Cryptobacterium curtum - Cryptobacterium curtum
Cryptobacterium curtum | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Doména: | |
Kmen: | |
Třída: | |
Objednat: | |
Rodina: | |
Rod: | |
Druh: | C. curtum |
Binomické jméno | |
Cryptobacterium curtum Nakazawa a kol. 1999[1] |
Cryptobacterium curtum je Grampozitivní anaerobní tyčinkové bakterie izolované z lidských úst.[2]
Popis
Cryptobacterium curtum jsou Grampozitivní, obligátně anaerobní, nesporotvorné a tyčinkovité bakterie. C. curtum byl izolován od a parodontální kapesní vzorek dospělého pacienta a od nekrotické zubní dřeň, resp. C. curtum lze také izolovat z lidských orálních a zubních infekcí, jako jsou záněty pulpů, pokročilé kaz, zubní abscesy nebo paradentóza. Zatímco C. curtum Nezdá se, že je přítomen v normální mikroflóře, což je téměř dvojnásobná velikost populace, když je přítomna paradentóza. Buňky jsou velmi krátké a mohou se vyskytovat jednotlivě nebo v masách. Tyto buňky jsou ve většině biochemických testů inertní. Nehydrolyzují škrob nebo aesculin. Nemohou redukovat dusičnany ani nerostou v přítomnosti nebo nepřítomnosti sacharidů. C. curutm také měl negativní výsledky pro indol, kataláza, a ureáza testy.[3]
Analýza genomu
Podle Mavrommatise a kolegů genom z C. curtum je 1 617 804 základní páry dlouho. Z roku 1422 geny 1364 genů kódujících proteiny a bylo 58 RNA. Většina genomu (78,5%) je tvořena geny kódujícími proteiny. A 16S Analýza genové sekvence rRNA odhalila, že tyto dva izoláty představují odlišnou linii v rodině Coriobacteriaceae, mezi sousedními rody Eggerthella a Slackia. Po sekvenování zjistili, že DNA G + C obsah je 50–51 molekulárních%.[3]
Metabolické vlastnosti
Cryptobacterium curtum je v mnoha konvenčních biochemických testech asacharolytický a nereaktivní.[4] Místo toho je schopen degradovat arginin a další aminokyseliny nalezené v ústních dutinách pomocí arginin deimináza cesta. Tato bakterie je schopna degradovat arginin a produkovat značné množství citrulin, ornitin a amoniak. Arginin a citrulin podporují růst a reprodukci C. curtum.[5]
Reference
- ^ Parte, A.C. „Cryptobacterium“. LPSN.
- ^ Nakazawa F, Poco SE, Ikeda T a kol. (1999). "Cryptobacterium curtum gen. nov., sp. nov., nový rod grampozitivních anaerobních tyčinek izolovaných z lidských ústních dutin ". Int. J. Syst. Bacteriol. 49 (3): 1193–200. doi:10.1099/00207713-49-3-1193. PMID 10425779.
- ^ A b Mavrommatis K, Pukall R, Rohde C a kol. (2009). "Kompletní sekvence genomu Cryptobacterium curtum typový kmen (12-3) ". Standardy v genomických vědách. 1 (2): 93–100. doi:10,4056 / sigs.12260. PMC 3035227. PMID 21304644.
- ^ Downes J, Munson MA, Spratt DA a kol. (2001). "Charakterizace kmenů podobných Eubacterium izolovaných z orálních infekcí". J. Med. Microbiol. 50 (11): 947–51. doi:10.1099/0022-1317-50-11-947. PMID 11699590.[trvalý mrtvý odkaz ]
- ^ Uematsu H, Sato N, Djais A, Hoshino E (2006). "Odbourávání argininu Slackia exigua ATCC 700122 a Cryptobacterium curtum ATCC 700683 ". Perorální mikrobiol. Immunol. 21 (6): 381–4. doi:10.1111 / j.1399-302X.2006.00307.x. PMID 17064396.