GvpA - GvpA - Wikipedia

gvpA protein GvpA pro syntézu plynových vezikul
Identifikátory
OrganismusHalobacterium salinarum
NRC-1
SymbolgvpA
Entrez1446785
RefSeq (Prot)NP_045970.1
UniProtP08958
Další údaje
ChromozómGenom: 0,02 - 0,02 Mb
GvpA
Identifikátory
SymbolGvpA
PfamPF00741
InterProIPR000638
STRÁNKAPDOC00207

GvpA je plynový váček strukturální protein nalezeno v různých phyla z bakterie a archaea například v Halobacterium salinarum nebo Haloferax mediterranei. Plynové vezikuly jsou malé, duté, naplněné plynem proteinové struktury nalezeno v několika sinice a archeobakteriální mikroorganismy.[1] Umožňují umístění bakterie v příznivé hloubce pro růst.

GvpA se sdružuje s GvpC, za účelem vytváření plynových vezikul, dutých proteinových struktur, které jsou používány planktonika organismy provádět vertikální migraci. GvpA tvoří většinu struktury, tzv. „Žebra“, tuhá β-listy vzhledem k tomu, že GvpC stabilizuje vezikul proti kolapsu zesíťováním jako α-šroubovice.[2][3][4]

Sekvence

The sekvence GVPa je extrémně dobrá konzervovaný. GvpJ a gvpM, dva bílkoviny zakódováno v klastru geny potřebné pro syntézu plynových vezikul v archaebakterie Halobacterium salinarium a Halobacterium mediterranei (Haloferax mediterranei), byly nalezeny [5] být evolučně související s GVPa. Přesná funkce těchto dvou bílkoviny není známo, i když by mohly být důležité pro stanovení tvar váčky pro stanovení plynu. The N-terminál doména z Aphanizomenon flos-aquae protein gvpA / J také souvisí s GVPa.

Struktura

GvpA ze dne Halobacterium salinarum je 76 aminokyselin dlouhý 8 kDa hydrofobní monomer.[3]

Plynové vezikuly jsou duté válcové trubice, uzavřené na každém konci dutým, kónickým víčkem. Kónické koncovky i střed válec jsou tvořeny 4-5 nm široká žebra, která probíhají v pravém úhlu k dlouhé ose konstrukce. Plyn vezikuly se zdají být složeny ze dvou různých proteinových složek, GVPa a GVPc. GVPa, malý protein asi 70 aminokyselina zbytky, je hlavní složkou plynových vezikul a tvoří základní jádro struktura.

Reference

  1. ^ Walsby AE, Hayes PK (prosinec 1989). „Proteiny plynových váčků“. Biochem. J. 264 (2): 313–22. doi:10.1042 / bj2640313. PMC  1133585. PMID  2513809.
  2. ^ Englert C, Pfeifer F (květen 1993). „Analýza exprese genu plynového váčku v Haloferax mediterranei ukazuje, že GvpA a GvpC jsou oba strukturní proteiny plynového váčku“. J. Biol. Chem. 268 (13): 9329–36. PMID  7683649.
  3. ^ A b UniProt, UniProt GvpA z halobacterium salinarum.
  4. ^ Walsby AE (březen 1994). "Plynové vezikuly". Microbiol. Rev. 58 (1): 94–144. doi:10.1128 / mmbr. 58.1.94-144.1994. PMC  372955. PMID  8177173.
  5. ^ Jones JG, Young DC, DasSarma S (červen 1991). "Struktura a organizace klastru genu plynového váčku na plazmidu halobacterium halobium pNRC100". Gen. 102 (1): 117–22. doi:10.1016 / 0378-1119 (91) 90549-Q. PMID  1864501.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR000638