Carlavirus - Carlavirus
| Carlavirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | Riboviria |
| Království: | Orthornavirae |
| Kmen: | Kitrinoviricota |
| Třída: | Alsuviricetes |
| Objednat: | Tymovirales |
| Rodina: | Betaflexiviridae |
| Podčeleď: | Quinvirinae |
| Rod: | Carlavirus |
| Zadejte druh | |
| Latentní virus karafiátu | |
| Druh | |
Viz text | |
| Synonyma | |
Latentní virus karafiátu skupina | |
Carlavirus, dříve známý jako „Latentní virus karafiátu skupina ", je rod viry v pořadí Tymovirales, v rodině Betaflexiviridae. Rostliny slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje 53 druhů v tomto rodu, včetně druhů druhů Latentní virus karafiátu. Mezi nemoci spojené s tímto rodem patří: příznaky mozaiky a ringspotu.[1][2]
Popis
Carlavirus je popsána v 9. zprávě ICTV (2009).[3] Rod se vyznačuje tím, že má šest ORF (Otevřete rámečky na čtení ) včetně TGB (Triple Gene Block ). Viry jsou přenášeny hmyzem.
Taxonomie
Rod byl poprvé navržen v první zprávě ICTV v roce 1971 jako „skupina latentního viru karafiátu“, ale v roce 1975 byl přejmenován na „Carlavirus Group“ a jako rod Carlavirus v roce 1995 (6. zpráva). V roce 2005 (8. zpráva) byla umístěna do Flexiviridae rodina, která byla dříve nepřiřazena.[4] Současná pozice v 9. zprávě (2009) jako rod rodiny Betaflexiviridae je odvozeno z následného rozdělení na Flexiviridae.
Skupina: ssRNA (+)
- Rodina: Betaflexiviridae
- Rod: Carlavirus
- Latentní virus Aconitum
- Latentní virus amerického chmele
- Atractylodes skvrnitý virus
- Borůvkový virus
- Virus mozaiky motýla
- Kaktusový virus 2
- Latentní virus kapary
- Latentní virus karafiátu
- Virus chryzantémy B
- Cole latentní virus
- Virus nekrózy žil Coleus
- Virus mírné skvrny Cowpea
- Virus odstraňující žíly okurek
- Latentní virus pampelišky
- Daphne virus S.
- Bezpříznakový virus bezinky
- Společný latentní virus česneku
- Helenium virus S.
- Virus mozaiky Helleborus
- Virus nekrózy Helleborus
- Latentní virus Hippeastrum
- Latentní virus zimolezu
- Hop latentní virus
- Virus chmelové mozaiky
- Virus chlorotické skvrnitosti hortenzie
- Latentní virus hortenzie
- Kalancho ‰ latentní virus
- Virus nekrotického ringspotu Ligustrum
- Virus lila skvrnitý
- Virus bez příznaků Lily
- Virus spojený se žlutým melounem
- Virus Mirabilis jalapa mottle
- Latentní virus moruši
- Virus nekrózy žil pižma
- Společný latentní virus narcisu
- Nerinní latentní virus
- Latentní virus Passiflora
- Virus hrachu
- Phlox virus B
- Phlox virus M.
- Phlox virus S.
- Virus mozaiky topolu
- Latentní virus brambor
- Bramborový virus M.
- Virus brambor P
- Bramborový virus S.
- Virus mozaiky červené jetele
- Latentní virus šalotky
- Latentní virus Sint-Janovy cibule
- Jahodový pseudo mírný virus žluté hrany
- Virus C6 ze sladkých brambor
- Virus chlorotických skvrn na sladké brambory
- Latentní virus Verbena
Virologie
Viriony jsou neobalené, vláknité, 610–700 nanometrů (nm) a průměr 12–15 nm.
Lineární 5,8–9 kilobázový genom je pozitivní smysl, jednořetězcová RNA. 3 'konec je polyadenylovaný. U některých druhů je konec 5 'uzavřen. Genom kóduje 3 až 6 proteinů včetně obalového proteinu umístěného na 3 'konci a RNA-dependentní RNA polymeráza nachází se na 5 'konci genomu.
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická a je lysogenní. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne penetrací do hostitelské buňky. Replikace sleduje model replikace pozitivního řetězce RNA viru. Transkripce pozitivního řetězce RNA viru je metoda transkripce. Virus opouští hostitelskou buňku tripartitním virovým pohybem bez tubulů. Rostliny slouží jako přirozený hostitel.[1]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Carlavirus | Rostliny | Žádný | Virové hnutí; mechanické očkování | Virové hnutí | Cytoplazma | Cytoplazma | Mechanické: hmyz |
Přenos
Infekce se občas šíří o mšice v semiperzistentním režimu, to znamená, že vektor je infekční několik hodin. (Pimentel) Některé druhy jsou přenášeny Bemisia tabaci v semiperzistentním režimu nebo skrze semeno.[5] Většina druhů infikuje pouze několik hostitelů a způsobuje infekce s malými nebo žádnými příznaky, například latentní virus amerického chmele a virus bez příznaků lilie. Některé, jako je virus borůvek a virus topolové mozaiky, způsobují vážná onemocnění. (Podporovat)
Reference
- ^ A b „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
- ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
- ^ Král 2012.
- ^ Adams, M. J .; Antoniw, J. F .; Bar-Joseph, M .; Brunt, A. A .; Candresse, T .; Foster, G. D .; Martelli, G. P .; Milne, R. G .; Fauquet, C. M. (2. května 2004). „Virology Division News: Nová rodina rostlinných virů Flexiviridae a hodnocení molekulárních kritérií pro vymezení druhů“. Archivy virologie. 149 (5): 1045–60. doi:10.1007 / s00705-004-0304-0. PMID 15098118. S2CID 34493607.
- ^ Astier S. Principy rostlinné virologie str.78
Bibliografie
- Martelli, Giovanni P .; Saldarelli, Pasquale (2012). "Carlavirus". V Tidoně, Christian; Gholamreza, Darai (eds.). Springerův index virů (2. vyd.). New York, NY: Springer. 521–532. ISBN 978-0387959191. Citováno 8. prosince 2014.
- Astier, S. Principy rostlinné virologie
- Fostere, Gary. „Izolace karlaviru a extrakce RNA.“ Foster, Gary D. a Sally C. Taylorin. Virologické protokoly rostlin: Od izolace virů po transgenní rezistenci. Strana 145. 1998. Humana Press. Online. 13. února 2008.
- Pimentel, David. Encyclopedia of Pest Management.Strana 407. CRC Stiskněte. 2002 / Knihy Google. Online 13. února 2008.. ISBN 0824706323
- King, Andrew M. Q .; et al., eds. (2012). "Carlavirus". Taxonomie virů: klasifikace a nomenklatura virů: devátá zpráva Mezinárodního výboru pro taxonomii virů. London: Academic Press. p. 924. ISBN 978-0123846846. Citováno 9. prosince 2014.