Drosha - Drosha
Drosha je třída 2 ribonukleáza III enzym [5] že u lidí je kódován DROSHA (dříve RNASEN) gen.[6][7][8]
Funkce
Členové nadrodiny ribonukleázy III dvouvláknová (ds) RNA -charakteristický endoribonukleázy podílet se na různých RNA cesty zrání a rozpadu v eukaryotický a prokaryotický buňky.[9] RNáza III Drosha je jádro nukleáza který provede iniciační krok mikroRNA (miRNA) zpracování v jádro.[8][10]
Takto generované mikroRNA jsou krátké RNA molekuly, které regulují širokou škálu dalších genů interakcí s RNA-indukovaný umlčovací komplex (RISC) k vyvolání štěpení komplementární messenger RNA (mRNA) jako součást Interference RNA cesta. Molekula microRNA je syntetizována jako dlouhá RNA primární přepis známý jako pri-miRNA, který Drosha štěpí, aby vytvořil charakteristiku kmenová smyčka struktura asi 70 základní páry dlouhý, známý jako pre-miRNA.[10] Drosha existuje jako součást a proteinový komplex volal Mikroprocesorový komplex, který také obsahuje dvouvláknový protein vázající RNA DGCR8 (volala Paša v D. melanogaster a C. elegans ).[11] DGCR8 je nezbytný pro aktivitu Drosha a je schopen vázat jednovláknové fragmenty pri-miRNA, které jsou nutné pro správné zpracování.[12]
Lidská Drosha byla klonována v roce 2000[Citace je zapotřebí ], když byla identifikována jako nukleární dsRNA ribonukleáza podílející se na zpracování ribozomální RNA prekurzory. Další dva lidské enzymy, které se podílejí na zpracování a aktivitě miRNA, jsou Hráč v kostky a Argonaute bílkoviny.
Drosha i DGCR8 jsou lokalizovány do buněčné jádro, kde dochází ke zpracování pri-miRNA na pre-miRNA. Tato druhá molekula je potom dále zpracována RNázou Hráč v kostky do zralých miRNA v buňce cytoplazma.[10] Existuje také izoforma Drosha, která neobsahuje jaderný lokalizační signál, což má za následek generování c-Drosha.[13][14] Ukázalo se, že tato varianta je lokalizována do buňky cytoplazma spíše než jádro, ale účinky na zpracování pri-miRNA jsou zatím nejasné.
Drosha i Dicer se rovněž účastní Odpověď na poškození DNA.[15]
Klinický význam
Drosha a další enzymy zpracovávající miRNA mohou být důležité v prognóze rakoviny.[16] Oba Drosha a Hráč v kostky může fungovat jako hlavní regulátory zpracování miRNA a bylo pozorováno, že je u některých typů snížena rakovina prsu.[17] Alternativní sestřihové vzory Drosha v Atlas rakovinového genomu také naznačili, že se c-drosha zdá být obohacena o různé typy rakoviny prsu, rakovina tlustého střeva, a rakovina jícnu.[14] Přesná povaha asociace mezi zpracováním mikroRNA a tumorigeneze je nejasný,[18] ale jeho funkce může být účinně zkoumána knoRowem siRNA na základě nezávislé validace.[19]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113360 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022191 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Filippov V, Solovyev V, Filippova M, Gill SS (březen 2000). "Nový typ proteinů rodiny RNázy III v eukaryotech". Gen. 245 (1): 213–21. doi:10.1016 / s0378-1119 (99) 00571-5. PMID 10713462.
- ^ Filippov V, Solovyev V, Filippova M, Gill SS (březen 2000). "Nový typ proteinů rodiny RNázy III v eukaryotech". Gen. 245 (1): 213–21. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00571-5. PMID 10713462.
- ^ Wu H, Xu H, Miraglia LJ, Crooke ST (listopad 2000). „Human RNase III is a 160-kDa protein involved in preribosomal RNA processing“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (47): 36957–65. doi:10,1074 / jbc.M005494200. PMID 10948199.
- ^ A b „Entrez Gene: RNASEN ribonukleáza III, jaderná“.
- ^ Fortin KR, Nicholson RH, Nicholson AW (srpen 2002). „Myší ribonukleáza III. Struktura cDNA, analýza exprese a umístění chromozomů“. BMC Genomics. 3 (1): 26. doi:10.1186/1471-2164-3-26. PMC 122089. PMID 12191433.
- ^ A b C Lee Y, Ahn C, Han J, Choi H, Kim J, Yim J, Lee J, Provost P, Rådmark O, Kim S, Kim VN (září 2003). „Jaderná RNáza III Drosha zahajuje zpracování mikroRNA“. Příroda. 425 (6956): 415–9. doi:10.1038 / nature01957. PMID 14508493. S2CID 4421030.
- ^ Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (listopad 2004). "Zpracování primárních mikroRNA komplexem mikroprocesorů". Příroda. 432 (7014): 231–5. doi:10.1038 / nature03049. PMID 15531879. S2CID 4425505.
- ^ Han J, Lee Y, Yeom KH, Nam JW, Heo I, Rhee JK, Sohn SY, Cho Y, Zhang BT, Kim VN (červen 2006). „Molekulární základna pro rozpoznávání primárních mikroRNA komplexem Drosha-DGCR8“. Buňka. 125 (5): 887–901. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.043. PMID 16751099. S2CID 453021.
- ^ Link S, Grund SE, Diederichs S (květen 2016). „Alternativní sestřih ovlivňuje subcelulární lokalizaci Drosha“. Výzkum nukleových kyselin. 44 (11): 5330–43. doi:10.1093 / nar / gkw400. PMC 4914122. PMID 27185895.
- ^ A b Dai L, Chen K, Youngren B, Kulina J, Yang A, Guo Z, Li J, Yu P, Gu S (červenec 2016). „Cytoplazmatická aktivita Drosha generovaná alternativním spojováním“. Výzkum nukleových kyselin. 44 (21): 10454–10466. doi:10.1093 / nar / gkw668. PMC 5137420. PMID 27471035.
- ^ Francia S, Michelini F, Saxena A, Tang D, de Hoon M, Anelli V, Mione M, Carninci P, d'Adda di Fagagna F (srpen 2012). „Site-specific DICER and DROSHA RNA products control the DNA-damage response“. Příroda. 488 (7410): 231–5. doi:10.1038 / příroda11179. PMC 3442236. PMID 22722852.
- ^ Slack FJ, Weidhaas JB (prosinec 2008). "MicroRNA v prognóze rakoviny". The New England Journal of Medicine. 359 (25): 2720–2. doi:10.1056 / NEJMe0808667. PMID 19092157.
- ^ Thomson JM, Newman M, Parker JS, Morin-Kensicki EM, Wright T, Hammond SM (srpen 2006). „Rozsáhlá post-transkripční regulace mikroRNA a její důsledky pro rakovinu“. Geny a vývoj. 20 (16): 2202–7. doi:10.1101 / gad.1444406. PMC 1553203. PMID 16882971.
- ^ Iorio MV, Croce CM (červen 2012). „zapojení mikroRNA do lidské rakoviny“. Karcinogeneze. 33 (6): 1126–33. doi:10.1093 / carcin / bgs140. PMC 3514864. PMID 22491715.
- ^ Munkácsy, Gyöngyi; Sztupinszki, Zsófia; Herman, Péter; Bán, Bence; Pénzváltó, Zsófia; Szarvas, Nóra; Győrffy, Balázs (01.01.2016). „Ověření účinnosti umlčování RNAi pomocí dat genového pole ukazuje 18,5% poruchovost ve 429 nezávislých experimentech“. Molekulární terapie - nukleové kyseliny. 5 (9): e366. doi:10.1038 / mtna.2016.66. ISSN 2162-2531. PMC 5056990. PMID 27673562.
Další čtení
- Gunther M, Laithier M, Brison O (červenec 2000). "Sada proteinů interagujících s transkripčním faktorem Sp1 identifikovaných při dvouhybridním screeningu". Molekulární a buněčná biochemie. 210 (1–2): 131–42. doi:10.1023 / A: 1007177623283. PMID 10976766. S2CID 1339642.
- Fortin KR, Nicholson RH, Nicholson AW (srpen 2002). „Myší ribonukleáza III. Struktura cDNA, analýza exprese a umístění chromozomů“. BMC Genomics. 3 (1): 26. doi:10.1186/1471-2164-3-26. PMC 122089. PMID 12191433.
- Lee Y, Ahn C, Han J, Choi H, Kim J, Yim J, Lee J, Provost P, Rådmark O, Kim S, Kim VN (září 2003). „Jaderná RNáza III Drosha zahajuje zpracování mikroRNA“. Příroda. 425 (6956): 415–9. doi:10.1038 / nature01957. PMID 14508493. S2CID 4421030.
- Gregory RI, Yan KP, Amuthan G, Chendrimada T, Doratotaj B, Cooch N, Shiekhattar R (listopad 2004). „Mikroprocesorový komplex zprostředkovává genezi mikroRNA“. Příroda. 432 (7014): 235–40. doi:10.1038 / nature03120. PMID 15531877. S2CID 4389261.
- Zeng Y, Yi R, Cullen BR (leden 2005). "Rozpoznávání a štěpení primárních prekurzorů mikroRNA enzymem jaderného zpracování Drosha". Časopis EMBO. 24 (1): 138–48. doi:10.1038 / sj.emboj.7600491. PMC 544904. PMID 15565168.
- Han J, Lee Y, Yeom KH, Kim YK, Jin H, Kim VN (prosinec 2004). „Komplex Drosha-DGCR8 v primárním zpracování mikroRNA“. Geny a vývoj. 18 (24): 3016–27. doi:10.1101 / gad.1262504. PMC 535913. PMID 15574589.
- Landthaler M, Yalcin A, Tuschl T (prosinec 2004). „Pro biogenezi miRNA je vyžadován gen 8 kritické oblasti lidského syndromu DiGeorge a jeho homolog D. melanogaster.“ Aktuální biologie. 14 (23): 2162–7. doi:10.1016 / j.cub.2004.11.001. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-EB83-3. PMID 15589161. S2CID 13266269.
- Zeng Y, Cullen BR (červenec 2005). „Efektivní zpracování primárních vlásenkových mikroRNA pomocí Drosha vyžaduje doprovodné nestrukturované sekvence RNA“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (30): 27595–603. doi:10,1074 / jbc.M504714200. PMID 15932881.
- Irvin-Wilson CV, Chaudhuri G (2006). „Alternativní iniciace a sestřih v expresi dicer genu v lidských buňkách prsu“. Výzkum rakoviny prsu. 7 (4): R563–9. doi:10.1186 / bcr1043. PMC 1175071. PMID 15987463.
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). "Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích". Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Sugito N, Ishiguro H, Kuwabara Y, Kimura M, Mitsui A, Kurehara H, Ando T, Mori R, Takashima N, Ogawa R, Fujii Y (prosinec 2006). „RNASEN reguluje buněčnou proliferaci a ovlivňuje přežití u pacientů s rakovinou jícnu“. Klinický výzkum rakoviny. 12 (24): 7322–8. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-06-0515. PMID 17121874.
- Kim YK, Kim VN (únor 2007). "Zpracování intronových mikroRNA". Časopis EMBO. 26 (3): 775–83. doi:10.1038 / sj.emboj.7601512. PMC 1794378. PMID 17255951.
- Xing L, Kieff E (září 2007). „Virus Epstein-Barrové BHRF1 mikro- a stabilní RNA během latence III a po indukci replikace“. Journal of Virology. 81 (18): 9967–75. doi:10.1128 / JVI.02244-06. PMC 2045418. PMID 17626073.