Curtis Huttenhower - Curtis Huttenhower

Curtis Huttenhower
Curtis Huttenhower.PNG
narozený (1981-06-18) 18. června 1981 (věk 39)[1]
Alma mater
OceněníCenu Overton (2015)[2]
Vědecká kariéra
Pole
InstituceHarvardská Univerzita
TezeAnalýza rozsáhlých sbírek genomických dat  (2009)
Doktorský poradceOlga Troyanská[9]
webová stránkawww.huttenhower.org

Curtis Huttenhower je Profesor z Výpočetní biologie a Bioinformatika na katedře Biostatistika Škola Veřejné zdraví, Harvardská Univerzita.[8][10][11][12]

Vzdělání

Huttenhower získal BS od Technologický institut Rose-Hulman v roce 2000, kde vystudoval informatiku, chemii a matematiku. Poté strávil dva roky jako vývojář softwaru pro Microsoft, pracující na platformě Microsoft Natural Language Development Platform. Huttenhower získal MS v výpočetní lingvistika z Univerzita Carnegie Mellon v roce 2003, kde studoval u Dannie Durand a Eric Nyberg. V roce 2003 se Huttenhower přestěhoval do Univerzita Princeton kde mu byla udělena a PhD v roce 2008 pro výzkum v genomika kontrolován Olga Troyanská. Jeho disertační práce měla název Analýza rozsáhlých sbírek genomických dat.[2][13]

Výzkum

Huttenhower se připojil k Harvard T.H. Chan School of Public Health v roce 2009 jako odborný asistent výpočetní biologie a bioinformatika,[2] v roce 2013 se stal docentem.[9] Huttenhowerova laboratoř intenzivně spolupracovala s NIH Projekt lidského mikrobiomu (HMP) k identifikaci a charakterizaci mikroorganismů nalezených ve spojení se zdravými i nemocnými lidmi.[3][4][5] Od roku 2015 vede jeden z navazujících center „HMP2“ pro charakterizaci střevního mikrobiálního ekosystému u zánětlivých onemocnění střev.[14]

Ceny a vyznamenání

Huttenhower obdržel NSF Cena CAREER v roce 2010 za výzkum v oblasti mikrobiálních komunit[9][15] a byl oceněn a Ocenění Presidential Early Career Award pro vědce a inženýry v roce 2012.[16] V roce 2015 byl Huttenhower vyznamenán Cenu Overton[2] z Mezinárodní společnost pro výpočetní biologii. Stejnou cenu získala jeho školitelka PhD Olga Troyanská v roce 2011.[17] Huttenhower je také členem redakčních rad pro akademické časopisy Genome Biology, Mikrobiom a BMC bioinformatika.[18][19][20]

Reference

  1. ^ Huttenhower, Curtis, 1981-, Knihovna Kongresu
  2. ^ A b C d Fogg, Christiana N .; Kovats, Diane E. (2015). „Cena ISCB Overton za rok 2015 byla udělena Curtisovi Huttenhowerovi“. PLOS výpočetní biologie. 11 (6): e1004319. Bibcode:2015PLSCB..11E4319F. doi:10.1371 / journal.pcbi.1004319. ISSN  1553-7358. PMC  4466272. PMID  26067840. otevřený přístup
  3. ^ A b Konsorcium pro projekt lidských mikrobiomů; Gevers, Dirk; Rytíř, Rob; Abubucker, Sahar; Badger, Jonathan H .; Chinwalla, Asif T .; Creasy, Heather H .; Earl, Ashlee M .; Fitzgerald, Michael G .; Fulton, Robert S .; Giglio, Michelle G .; Hallsworth-Pepin, Kymberlie; Lobos, Elizabeth A .; Madupu, Ramana; Magrini, Vincent; Martin, John C .; Mitreva, Makedonka; Muzny, Donna M .; Sodergren, Erica J .; Versalovic, James; Wollam, Aye M .; Worley, Kim C .; Wortman, Jennifer R .; Young, Sarah K .; Zeng, Qiandong; Aagaard, Kjersti M .; Abolude, Olukemi O .; Allen-Vercoe, Emma; Alm, Eric J .; et al. (2012). „Struktura, funkce a rozmanitost zdravého lidského mikrobiomu“. Příroda. 486 (7402): 207–14. Bibcode:2012Natur.486..207T. doi:10.1038 / příroda11234. PMC  3564958. PMID  22699609.
  4. ^ A b Konsorcium pro projekt lidských mikrobiomů; Nelson, Karen E .; Pop, Mihai; Creasy, Heather H .; Giglio, Michelle G .; Huttenhower, Curtis; Gevers, Dirk; Petrosino, Joseph F .; Abubucker, Sahar; Badger, Jonathan H .; Chinwalla, Asif T .; Earl, Ashlee M .; Fitzgerald, Michael G .; Fulton, Robert S .; Hallsworth-Pepin, Kymberlie; Lobos, Elizabeth A .; Madupu, Ramana; Magrini, Vincent; Martin, John C .; Mitreva, Makedonka; Muzny, Donna M .; Sodergren, Erica J .; Versalovic, James; Wollam, Aye M .; Worley, Kim C .; Wortman, Jennifer R .; Young, Sarah K .; Zeng, Qiandong; Aagaard, Kjersti M .; et al. (2012). „Rámec pro výzkum lidských mikrobiomů“. Příroda. 486 (7402): 215–21. Bibcode:2012Natur.486..215T. doi:10.1038 / příroda11209. PMC  3377744. PMID  22699610.
  5. ^ A b Abubucker, S; Segata, N; Goll, J; Schubert, A. M .; Izard, J; Cantarel, B.L .; Rodriguez-Mueller, B; Zucker, J; Thiagarajan, M; Henrissat, B; Bílá, O; Kelley, S. T .; Methé, B; Schloss, P. D .; Gevers, D; Mitreva, M; Huttenhower, C (2012). „Metabolická rekonstrukce metagenomických dat a jejich aplikace na lidský mikrobiom“. PLOS výpočetní biologie. 8 (6): e1002358. Bibcode:2012PLSCB ... 8E2358A. doi:10.1371 / journal.pcbi.1002358. PMC  3374609. PMID  22719234.
  6. ^ Huttenhower, C; Mutungu, K. T .; Indik, N; Yang, W; Schroeder, M; Forman, J. J .; Troyanskaya, O. G .; Coller, H. A. (2009). „Podrobně popsané regulační sítě prostřednictvím rozsáhlé integrace dat“. Bioinformatika. 25 (24): 3267–74. doi:10.1093 / bioinformatika / btp588. PMC  2788929. PMID  19825796.
  7. ^ Huttenhower, C; Hofmann, O (2010). „Rychlý průvodce těžbou genomických dat ve velkém měřítku“. PLOS výpočetní biologie. 6 (5): e1000779. Bibcode:2010PLSCB ... 6E0779H. doi:10.1371 / journal.pcbi.1000779. PMC  2877728. PMID  20523745.
  8. ^ A b Curtis Huttenhower publikace indexované podle Google Scholar
  9. ^ A b C „Curtis Huttenhower CV“ (PDF). huttenhower.org. 2015. Archivovány od originál (PDF) dne 02.03.2015.
  10. ^ Chi, A; Huttenhower, C; Geer, L. Y .; Coon, J. J .; Syka, J. E .; Bai, D.L .; Shabanowitz, J; Burke, D. J .; Troyanskaya, O. G .; Hunt, D. F. (2007). "Analýza fosforylačních míst na proteinech ze Saccharomyces cerevisiae hmotnostní spektrometrií s elektronovým přenosem disociace (ETD)". Sborník Národní akademie věd. 104 (7): 2193–8. Bibcode:2007PNAS..104.2193C. doi:10.1073 / pnas.0607084104. PMC  1892997. PMID  17287358.
  11. ^ Huttenhower, C; Knight, R; Brown, C. T .; Caporaso, J. G .; Clemente, J. C .; Gevers, D; Franzosa, E. A .; Kelley, S. T .; Rytíři, D; Ley, R.E .; Mahurkar, A; Ravel, J; Vědci pro rozvoj mikrobiomového výzkumu; White, O (2014). „Pokrok v komunitě výzkumu mikrobiomů“. Buňka. 159 (2): 227–30. doi:10.1016 / j.cell.2014.09.022. PMC  4221798. PMID  25303518.
  12. ^ Publikace Curtise Huttenhowera indexováno podle Scopus bibliografická databáze. (vyžadováno předplatné)
  13. ^ Huttenhower, Curtis (2009). Analýza rozsáhlých sbírek genomických dat (Disertační práce). Univerzita Princeton. OCLC  298182845.
  14. ^ „Home - Curtis Huttenhower - Harvard T.H. Chan School of Public Health“. www.hsph.harvard.edu. Citováno 4. srpna 2015.
  15. ^ „Curtis Huttenhower vyhrává nejlepší ocenění na juniorské fakultě v bioinformatice“. hsph.harvard.edu. 2015-02-11. Citováno 4. srpna 2015.
  16. ^ „Prezident Obama vyznamenává vědce a inženýry v oblasti počáteční kariéry - NSF - National Science Foundation“. www.nsf.gov. Citováno 4. srpna 2015.
  17. ^ Mullins, Justin; Morrison McKay, BJ (2. června 2011). „International Society for Computational Biology Honors Michael Ashburner and Olga Troyanskaya with Top Bioinformatics / Computational Biology Awards for 2011“. PLOS výpočetní biologie. 7 (6): e1002081. Bibcode:2011PLSCB ... 7E2081M. doi:10.1371 / journal.pcbi.1002081. PMC  3107244.
  18. ^ „Genome Biology - Redakční rada“. www.genomebiology.com. Citováno 4. srpna 2015.
  19. ^ „Mikrobiom - redakční rada“. www.microbiomejournal.com. Citováno 4. srpna 2015.
  20. ^ „BMC Bioinformatics - Redakční rada“. www.biomedcentral.com. Citováno 4. srpna 2015.