DGCR8 - DGCR8
The DGCR8 mikroprocesorová komplexní podjednotka (DiGeorgeův syndrom chromozomální [nebo kritický] region 8) je protein že u lidí je kódován DGCR8 gen.[4] U jiných zvířat, zejména u běžných modelové organismy Drosophila melanogaster a Caenorhabditis elegans, protein je známý jako Paša (partner Drosha ).[5] Je požadovanou součástí Interference RNA cesta.
Funkce
DGCR8 je lokalizován na buněčné jádro a je vyžadováno pro mikroRNA (miRNA) zpracování. To se váže na Drosha, an RNáza III enzym, k vytvoření Mikroprocesorový komplex který štěpí a primární přepis známý jako pri-miRNA k charakteristice kmenová smyčka struktura známá jako pre-miRNA, která je poté dále zpracována na fragmenty miRNA pomocí enzymu Hráč v kostky. DGCR8 obsahuje RNA vazebná doména a předpokládá se, že váže pri-miRNA a stabilizuje ji pro zpracování Droshou.[6]
DGCR8 je také vyžadován pro některé typy oprav DNA. Odstranění UV-indukované DNA fotoprodukty, v době oprava excize nukleotidů vázaných na transkripci (TC-NER), závisí na JNK fosforylaci DGCR8 na serin 153.[7] I když je známo, že DGCR8 funguje v biogenezi mikroRNA, tato aktivita není nutná pro DGCR8-závislé odstraňování UV produktů indukovaných fotoproduktů.[7] Oprava nukleotidové excize je také nutný pro opravu poškození oxidační DNA v důsledku peroxid vodíku (H2Ó2) a buňky vyčerpané DGCR8 jsou citlivé na H2Ó2.[7]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000128191 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ "Entrez Gene: DGCR8 DiGeorgeův syndrom, kritická oblast, gen 8".
- ^ Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (listopad 2004). "Zpracování primárních mikroRNA komplexem mikroprocesorů". Příroda. 432 (7014): 231–5. doi:10.1038 / nature03049. PMID 15531879.
- ^ Yeom KH, Lee Y, Han J, Suh MR, Kim VN (2006). „Charakterizace DGCR8 / Pasha, základního kofaktoru pro Drosha při primárním zpracování miRNA“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (16): 4622–9. doi:10.1093 / nar / gkl458. PMC 1636349. PMID 16963499.
- ^ A b C Calses PC, Dhillon KK, Tucker N, Chi Y, Huang JW, Kawasumi M, Nghiem P, Wang Y, Clurman BE, Jacquemont C, Gafken PR, Sugasawa K, Saijo M, Taniguchi T (2017). „DGCR8 zprostředkovává opravu poškození DNA indukované UV zářením nezávisle na zpracování RNA“. Cell Rep. 19 (1): 162–174. doi:10.1016 / j.celrep.2017.03.021. PMC 5423785. PMID 28380355.
Další čtení
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Shiohama A, Sasaki T, Noda S, Minoshima S, Shimizu N (duben 2003). "Molekulární klonování a analýza exprese nového genu DGCR8 umístěného v chromozomální oblasti DiGeorgeova syndromu". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 304 (1): 184–90. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00554-0. PMID 12705904.
- Gregory RI, Yan KP, Amuthan G, Chendrimada T, Doratotaj B, Cooch N, Shiekhattar R (listopad 2004). „Mikroprocesorový komplex zprostředkovává genezi mikroRNA“. Příroda. 432 (7014): 235–40. doi:10.1038 / nature03120. PMID 15531877.
- Han J, Lee Y, Yeom KH, Kim YK, Jin H, Kim VN (prosinec 2004). „Komplex Drosha-DGCR8 v primárním zpracování mikroRNA“. Geny a vývoj. 18 (24): 3016–27. doi:10.1101 / gad.1262504. PMC 535913. PMID 15574589.
- Landthaler M, Yalcin A, Tuschl T (prosinec 2004). „Gen 8 kritické oblasti lidského syndromu DiGeorge a jeho homolog D. melanogaster jsou vyžadovány pro biogenezi miRNA“. Aktuální biologie. 14 (23): 2162–7. doi:10.1016 / j.cub.2004.11.001. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-EB83-3. PMID 15589161.
- Han J, Lee Y, Yeom KH, Nam JW, Heo I, Rhee JK, Sohn SY, Cho Y, Zhang BT, Kim VN (červen 2006). „Molekulární základna pro rozpoznávání primárních mikroRNA komplexem Drosha-DGCR8“. Buňka. 125 (5): 887–901. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.043. PMID 16751099.
- Faller M, Matsunaga M, Yin S, Loo JA, Guo F (leden 2007). "Heme se podílí na zpracování mikroRNA". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 14 (1): 23–9. doi:10.1038 / nsmb1182. PMID 17159994.
- Sohn SY, Bae WJ, Kim JJ, Yeom KH, Kim VN, Cho Y (září 2007). "Krystalová struktura lidského jádra DGCR8". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 14 (9): 847–53. doi:10.1038 / nsmb1294. PMID 17704815.
Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |