Fibronektin typu I - Fibronectin type I domain - Wikipedia

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	PDB: 1e88 PDB: 1e8b PDB: 1fbr PDB: 1o9a PDB: 1 qgb PDB: 1qo6 PDB: 1tpg PDB: 1 tpm PDB: 1 tpn PDB: 2fn2

Fibronektin, typ I.
Identifikátory
Symbol	Fibrnctn1
Pfam	PF00039
InterPro	IPR000083
CHYTRÝ	SM00058
STRÁNKA	PDOC00965
CDD	cd00061
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury
PDB	PDB: 1e88 PDB: 1e8b PDB: 1fbr PDB: 1o9a PDB: 1 qgb PDB: 1qo6 PDB: 1tpg PDB: 1 tpm PDB: 1 tpn PDB: 2fn2

Fibronektin, typ I. opakování je jedním ze tří opakování nalezených v fibronektin protein. Fibronektin je plazmatický protein, který váže buněčné povrchy a různé sloučeniny včetně kolagen, fibrin, heparin, DNA a aktin. Doména typu I (FN1) má délku přibližně 40 zbytků. Jsou zahrnuty čtyři konzervované cysteiny disulfidové vazby. Byla stanovena 3D struktura domény FN1.^[1]^[2]^[3] Skládá se ze dvou antiparalelních beta-listů, nejprve dvouvláknové, které jsou spojeny disulfidovou vazbou s trojvláknovou beta-fólií. Druhý konzervovaný disulfidový můstek spojuje C-koncové sousední řetězce domény.

V řetězci A aktivátoru plazminogenu lidské tkáně je doména FN1 spolu s následující doménou podobnou epidermálnímu růstovému faktoru (EGF) zapojena do vazby na fibrin.^[4] Bylo navrženo, aby tyto dva moduly tvořily jednu strukturální a funkční jednotku.^[3] Tyto dvě domény si zachovávají svou specifickou terciární strukturu, ale intimně interagují, aby pohřbily hydrofobní jádro; linker mezi moduly tvoří třetí řetězec hlavního beta listu modulu EGF.

Lidské proteiny obsahující tuto doménu

F12; FN1; HGFAC; DESKA;

Reference

^ Campbell ID, Baron M, Norman D, Willis A (1990). "Struktura modulu fibronektinu typu 1". Příroda. 345 (6276): 642–646. doi:10.1038 / 345642a0. PMID 2112232. S2CID 4328182.
^ Driscoll PC, Harvey TS, Campbell ID, Baron M, Dudgeon TJ, Downing AK, Smith BO (1992). „Struktura řešení prstové domény vázající fibrin tkáňového typu aktivátor plazminogenu stanoveno 1H nukleární magnetickou rezonancí ". J. Mol. Biol. 225 (3): 821–833. doi:10.1016/0022-2836(92)90403-7. PMID 1602484.
^ ^A ^b Driscoll PC, Campbell ID, Dudgeon TJ, Downing AK, Smith BO (1995). „Struktura řešení a dynamika páteře fibronektinu typu I a dvojice modulů aktivátoru plazminogenu tkáňového typu podobného epidermálnímu růstovému faktoru“. Struktura. 3 (8): 823–833. doi:10.1016 / S0969-2126 (01) 00217-9. PMID 7582899.
^ Bennett WF, Paoni NF, Keyt BA, Botstein D, Presta L, Wurm FM, Zoller MJ, Jones AJ (1991). "Analýza funkčních determinantů s vysokým rozlišením na aktivátoru plazminogenu lidské tkáně". J. Biol. Chem. 266 (8): 5191–5201. PMID 1900516.

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR000083

[PUB00004065-1] Campbell ID, Baron M, Norman D, Willis A (1990). "Struktura modulu fibronektinu typu 1". Příroda. 345 (6276): 642–646. doi:10.1038 / 345642a0. PMID 2112232. S2CID 4328182.

[PUB00003289-2] Driscoll PC, Harvey TS, Campbell ID, Baron M, Dudgeon TJ, Downing AK, Smith BO (1992). „Struktura řešení prstové domény vázající fibrin tkáňového typu aktivátor plazminogenu stanoveno 1H nukleární magnetickou rezonancí ". J. Mol. Biol. 225 (3): 821–833. doi:10.1016/0022-2836(92)90403-7. PMID 1602484.

[PUB00005265-3] A ^b Driscoll PC, Campbell ID, Dudgeon TJ, Downing AK, Smith BO (1995). „Struktura řešení a dynamika páteře fibronektinu typu I a dvojice modulů aktivátoru plazminogenu tkáňového typu podobného epidermálnímu růstovému faktoru“. Struktura. 3 (8): 823–833. doi:10.1016 / S0969-2126 (01) 00217-9. PMID 7582899.

[PUB00002685-4] Bennett WF, Paoni NF, Keyt BA, Botstein D, Presta L, Wurm FM, Zoller MJ, Jones AJ (1991). "Analýza funkčních determinantů s vysokým rozlišením na aktivátoru plazminogenu lidské tkáně". J. Biol. Chem. 266 (8): 5191–5201. PMID 1900516.

[1]

[2]

[3]

[4]