Cyklin T1 - Cyclin T1

CCNT1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2PK2, 3BLH, 3BLQ, 3BLR, 3LQ5, 3MI9, 3MIA, 3MY1, 3TN8, 3TNH, 3TNI, 4BCF, 4BCG, 4BCH, 4BCI, 4BCJ, 4EC8, 4EC9, 4IMY, 4OGR, 4OR5
Identifikátory
Aliasy	CCNT1, CCNT, CYCT1, HIVE1, cyklin T1
Externí ID	OMIM: 143055 MGI: 1328363 HomoloGene: 947 Genové karty: CCNT1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	48,716,998 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	98,570,923 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba snRNA; • vazba chromatinu; • Vazba 7SK snRNA; • aktivita regulátoru proteinu serin / threonin kinázy závislá na cyklinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA polymerázy; • vazba transkripčního faktoru; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • vazba protein kinázy; • GO: 0016534 aktivita aktivátoru proteinu serin / threonin kinázy závislá na cyklinu;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • jádro; • komplex cyklin / CDK pozitivní transkripční elongační faktor; • buněčné jádro; • komplex holoenzymu protein-kinázy závislý na cyklinu;
Biologický proces	• regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kináza; • negativní regulace polyadenylace mRNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • buněčné dělení; • fosforylace bílkovin; • pozitivní regulace fosforylace C-terminální domény RNA polymerázy II; • pozitivní regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kinázy; • pozitivní regulace virové transkripce; • buněčný cyklus; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • GO: virový proces 0022415; • transkripce, chráněná DNA; • transkripce snRNA z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace transkripce s templátem DNA, prodloužení;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	904
	12455
	ENSG00000129315
	ENSMUSG00000011960
	O60563
	Q9QWV9
	NM_001240; NM_001277842
	NM_009833; NM_001368702
	NP_001231; NP_001264771
	NP_033963; NP_001355631
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cyklin-T1 je protein že u lidí je kódován CCNT1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem patří do vysoce konzervované rodiny cyklinů, jejíž členové se vyznačují dramatickou periodicitou nadbytku proteinů v průběhu buněčného cyklu. Cykliny fungují jako regulátory CDK kinázy. Různé cykliny vykazují odlišné vzorce exprese a degradace, které přispívají k časové koordinaci každé mitotické události. Tento cyklin je úzce spojen s CDK9 kináza a bylo zjištěno, že je hlavní podjednotkou faktoru prodloužení transkripce p-TEFb. Komplex kinázy obsahující tento cyklin a elongační faktor může interagovat s a působit jako kofaktor viru lidské imunodeficience typu 1 (HIV-1) Tat Protein a byl prokázán jako nezbytný a dostatečný pro plnou aktivaci virové transkripce. Bylo také zjištěno, že tento cyklin a jeho kinázový partner se účastní fosforylace a regulace karboxyterminální domény (CTD) největší podjednotky RNA polymerázy II.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že cyklin T1 komunikovat s:

Arylový uhlovodíkový receptor,^[8]
CDK9,^[6]^[9]^[10]^[11]^[12]^[13]^[14]^[15]^[16]
Granulin,^[10]
HEXIM1,^[9]
Moje C,^[17]
NUFIP1,^[11] a
Promyelocytární leukemický protein.^[18]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129315 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000011960 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wei P, Garber ME, Fang SM, Fischer WH, Jones KA (březen 1998). „Nový cyklin C-typu asociovaný s CDK9 interaguje přímo s HIV-1 Tat a zprostředkovává jeho vysoce afinitní, smyčkově specifické navázání na TAR RNA.“ Buňka. 92 (4): 451–62. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80939-3. PMID 9491887. S2CID 16395032.
^ ^A ^b Peng J, Zhu Y, Milton JT, cena DH (duben 1998). "Identifikace více cyklinových podjednotek lidského P-TEFb". Genes Dev. 12 (5): 755–62. doi:10,1101 / gad.12.5.755. PMC 316581. PMID 9499409.
^ „Entrez Gene: CCNT1 cyklin T1“.
^ Tian Y, Ke S, Chen M, Sheng T (listopad 2003). „Interakce mezi arylovým uhlovodíkovým receptorem a P-TEFb. Sekvenční nábor transkripčních faktorů a diferenciální fosforylace C-koncové domény RNA polymerázy II na promotoru cyp1a1“. J. Biol. Chem. 278 (45): 44041–8. doi:10,1074 / jbc.M306443200. PMID 12917420.
^ ^A ^b Michels AA, Nguyen VT, Fraldi A, Labas V, Edwards M, Bonnet F, Lania L, Bensaude O (červenec 2003). „RNA MAQ1 a 7SK interaguje s komplexy CDK9 / cyklin T transkripčně závislým způsobem“. Mol. Buňka. Biol. 23 (14): 4859–69. doi:10.1128 / mcb.23.14.4859-4869.2003. PMC 162212. PMID 12832472.
^ ^A ^b Hoque M, Young TM, Lee CG, Serrero G, Mathews MB, Pe'ery T (březen 2003). „Granulin růstového faktoru interaguje s cyklinem T1 a moduluje transkripci závislou na P-TEFb“. Mol. Buňka. Biol. 23 (5): 1688–702. doi:10.1128 / mcb.23.5.1688-1702.2003. PMC 151712. PMID 12588988.
^ ^A ^b Cabart P, Chew HK, Murphy S (červenec 2004). „BRCA1 spolupracuje s NUFIP a P-TEFb na aktivaci transkripce RNA polymerázou II“. Onkogen. 23 (31): 5316–29. doi:10.1038 / sj.onc.1207684. PMID 15107825.
^ Young TM, Wang Q, Pe'ery T, Mathews MB (září 2003). „Lidský protein obsahující I-mfa doménu, HIC, interaguje s cyklinem T1 a moduluje transkripci závislou na P-TEFb“. Mol. Buňka. Biol. 23 (18): 6373–84. doi:10.1128 / mcb.23.18.6373-6384.2003. PMC 193714. PMID 12944466.
^ Kiernan RE, Emiliani S, Nakayama K, Castro A, Labbé JC, Lorca T, Nakayama Ki K, Benkirane M (prosinec 2001). „Interakce mezi cyklinem T1 a SCF (SKP2) cílí na CDK9 pro ubikvitinaci a degradaci proteazomem“. Mol. Buňka. Biol. 21 (23): 7956–70. doi:10.1128 / MCB.21.23.7956-7970.2001. PMC 99964. PMID 11689688.
^ De Falco G, Bagella L, Claudio PP, De Luca A, Fu Y, Calabretta B, Sala A, Giordano A (leden 2000). „Fyzická interakce mezi CDK9 a B-Myb vede k potlačení autoregulace genu B-Myb“. Onkogen. 19 (3): 373–9. doi:10.1038 / sj.onc.1203305. PMID 10656684.
^ Fu TJ, Peng J, Lee G, Price DH, Flores O (prosinec 1999). „Cyklin K funguje jako regulační podjednotka CDK9 a podílí se na transkripci RNA polymerázy II“. J. Biol. Chem. 274 (49): 34527–30. doi:10.1074 / jbc.274.49.34527. PMID 10574912.
^ Garber ME, Mayall TP, Suess EM, Meisenhelder J, Thompson NE, Jones KA (září 2000). „Autofosforylace CDK9 reguluje vysokoafinitní vazbu komplexu tat-P-TEFb viru lidské imunodeficience typu 1 na TAR RNA“. Mol. Buňka. Biol. 20 (18): 6958–69. doi:10.1128 / mcb.20.18.6958-6969.2000. PMC 88771. PMID 10958691.
^ Kanazawa S, Soucek L, Evan G, Okamoto T, Peterlin BM (srpen 2003). „c-Myc získává P-TEFb pro transkripci, buněčnou proliferaci a apoptózu“. Onkogen. 22 (36): 5707–11. doi:10.1038 / sj.onc.1206800. PMID 12944920.
^ Marcello A, Ferrari A, Pellegrini V, Pegoraro G, Lusic M, Beltram F, Giacca M (květen 2003). „Nábor lidského cyklinu T1 do jaderných těl přímou interakcí s proteinem PML“. EMBO J.. 22 (9): 2156–66. doi:10.1093 / emboj / cdg205. PMC 156077. PMID 12727882.

Další čtení

Jeang KT (1998). "Tat, kináza asociovaná s Tat a transkripce". J. Biomed. Sci. 5 (1): 24–7. doi:10.1007 / BF02253352. PMID 9570510.
Yankulov K, Bentley D (1998). "Kontrola transkripce: Tat kofaktory a transkripční prodloužení". Curr. Biol. 8 (13): R447-9. doi:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID 9651670. S2CID 15480646.
Romano G, Kasten M, De Falco G, Micheli P, Khalili K, Giordano A (1999). "Regulační funkce Cdk9 a cyklinu T1 při expresi genu pro transaktivační dráhu HIV tat". J. Cell. Biochem. 75 (3): 357–68. doi:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K. PMID 10536359.
Cunningham AL, Li S, Juarez J, Lynch G, Alali M, Naif H (2000). „Úroveň infekce makrofágů HIV je určena interakcí genotypů virových a hostitelských buněk“. J. Leukoc. Biol. 68 (3): 311–7. PMID 10985245.
Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2001). "Více režimů transkripční regulace transaktivátorem HIV-1 Tat". IUBMB Life. 51 (3): 175–81. doi:10.1080/152165401753544241. PMID 11547919. S2CID 10931640.
Huigen MC, Kamp W, Nottet HS (2004). „Několik účinků transaktivačního proteinu HIV-1 na patogenezi infekce HIV-1“. Eur. J. Clin. Investovat. 34 (1): 57–66. doi:10.1111 / j.1365-2362.2004.01282.x. PMID 14984439. S2CID 29713968.
Rice AP, Herrmann CH (2003). "Regulace TAK / P-TEFb v CD4 + T lymfocytech a makrofázích". Curr. HIV Res. 1 (4): 395–404. doi:10.2174/1570162033485159. PMID 15049426.
Minghetti L, Visentin S, Patrizio M, Franchini L, Ajmone-Cat MA, Levi G (2004). „Několikanásobné působení proteinu Tat viru lidské imunodeficience typu 1 na funkce mikrogliálních buněk“. Neurochem. Res. 29 (5): 965–78. doi:10.1023 / B: NERE.0000021241.90133.89. PMID 15139295. S2CID 25323034.
Kino T, Pavlakis GN (2004). „Partnerské molekuly doplňkového proteinu Vpr viru lidské imunodeficience typu 1“. DNA Cell Biol. 23 (4): 193–205. doi:10.1089/104454904773819789. PMID 15142377.
Liou LY, Herrmann CH, Rice AP (2004). "Infekce HIV-1 a regulace funkce Tat v makrofágech". Int. J. Biochem. Cell Biol. 36 (9): 1767–75. doi:10.1016 / j.biocel.2004.02.018. PMID 15183343.
Pugliese A, Vidotto V, Beltramo T, Petrini S, Torre D (2005). "Přehled biologických účinků proteinu HIV-1 Tat". Cell Biochem. Funct. 23 (4): 223–7. doi:10,1002 / cbf.1147. PMID 15473004. S2CID 8408278.
Bannwarth S, Gatignol A (2005). „HIV-1 TAR RNA: cíl molekulárních interakcí mezi virem a jeho hostitelem“. Curr. HIV Res. 3 (1): 61–71. doi:10.2174/1570162052772924. PMID 15638724.
Gibellini D, Vitone F, Schiavone P, Re MC (2005). „HIV-1 tat protein a proliferace a přežití buněk: krátký přehled“. Nový mikrobiol. 28 (2): 95–109. PMID 16035254.
Peruzzi F (2006). „Mnohočetné funkce HIV-1 Tat: proliferace versus apoptóza“ (PDF). Přední. Biosci. 11: 708–717. doi:10.2741/1829. PMID 16146763. S2CID 12438136.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129315 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000011960 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9491887-5] Wei P, Garber ME, Fang SM, Fischer WH, Jones KA (březen 1998). „Nový cyklin C-typu asociovaný s CDK9 interaguje přímo s HIV-1 Tat a zprostředkovává jeho vysoce afinitní, smyčkově specifické navázání na TAR RNA.“ Buňka. 92 (4): 451–62. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80939-3. PMID 9491887. S2CID 16395032.

[pmid9499409-6] A ^b Peng J, Zhu Y, Milton JT, cena DH (duben 1998). "Identifikace více cyklinových podjednotek lidského P-TEFb". Genes Dev. 12 (5): 755–62. doi:10,1101 / gad.12.5.755. PMC 316581. PMID 9499409.

[7] „Entrez Gene: CCNT1 cyklin T1“.

[pmid12917420-8] Tian Y, Ke S, Chen M, Sheng T (listopad 2003). „Interakce mezi arylovým uhlovodíkovým receptorem a P-TEFb. Sekvenční nábor transkripčních faktorů a diferenciální fosforylace C-koncové domény RNA polymerázy II na promotoru cyp1a1“. J. Biol. Chem. 278 (45): 44041–8. doi:10,1074 / jbc.M306443200. PMID 12917420.

[pmid12832472-9] A ^b Michels AA, Nguyen VT, Fraldi A, Labas V, Edwards M, Bonnet F, Lania L, Bensaude O (červenec 2003). „RNA MAQ1 a 7SK interaguje s komplexy CDK9 / cyklin T transkripčně závislým způsobem“. Mol. Buňka. Biol. 23 (14): 4859–69. doi:10.1128 / mcb.23.14.4859-4869.2003. PMC 162212. PMID 12832472.

[pmid12588988-10] A ^b Hoque M, Young TM, Lee CG, Serrero G, Mathews MB, Pe'ery T (březen 2003). „Granulin růstového faktoru interaguje s cyklinem T1 a moduluje transkripci závislou na P-TEFb“. Mol. Buňka. Biol. 23 (5): 1688–702. doi:10.1128 / mcb.23.5.1688-1702.2003. PMC 151712. PMID 12588988.

[pmid15107825-11] A ^b Cabart P, Chew HK, Murphy S (červenec 2004). „BRCA1 spolupracuje s NUFIP a P-TEFb na aktivaci transkripce RNA polymerázou II“. Onkogen. 23 (31): 5316–29. doi:10.1038 / sj.onc.1207684. PMID 15107825.

[pmid12944466-12] Young TM, Wang Q, Pe'ery T, Mathews MB (září 2003). „Lidský protein obsahující I-mfa doménu, HIC, interaguje s cyklinem T1 a moduluje transkripci závislou na P-TEFb“. Mol. Buňka. Biol. 23 (18): 6373–84. doi:10.1128 / mcb.23.18.6373-6384.2003. PMC 193714. PMID 12944466.

[pmid11689688-13] Kiernan RE, Emiliani S, Nakayama K, Castro A, Labbé JC, Lorca T, Nakayama Ki K, Benkirane M (prosinec 2001). „Interakce mezi cyklinem T1 a SCF (SKP2) cílí na CDK9 pro ubikvitinaci a degradaci proteazomem“. Mol. Buňka. Biol. 21 (23): 7956–70. doi:10.1128 / MCB.21.23.7956-7970.2001. PMC 99964. PMID 11689688.

[pmid10656684-14] De Falco G, Bagella L, Claudio PP, De Luca A, Fu Y, Calabretta B, Sala A, Giordano A (leden 2000). „Fyzická interakce mezi CDK9 a B-Myb vede k potlačení autoregulace genu B-Myb“. Onkogen. 19 (3): 373–9. doi:10.1038 / sj.onc.1203305. PMID 10656684.

[pmid10574912-15] Fu TJ, Peng J, Lee G, Price DH, Flores O (prosinec 1999). „Cyklin K funguje jako regulační podjednotka CDK9 a podílí se na transkripci RNA polymerázy II“. J. Biol. Chem. 274 (49): 34527–30. doi:10.1074 / jbc.274.49.34527. PMID 10574912.

[pmid10958691-16] Garber ME, Mayall TP, Suess EM, Meisenhelder J, Thompson NE, Jones KA (září 2000). „Autofosforylace CDK9 reguluje vysokoafinitní vazbu komplexu tat-P-TEFb viru lidské imunodeficience typu 1 na TAR RNA“. Mol. Buňka. Biol. 20 (18): 6958–69. doi:10.1128 / mcb.20.18.6958-6969.2000. PMC 88771. PMID 10958691.

[pmid12944920-17] Kanazawa S, Soucek L, Evan G, Okamoto T, Peterlin BM (srpen 2003). „c-Myc získává P-TEFb pro transkripci, buněčnou proliferaci a apoptózu“. Onkogen. 22 (36): 5707–11. doi:10.1038 / sj.onc.1206800. PMID 12944920.

[pmid12727882-18] Marcello A, Ferrari A, Pellegrini V, Pegoraro G, Lusic M, Beltram F, Giacca M (květen 2003). „Nábor lidského cyklinu T1 do jaderných těl přímou interakcí s proteinem PML“. EMBO J.. 22 (9): 2156–66. doi:10.1093 / emboj / cdg205. PMC 156077. PMID 12727882.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]