Chromová stínová doména - Chromo shadow domain
| Chromová stínová doména | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 stínová doména hp1 chromo v komplexu s motivem pxvxl caf-1 | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Chromo_shadow | ||||||||
| Pfam | PF01393 | ||||||||
| Pfam klan | CL0049 | ||||||||
| InterPro | IPR008251 | ||||||||
| SCOP2 | 1e0b / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd00034 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se chromo stínová doména je proteinová doména který je vzdáleně příbuzný chromodoména. Vždy se vyskytuje ve spojení s chromodoménou.[1] Mezi proteiny obsahující chromovou stínovou doménu patří Drosophila a člověk heterochromatin protein Su (var) 205 (HP1); a savčí modifikátor 1 a modifikátor 2.
Chromové stínové domény se samy agregují a spojují nukleosomy na které jsou vázány jejich bílkoviny, a tím kondenzují chromatin region, se kterým jsou spojeni. Kondenzovaný chromatin nemůže být přepsal protože transkripční faktory a enzymy nejsou schopny v této formě získat přístup k sekvenci DNA. Proto proteiny obsahující chromoshadowovou doménu potlačují transkripci genů.[2]
Reference
- ^ Aasland R, Stewart AF (srpen 1995). „Stínová doména chromo, druhá chromo doména v proteinu vázajícím heterochromatin 1, HP1“. Výzkum nukleových kyselin. 23 (16): 3168–73. doi:10.1093 / nar / 23.16.3168. PMC 307174. PMID 7667093.
- ^ Yamamoto K, Sonoda M (únor 2003). „Pro přímou vazbu na histonmethyltransferázu, SUV39H1 je nutná vlastní interakce heterochromatinového proteinu 1“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 301 (2): 287–92. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03021-8. PMID 12565857.
externí odkazy
- Zdroj eukaryotického lineárního motivu třída motivů LIG_HP1_1