HEXIM1 - HEXIM1

HEXIM1

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
2GD7, 3S9G

Identifikátory

HEXIM1, CLP1, EDG1, HIS1, MAQ1, hexamethylen bis-acetamid indukovatelný 1, hexamethylen bisacetamid indukovatelný 1, HEXIM P-TEFb komplexní podjednotka 1

Externí ID

OMIM: 607328 MGI: 2385923 HomoloGene: 31382 Genové karty: HEXIM1

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 17 (lidský)^[1]

Kapela	17q21.31	Start	45,148,502 bp^[1]
Kapela	17q21.31	Konec	45,152,101 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 11 (myš)^[2]

Kapela	11 \| 11 E1	Start	103,116,231 bp^[2]
Kapela	11 \| 11 E1	Konec	103,119,725 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny • snRNA vazba • Vazba 7SK snRNA • aktivita inhibitoru serin / threonin kinázy závislá na cyklinu
Buněčná složka	• nukleoplazma • cytoplazma • buněčné jádro
Biologický proces	• pozitivní regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53 • vývoj srdce • regulace transkripce, DNA-šablony • transkripce, chráněná DNA • negativní regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kinázy • negativní regulace transkripce, chráněná DNA • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • aktivace vrozené imunitní odpovědi • proces imunitního systému • vrozený imunitní systém
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


10614


192231


ENSG00000186834


ENSMUSG00000048878


O94992


Q8R409

RefSeq (mRNA)


NM_006460


NM_138753

RefSeq (protein)


NP_006451


NP_620092

Místo (UCSC)

Chr 17: 45,15 - 45,15 Mb

Chr 11: 103,12 - 103,12 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Protein HEXIM1 je protein že u lidí je kódován HEXIM1 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

HEXIM1 bylo prokázáno komunikovat s Cyklin T1^[6] a CDK9^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000186834 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000048878 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Huang F, Wagner M, Siddiqui MA (červenec 2002). "Struktura, exprese a funkční charakterizace myšího genu CLP-1". Gen. 292 (1–2): 245–59. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00596-6. PMID 12119119.
^ ^A ^b Michels AA, Nguyen VT, Fraldi A, Labas V, Edwards M, Bonnet F, Lania L, Bensaude O (červen 2003). „MAQ1 a 7SK RNA interagují s komplexy CDK9 / cyklin T způsobem závislým na transkripci“. Mol Cell Biol. 23 (14): 4859–69. doi:10.1128 / MCB.23.14.4859-4869.2003. PMC 162212. PMID 12832472.
^ „Entrez Gene: HEXIM1 hexamethylen bis-acetamid inducible 1“.
^ Kobbi L, Demey-Thomas E, Braye F, Proux F, Kolesnikova O, Vinh J, Poterszman A, Bensaude O (říjen 2016). „Evoluční konzervovaný peptid Hexim1 se váže na katalytické místo Cdk9 a inhibuje P-TEFb“. Proc Natl Acad Sci U S A. 113 (45): 12721–6. doi:10.1073 / pnas.1612331113. PMC 5111705. PMID 27791144.

Další čtení

Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (7): 3491–6. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Ouchida R, Kusuhara M, Shimizu N, Hisada T, Makino Y, Morimoto C, Handa H, Ohsuzu F, Tanaka H (2003). „Potlačení genové exprese závislé na NF-kappaB hexamethylenbisacetamidem indukovatelným proteinem HEXIM1 v lidských buňkách hladkého svalstva cév“. Geny buňky. 8 (2): 95–107. doi:10.1046 / j.1365-2443.2003.00618.x. PMID 12581153. S2CID 21478049.
Wittmann BM, Wang N, Montano MM (2003). "Identifikace nového inhibitoru růstu buněk prsu, který je down-regulován estrogeny a snížen v nádorech prsu". Cancer Res. 63 (16): 5151–8. PMID 12941847.
Yik JH, Chen R, Nishimura R, Jennings JL, Link AJ, Zhou Q (2003). „Inhibice transkripce kinázy P-TEFb (CDK9 / Cyclin T) a RNA polymerázy II koordinovanými akcemi HEXIM1 a 7SK snRNA“. Mol. Buňka. 12 (4): 971–82. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00388-5. PMID 14580347.
Paushkin SV, Patel M, Furia BS, Peltz SW, Trotta CR (2004). „Identifikace komplexu lidské endonukleázy odhaluje souvislost mezi sestřihem tRNA a tvorbou 3 'konce pre-mRNA“. Buňka. 117 (3): 311–21. doi:10.1016 / S0092-8674 (04) 00342-3. PMID 15109492. S2CID 16049289.
Yik JH, Chen R, Pezda AC, Samford CS, Zhou Q (2004). „Virus lidské imunodeficience typu 1, vazebná doména na RNA bohatá na arginin, bohatá na arginin, je nezbytná pro HEXIM1 k inhibici transkripce RNA polymerázy II prostřednictvím 7SK snRNA-zprostředkované inaktivace P-TEFb“. Mol. Buňka. Biol. 24 (12): 5094–105. doi:10.1128 / MCB.24.12.5094-5105.2004. PMC 419863. PMID 15169877.
Michels AA, Fraldi A, Li Q, Adamson TE, Bonnet F, Nguyen VT, Sedore SC, Cena JP, Cena DH, Lania L, Bensaude O (2005). „Vazba 7SK snRNA mění protein HEXIM1 na inhibitor P-TEFb (CDK9 / cyklin T)“. EMBO J.. 23 (13): 2608–19. doi:10.1038 / sj.emboj.7600275. PMC 449783. PMID 15201869.
Yik JH, Chen R, Pezda AC, Zhou Q (2005). „Kompenzační příspěvky HEXIM1 a HEXIM2 k udržení rovnováhy aktivních a neaktivních komplexů pozitivního transkripčního elongačního faktoru b pro řízení transkripce“. J. Biol. Chem. 280 (16): 16368–76. doi:10,1074 / jbc.M500912200. PMID 15713661.
Byers SA, Cena JP, Cooper JJ, Li Q, Cena DH (2005). „HEXIM2, protein související s HEXIM1, reguluje pozitivní transkripční elongační faktor b prostřednictvím asociace s 7SK“. J. Biol. Chem. 280 (16): 16360–7. doi:10,1074 / jbc.M500424200. PMID 15713662.
Schulte A, Czudnochowski N, Barboric M, Schönichen A, Blazek D, Peterlin BM, Geyer M (2005). "Identifikace cyklinové T-vazebné domény v Hexim1 a biochemická analýza její vazebné kompetice s HIV-1 Tat". J. Biol. Chem. 280 (26): 24968–77. doi:10,1074 / jbc.M501431200. PMID 15855166.
Wittmann BM, Fujinaga K, Deng H, Ogba N, Montano MM (2005). „Inhibitor růstu prsních buněk, estrogen down regulovaný gen 1, moduluje novou funkční interakci mezi estrogenovým receptorem alfa a transkripčním elongačním faktorem cyklinem T1“. Onkogen. 24 (36): 5576–88. doi:10.1038 / sj.onc.1208728. PMID 15940264.
Shimizu N, Ouchida R, Yoshikawa N, Hisada T, Watanabe H, Okamoto K, Kusuhara M, Handa H, Morimoto C, Tanaka H (2005). „HEXIM1 tvoří transkripčně abortní komplex s glukokortikoidním receptorem bez zapojení 7SK RNA a pozitivního transkripčního elongačního faktoru b“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (24): 8555–60. doi:10.1073 / pnas.0409863102. PMC 1150813. PMID 15941832.
Li Q, Price JP, Byers SA, Cheng D, Peng J, Price DH (2005). „Analýza velkého neaktivního komplexu P-TEFb naznačuje, že obsahuje jednu molekulu 7SK, dimer HEXIM1 nebo HEXIM2 a dvě molekuly P-TEFb obsahující Cdk9 fosforylovaný na threonin 186“. J. Biol. Chem. 280 (31): 28819–26. doi:10,1074 / jbc.M502712200. PMID 15965233.
Fraldi A, Varrone F, Napolitano G, Michels AA, Majello B, Bensaude O, Lania L (2006). "Inhibice aktivity Tat proteinem HEXIM1". Retrovirologie. 2: 42. doi:10.1186/1742-4690-2-42. PMC 1183248. PMID 15992410.
Dulac C, Michels AA, Fraldi A, Bonnet F, Nguyen VT, Napolitano G, Lania L, Bensaude O (2005). „Na transkripci závislé sdružení více pozitivních jednotek faktoru prodloužení transkripce k HEXIM multimeru“. J. Biol. Chem. 280 (34): 30619–29. doi:10,1074 / jbc.M502471200. PMID 15994294.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.