší homologní geny genu pro vývojový regulátor 1 souvisejícího s interferonem (a jejich proteiny) jsou také známé pod názvem PC4 [7] a Tis21. IFRD1 je členem rodiny genů, která zahrnuje druhý gen, IFRD2, také známý jako SKmc15.[5][6]
Klinický význam
IFRD1 byl identifikován jako modifikátor gen pro cystická fibróza plicní onemocnění. U lidí je funkce neutrofilního efektoru závislá na typu polymorfismu IRFD1 přítomném u jednotlivce. Údaje o lidech i myších naznačují, že IFRD1 má značný dopad na patogenezi cystické fibrózy regulací efektorové funkce neutrofilů. [8]
Induktor regenerace svalů
IFRD1 (také známý jako PC4 nebo Tis7, viz výše) se účastní procesu diferenciace buněk kosterního svalstva. Ve skutečnosti inhibice funkce IFRD1 v myoblastech C2C12 antisense transfekcí cFRNA IFRD1 nebo mikroinjekcí anti-IFRD1 protilátek zabraňuje jejich morfologické a biochemické diferenciaci inhibicí exprese MyoD a myogenin, klíčové hlavní geny vývoje svalů.[9] Role IFRD1 ve svalové diferenciaci byla pozorována také in vivo. Svaly myší, kterým chyběl IFRD1, vykazovaly snížené hladiny proteinů a mRNA MyoD a myogeninu a po poškození svalovou srážkou u mladých myší došlo ke zpoždění regenerace.[10]
Nedávno bylo prokázáno, že upregulace IFRD1 in vivo v poraněném svalu potencuje regeneraci svalů zvýšením produkce staminálních svalových buněk (satelitních buněk).[11] Základní molekulární mechanismus spočívá ve schopnosti IFRD1 spolupracovat s MyoD při indukci transkripční aktivity MEF2C. To závisí na schopnosti IFRD1 vázat se selektivně na MEF2C, čímž inhibuje jeho interakci s HDAC4.[11][12] Proto se zdá, že IFRD1 působí jako pozitivní kofaktor MyoD.[11][12] V poslední době se ukázalo, že IFRD1 potencuje regeneraci svalů druhým mechanismem, který potencuje MyoD, tj. Potlačuje transkripční aktivitu NF-kB, o níž je známo, že inhibuje akumulaci MyoD mRNA. IFRD1 potlačuje aktivitu NF-kB p65 zvýšením HDAC zprostředkované deacetylace podjednotky p65 tím, že zvýhodní nábor HDAC3 na p65. Ve skutečnosti IFRD1 tvoří trimolekulární komplexy s p65 a HDAC3.[11]
IFRD1 tedy může vyvolat regeneraci svalů, která působí jako klíčový regulátor dráhy MyoD prostřednictvím různých mechanismů. Vzhledem k dramatickému poklesu myogenních buněk vyskytujících se u svalových degenerativních patologií, jako je Duchennova dystrofie, schopnost IFRD1 potencovat regenerační proces naznačuje, že IFRD1 může být terapeutickým cílem.
Interakce
Bylo prokázáno, že IFRD1 komunikovat s několika proteiny v komplexu SIN3 včetně SIN3B, SAP30, NCOR1, a HDAC1.[13] Navíc se váže protein IFRD1 MyoD, MEF2C, HDAC4, HDAC3 a podjednotka p65 NF-kB, tvořící trimolekulární komplexy s HDAC3 a str NF-kB bílkoviny.[11][12] IFRD1 protein také tvoří homodimery.[12]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000006652 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001627 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C Buanne P, Incerti B, Guardavaccaro D, Avvantaggiato V, Simeone A, Tirone F (listopad 1998). „Klonování genu pro lidský interferonový vývojový regulátor (IFRD1) kódující protein PC4, člena nové rodiny vývojově regulovaných genů“. Genomika. 51 (2): 233–42. doi:10.1006 / geno.1998.5260. PMID 9722946.
- ^ A b C "Entrez Gene: IFRD1 interferonový vývojový regulátor 1".
- ^ Tirone F, Shooter EM (březen 1989). „Včasná regulace genů nervovým růstovým faktorem v buňkách PC12: indukce genu souvisejícího s interferonem“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (6): 2088–92. Bibcode:1989PNAS ... 86.2088T. doi:10.1073 / pnas.86.6.2088. PMC 286853. PMID 2467301.
- ^ Gu Y, Harley IT, Henderson LB, Aronow BJ, Vietor I, Huber LA, Harley JB, Kilpatrick JR, Langefeld CD, Williams AH, Jegga AG, Chen J, Wills-Karp M, Arshad SH, Ewart SL, Thio CL, Flick LM, MD Filippi, Grimes HL, Drumm ML, Cutting GR, Knowles MR, Karp CL (duben 2009). „Identifikace IFRD1 jako modifikujícího genu pro plicní onemocnění s cystickou fibrózou“. Příroda. 458 (7241): 1039–42. Bibcode:2009 Natur.458.1039G. doi:10.1038 / nature07811. PMC 2841516. PMID 19242412.
- ^ Montagnoli A, Guardavaccaro D, Starace G, Tirone F (říjen 1996). „Nadměrná exprese okamžitého časného genu PC3 indukovaného nervovým růstovým faktorem je spojena s inhibicí růstu“. Růst buněk se liší. 7 (10): 1327–36. PMID 8891336.
- ^ Vadivelu SK, Kurzbauer R, Dieplinger B, Zweyer M, Schafer R, Wernig A, Vietor I, Huber LA (duben 2004). „Poruchy regenerace svalů a myogenní diferenciace u myší bez TIS7“. Mol. Buňka. Biol. 24 (8): 3514–25. doi:10.1128 / mcb.24.8.3514-3525.2004. PMC 381666. PMID 15060170.
- ^ A b C d E Micheli L, Leonardi L, Conti F, Maresca G, Colazingari S, Mattei E, Lira SA, Farioli-Vecchioli S, Caruso M, Tirone F (únor 2011). „PC4 / Tis7 / IFRD1 stimuluje regeneraci kosterního svalstva a podílí se na diferenciaci myoblastů jako regulátor MyoD a NF-kappaB“. J. Biol. Chem. 286 (7): 5691–707. doi:10.1074 / jbc.M110.162842. PMC 3037682. PMID 21127072.
- ^ A b C d Micheli L, Leonardi L, Conti F, Buanne P, Canu N, Caruso M, Tirone F (březen 2005). „PC4 koaktivuje MyoD uvolněním histon-deacetylázy zprostředkovanou inhibici faktoru 2C zesilujícího myocyty“. Mol. Buňka. Biol. 25 (6): 2242–59. doi:10.1128 / MCB.25.6.2242-2259.2005. PMC 1061592. PMID 15743821.
- ^ Vietor I, Vadivelu SK, Wick N, Hoffman R, Cotten M, Seiser C, Fialka I, Wunderlich W, Haase A, Korinkova G, Brosch G, Huber LA (září 2002). „TIS7 interaguje s savčím komplexem histon-deacetylázy SIN3 v buňkách epitelu“. EMBO J.. 21 (17): 4621–31. doi:10.1093 / emboj / cdf461. PMC 125408. PMID 12198164.
Další čtení
- Tirone F, Shooter EM (1989). „Včasná regulace genů nervovým růstovým faktorem v buňkách PC12: indukce genu souvisejícího s interferonem“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (6): 2088–92. Bibcode:1989PNAS ... 86.2088T. doi:10.1073 / pnas.86.6.2088. PMC 286853. PMID 2467301.
- Varnum BC, Lim RW, Herschman HR (1989). "Charakterizace TIS7, genu indukovaného ve švýcarských buňkách 3T3 nádorovým promotorem tetradecanoyl forbol acetátem". Onkogen. 4 (10): 1263–5. PMID 2797820.
- Guardavaccaro D, Ciotti MT, Schäfer BW, Montagnoli A, Tirone F (1995). „Inhibice diferenciace v myoblastech zbavených proteinu PC4 souvisejícího s interferonem“. Růst buněk se liší. 6 (2): 159–69. PMID 7756174.
- Guardavaccaro D, Montagnoli A, Ciotti MT, Gatti A, Lotti L, Di Lazzaro C, Torrisi MR, Tirone F (1994). „Nervový růstový faktor reguluje subcelulární lokalizaci proteinu PC4 indukovatelného nervovým růstovým faktorem v buňkách PC12“. J. Neurosci. Res. 37 (5): 660–74. doi:10.1002 / jnr.490370514. PMID 8028043. S2CID 20845428.
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Ge H, Si Y, Roeder RG (1998). „Izolace cDNA kódujících nové transkripční koaktivátory p52 a p75 odhaluje alternativní regulační mechanismus aktivace transkripce“. EMBO J.. 17 (22): 6723–9. doi:10.1093 / emboj / 17.22.6723. PMC 1171017. PMID 9822615.
- Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (2002). „Vyjádřená analýza sekvenčních značek lidského RPE / choroidu pro projekt NEIBank: více než 6000 neredundantních transkriptů, nových genů a variant sestřihu“. Mol. Vis. 8: 205–20. PMID 12107410.
- Vietor I, Vadivelu SK, Wick N, Hoffman R, Cotten M, Seiser C, Fialka I, Wunderlich W, Haase A, Korinkova G, Brosch G, Huber LA (2002). „TIS7 interaguje s savčím komplexem histon-deacetylázy SIN3 v buňkách epitelu“. EMBO J.. 21 (17): 4621–31. doi:10.1093 / emboj / cdf461. PMC 125408. PMID 12198164.
- Roth A, Gill R, Certa U (2003). "Časové a prostorové vzorce genové exprese po experimentální mrtvici u krysího modelu a charakterizace PC4, potenciálního regulátoru transkripce". Mol. Buňka. Neurosci. 22 (3): 353–64. doi:10.1016 / S1044-7431 (02) 00039-8. PMID 12691737. S2CID 2364009.
- Imabayashi H, Mori T, Gojo S, Kiyono T, Sugiyama T, Irie R, Isogai T, Hata J, Toyama Y, Umezawa A (2003). „Rediferenciace dediferencovaných chondrocytů a chondrogeneze lidských stromálních buněk kostní dřeně prostřednictvím tvorby chondrosféry s profilováním exprese pomocí analýzy cDNA ve velkém měřítku“. Exp. Cell Res. 288 (1): 35–50. doi:10.1016 / S0014-4827 (03) 00130-7. PMID 12878157.
- Micheli L, Leonardi L, Conti F, Buanne P, Canu N, Caruso M, Tirone F (2005). „PC4 koaktivuje MyoD uvolněním histon-deacetylázy zprostředkovanou inhibici faktoru 2C zesilujícího myocyty“. Mol. Buňka. Biol. 25 (6): 2242–59. doi:10.1128 / MCB.25.6.2242-2259.2005. PMC 1061592. PMID 15743821.
- Vietor I, Kurzbauer R, Brosch G, Huber LA (2005). „Regulace TIS7 cílového genu pro osteopontin beta-katenin / Tcf-4 (OPN) je závislá na histon-deacetyláze“. J. Biol. Chem. 280 (48): 39795–801. doi:10,1074 / jbc.M509836200. PMID 16204248.
- Guo H, Gao C, Mi Z, Zhang J, Kuo PC (2007). "Charakterizace vazebné domény PC4 a její interakce s HNF4alpha". J. Biochem. 141 (5): 635–40. doi:10.1093 / jb / mvm066. PMID 17317687.