GC box - GC box

v molekulární biologie, a GC box, také známý jako a GSG box,[1] je zřetelný vzorec nukleotidy nachází se v promotorové oblasti některých eukaryotických genů. Box GC je před TATA box a přibližně 110 bází upstream od místa iniciace transkripce. Má konsensuální sekvenci GGGCGG, která je závislá na poloze a orientaci nezávislá. GC prvky jsou vázány transkripčními faktory a mají podobné funkce jako enhancery.[2] Některé známé proteiny vázající se na GC box zahrnují Sp1, Krox / Egr, Wilmsův nádor, MIGI a CREA.[1]

Pole GC je obvykle vazebným místem pro Zinkový prst bílkoviny. An Alfa šroubovice část proteinu odpovídá hlavní drážce v DNA. Zinkové prsty se vážou na sekvence párů bazí tripletů, přičemž zbytek 21 se váže na první pár bází, zbytek 18 se váže na druhý pár bází a zbytek 15 se váže na třetí pár bází. Tripletové páry bází mohou být buď GGG nebo GCG. Pokud je zbytkem 18 histidin, bude se vážit na G, a pokud je zbytkem 18 kyselina glutamová, bude se vážit na C. GC box-binding zinkový prst má mezi 2 a 4 prsty, díky čemuž budou interagovat s párem bází sekvence, které jsou dlouhé 6 až 8 párů bází.[1]

Reference

  1. ^ A b C Lundin, M .; Nehlin, J. O .; Ronne, H. (01.03.1994). „Význam přilehlé oblasti bohaté na AT při rozpoznávání cílového místa pomocí proteinu MIG1 se zinkovým prstem vázajícím se na GC“. Molekulární a buněčná biologie. 14 (3): 1979–1985. doi:10.1128 / MCB.14.3.1979. ISSN  0270-7306. PMC  358557. PMID  8114729.
  2. ^ Klug WS, Cummings MR, Spencer CA, Palladina MA (2009). Koncepty genetiky (Deváté vydání.). San Francisco: Pearson Benjamin Cummings. str.463 –464. ISBN  978-0-321-54098-0.