ERAP1 - ERAP1
Regulátor aminopeptidázy vylučující receptor faktoru nekrózy typu 1, také známý jako endoplazmatické retikulum aminopeptidáza 1 (UMĚNÍ-1), je protein který je u lidí kódován UMĚNÍ-1 gen.[5]
Endoplazmatická retikula aminopeptidáza 1 je aktivní v endoplazmatické retikulum, která se podílí na zpracování a transportu proteinů. Tento protein je aminopeptidáza, což je enzym, který štěpí peptidy na N-konci na menší fragmenty zvané aminokyseliny.
Nomenklatura
ARTS1 je také známý jako:
- ER aminopeptidáza 1 (ERAP1) název přijatý Výborem pro názvosloví Hugo Gene[6]
- ER aminopeptidáza spojená se zpracováním antigenu (ERAAP) u myší [7]
- Leucinaminopeptidáza derivovaná z adipocytů (ALAP)
- Na leucin aminopeptidázu necitlivou na puromycin (PILS-AP)
Funkce
ERAP1 má v imunitním systému dvě hlavní funkce:
- Nejprve ERAP1 štěpí několik nazývaných proteinů cytokin receptory na povrchu buněk. Štěpení těchto receptorů snižuje jejich schopnost přenášet chemické signály do buňky, což ovlivňuje proces zánět.
- Za druhé, ERAP1 ořezává peptidy v endoplazmatickém retikulu tak, aby na ně mohly být naneseny hlavní komplex histokompatibility (MHC) třída I. Tyto peptidy jsou připojeny k MHC třídy I v endoplazmatickém retikulu a exportovány na buněčný povrch, kde jsou vystaveny imunitnímu systému. Pokud imunitní systém rozpozná peptidy jako cizí (například virové nebo bakteriální peptidy), reaguje spuštěním infikované buňky k autodestrukci.[8]
ARTS-1 je členem rodiny zinku M1 metalopeptidázy který funguje jako aminopeptidáza který degraduje oligopeptidy štěpením počínaje od amino konec. Jednou z funkcí aminopeptidáz je degradace potenciálně toxických peptidů v cytosol.[5]
ARTS-1 je transmembránový protein, který je lokalizován na endoplazmatické retikulum. Bylo implikováno do následujících funkcí:
- Prolévání různých cytokinové receptory a návnadové receptory
- Ořezávání antigenních peptidů před vazbou na MHC třída I, ovlivňující prezentaci antigenu do cytotoxické T lymfocyty
- Stimulace fagocytózy po uvolnění makrofágy[9]
Klinický význam
Aminopeptidázy hrají roli v metabolismu několika peptidů, na kterých se mohou podílet krevní tlak a patogeneze z esenciální hypertenze.[5] Mutace v ARTS-1 byly spojeny se zvýšeným rizikem ankylozující spondylitida ale pouze v HLA-B27 pozitivní pacienti.[10]
Protein kódovaný tímto genem je aminopeptidáza podílející se na trimování vazebných prekurzorů HLA třídy I, aby mohly být prezentovány na molekulách MHC třídy I. Kódovaný protein funguje jako a monomer nebo jako heterodimer s ERAP2. Tento protein může být také zapojen do regulace krevního tlaku deaktivací angiotensin II. Tři varianty přepisu kódující dva různé izoformy byly nalezeny pro tento gen.[5]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164307 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021583 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C d EntrezGene 51752
- ^ „HGNC“. HGNC. Citováno 27. března 2014.
- ^ Serwold T, Gonzalez F, Kim J, Jacob R, Shastri N (2002). „ERAAP upravuje peptidy pro molekuly MHC třídy I v endoplazmatickém retikulu“. Příroda. 419 (6906): 480–3. doi:10.1038 / nature01074. PMID 12368856. S2CID 4379291.
- ^ „ERAP1 - endoplazmatické retikulum aminopeptidáza 1 - Genetická domácí reference“.
- ^ Goto Y, Ogawa K, Hattori A, Tsujimoto M (červen 2011). „Sekrece endoplazmatického retikula aminopeptidázy 1 se účastní aktivace makrofágů indukovaných lipopolysacharidem a interferonem-gama“. The Journal of Biological Chemistry. 286 (24): 21906–14. doi:10.1074 / jbc.M111.239111. PMC 3122245. PMID 21531727.
- ^ Brionez TF, Reveille JD (2008). „Příspěvek genů mimo hlavní histokompatibilní komplex k náchylnosti k ankylozující spondylitidě“. Aktuální názor na revmatologii. 20 (4): 384–91. doi:10.1097 / BOR.0b013e32830460fe. PMID 18525349. S2CID 205485848.
externí odkazy
- Člověk ERAP1 umístění genomu a ERAP1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Další čtení
- Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (2002). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: Ruční kurátorství 330 klonů cDNA KIAA“. Výzkum DNA. 9 (3): 99–106. CiteSeerX 10.1.1.500.923. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
- Tsujimoto M, Hattori A (2005). "Oxytocinasová podrodina M1 aminopeptidáz". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - bílkoviny a proteomika. 1751 (1): 9–18. doi:10.1016 / j.bbapap.2004.09.011. PMID 16054015.
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-konec". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1998). „Predikce kódovacích sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 5 (1): 31–9. doi:10.1093 / dnares / 5.1.31. PMID 9628581.
- Hattori A, Matsumoto H, Mizutani S, Tsujimoto M (1999). „Molekulární klonování leucinaminopeptidázy odvozené od adipocytů vysoce příbuzné placentární leucinaminopeptidáze / oxytocináze“. Journal of Biochemistry. 125 (5): 931–8. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022371. PMID 10220586.
- Hattori A, Kitatani K, Matsumoto H, Miyazawa S, Rogi T, Tsuruoka N, Mizutani S, Natori Y, Tsujimoto M (2000). "Charakterizace rekombinantní lidské adipocytové leucinaminopeptidázy exprimované v buňkách vaječníků čínského křečka". Journal of Biochemistry. 128 (5): 755–62. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022812. PMID 11056387.
- Hattori A, Matsumoto K, Mizutani S, Tsujimoto M (2001). „Genomická organizace lidského genu pro leucinaminopeptidázu odvozenou od adipocytů a její vztah ke genu pro placentární leucinaminaminopeptidázu / oxytocinasu“. Journal of Biochemistry. 130 (2): 235–41. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a002977. PMID 11481040.
- Yamamoto N, Nakayama J, Yamakawa-Kobayashi K, Hamaguchi H, Miyazaki R, Arinami T (2002). „Identifikace 33 polymorfismů v genu leucinaminopeptidázy (ALAP) odvozené od adipocytů a možná asociace s hypertenzí“. Lidská mutace. 19 (3): 251–7. doi:10.1002 / humu.10047. PMID 11857741. S2CID 23459237.
- Cui X, Hawari F, Alsaaty S, Lawrence M, Combs CA, Geng W, Rouhani FN, Miskinis D, Levine SJ (2002). „Identifikace ARTS-1 jako nového proteinu vázajícího TNFR1, který podporuje vylučování ektodomény TNFR1“. Journal of Clinical Investigation. 110 (4): 515–26. doi:10,1172 / JCI13847. PMC 150410. PMID 12189246.
- Serwold T, Gonzalez F, Kim J, Jacob R, Shastri N (2002). „ERAAP upravuje peptidy pro molekuly MHC třídy I v endoplazmatickém retikulu“. Příroda. 419 (6906): 480–3. doi:10.1038 / nature01074. PMID 12368856. S2CID 4379291.
- Saric T, Chang SC, Hattori A, York IA, Markant S, Rock KL, Tsujimoto M, Goldberg AL (2002). „Aminopeptidáza indukovaná IFN-y v ER, ERAP1, ořezává prekurzory peptidů prezentovaných MHC třídy I“. Přírodní imunologie. 3 (12): 1169–76. doi:10.1038 / ni859. PMID 12436109. S2CID 21648629.
- York IA, Chang SC, Saric T, Keys JA, Favreau JM, Goldberg AL, Rock KL (2002). „ER aminopeptidáza ERAP1 zvyšuje nebo omezuje prezentaci antigenu ořezáváním epitopů na 8–9 zbytků.“ Přírodní imunologie. 3 (12): 1177–84. doi:10.1038 / ni860. PMID 12436110. S2CID 21337369.
- Cui X, Rouhani FN, Hawari F, Levine SJ (2003). „Aminopeptidáza, ARTS-1, je nutná pro vylučování receptoru interleukinu-6“. Journal of Biological Chemistry. 278 (31): 28677–85. doi:10,1074 / jbc.M300456200. PMID 12748171.
- Clark HF, Gurney AL, Abaya E, Baker K, Baldwin D, Brush J, Chen J, Chow B, Chui C, Crowley C, Currell B, Deuel B, Dowd P, Eaton D, Foster J, Grimaldi C, Gu Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh J, Smith V, Stinson J, Vagts A, Vandlen R, Watanabe C, Wieand D, Woods K, Xie MH, Yansura D, Yi S, Yu G, Yuan J, Zhang M, Zhang Z, Goddard A, Wood WI, Godowski P, Gray A (2003). „Iniciativa Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), rozsáhlá snaha o identifikaci nových lidských sekretovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Výzkum genomu. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
- Cui X, Rouhani FN, Hawari F, Levine SJ (2003). „Vypouštění návnadového receptoru IL-1 typu II vyžaduje multifunkční aminopeptidázu, regulátor aminopeptidázy uvolňování TNF receptoru typu 1“. The Journal of Immunology. 171 (12): 6814–9. doi:10,4049 / jimmunol.171.12.6814. PMID 14662887.
- Shibata D, Ando H, Iwase A, Nagasaka T, Hattori A, Tsujimoto M, Mizutani S (2004). „Distribuce leucinaminopeptidázy (A-LAP) / ER-aminopeptidázy (ERAP) -1 odvozené z adipocytů v endometriu lidské dělohy“. Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 52 (9): 1169–75. doi:10.1369 / jhc.3A6216.2004. PMID 15314084.