Aminokyselinová transamináza s rozvětveným řetězcem 1 - Branched chain amino acid transaminase 1

BCAT1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2ABJ, 2COG, 2 COI, 2COJ
Identifikátory
Aliasy	BCAT1, BCATC, BCT1, ECA39, MECA39, PNAS121, PP18, aminokyselinová transamináza s rozvětveným řetězcem 1
Externí ID	OMIM: 113520 MGI: 104861 HomoloGene: 20320 Genové karty: BCAT1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	24,949,101 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	145,076,184 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transamináz; • Aktivita L-leucin transaminázy; • identická vazba na protein; • katalytická aktivita; • Aktivita L-valin transaminázy; • Aktivita L-isoleucin transaminázy; • aktivita transferázy; • aktivita transaminázy s rozvětveným řetězcem-aminokyselinou;
Buněčná složka	• cytoplazma; • mitochondrie; • cytosol;
Biologický proces	• metabolismus; • proces biosyntézy aminokyselin s rozvětveným řetězcem; • buněčná proliferace; • proces biosyntézy buněčných aminokyselin; • metabolický proces s rozvětveným řetězcem aminokyselin; • proces biosyntézy leucinů; • katabolický proces s rozvětveným řetězcem aminokyselin; • proces biosyntézy valinu; • G1 / S přechod mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	586
	12035
	ENSG00000060982
	ENSMUSG00000030268
	P54687
	P24288
	NM_001178091; NM_001178092; NM_001178093; NM_001178094; NM_005504
	NM_001024468; NM_007532
	NP_001171562; NP_001171563; NP_001171564; NP_001171565; NP_005495
	NP_001019639; NP_031558
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Aminokyselinová transamináza s rozvětveným řetězcem 1 je protein že u lidí je kódován BCAT1 gen.^[5] Je to první enzym v cestě degradace aminokyselin s rozvětveným řetězcem (BCAA) a usnadňuje reverzibilní transaminaci BCAA a glutamátu. BCAT1 sídlí v cytoplazma, zatímco jeho izoforma, BCAT2, se nachází v mitochondrie.

Funkce

Tento gen kóduje cytosolickou formu enzym aminokyselinová transamináza s rozvětveným řetězcem. Tento enzym katalyzuje reverzibilní transaminace alfa-ketokyselin s rozvětveným řetězcem (BCKA) do aminokyseliny s rozvětveným řetězcem (BCAA) Valine, Leucin a Isoleucin, které jsou nezbytné pro růst buněk. U lidí je jeho primární rolí deaminace BCAA, protože u lidí chybí enzymy de novo syntéza BCKA. Příslušné kofaktory jsou alfa-ketoglutarát a glutamát. Příslušné reakce jsou:

L-leucin + 2-oxoglutarát = 4-methyl-2-oxopentanoát + L-glutamát

L-isoleucin + 2-oxoglutarát = (S) -3-methyl-2-oxopentanoát + L-glutamát

L-valin + 2-oxoglutarát = 3-methyl-2-oxobutanoát + L-glutamát ^[6]

Buňky mohou dále degradovat BCKA pomocí Komplex ketokyseliny dehydrogenázy s rozvětveným řetězcem ze kterých mohou uhlíkové hlavní řetězce každé BCAA vstoupit do odlišných degradačních drah.^[7]

Onkogenní transkripční faktor Moje C se často uvádí, že řídí výraz BCAT1.^[8]^[9]^[10]

Klinický význam

Porucha transaminace aminokyselinami s rozvětveným řetězcem byla přičítána dvěma různým klinickým poruchám: hypervalinemie a hyperleucin-isoleucinemie.^[11] Protože existuje také gen kódující mitochondriální formu tohoto enzymu (BCAT2), mohou k těmto poruchám přispívat mutace v kterémkoli z těchto genů.

Nadměrná exprese BCAT1 byla spojena s řadou rakoviny, mezi nimi glioblastom,^[12] rakovina prsu,^[13] Akutní myeloidní leukémie,^[14] rakovina žaludku^[15] a chronická myeloidní leukémie.^[16]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000060982 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030268 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrezův gen: rozvětvená aminokyselinová transamináza 1". Citováno 2016-04-21.
^ „BCAT1 - aminokyselina s rozvětveným řetězcem, aminotransferáza, cytosolická - Homo sapiens (člověk) - gen a protein BCAT1“. www.uniprot.org. Citováno 2018-08-06.
^ „BCKDH v cestě degradace BCAA“. Genome.jp. 6. srpna 2018. Citováno 6. srpna 2018.
^ Zhou W, Feng X, Ren C, Jiang X, Liu W, Huang W, Liu Z, Li Z, Zeng L, Wang L, Zhu B, Shi J, Liu J, Zhang C, Liu Y, Yao K (červen 2013 ). „Nadměrná exprese BCAT1, cílového genu c-Myc, indukuje buněčnou proliferaci, migraci a invazi do karcinomu nosohltanu“. Molekulární rakovina. 12: 53. doi:10.1186/1476-4598-12-53. PMC 3698204. PMID 23758864.
^ Schuldiner O, Eden A, Ben-Yosef T, Yanuka O, Simchen G, Benvenisty N (červenec 1996). „ECA39, konzervovaný gen regulovaný u myší c-Myc, se podílí na regulaci buněčného cyklu G1 / S v kvasinkách“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (14): 7143–8. doi:10.1073 / pnas.93.14.7143. PMC 38950. PMID 8692959.
^ Ben-Yosef T, Eden A, Benvenisty N (červenec 1998). "Charakterizace myších genů BCAT: Bcat1, cíl c-Myc a jeho homolog, Bcat2". Savčí genom. 9 (7): 595–7. doi:10,1007 / s003359900825. PMID 9657861. S2CID 21062787.
^ Wang XL, Li CJ, Xing Y, Yang YH, Jia JP (září 2015). „Hypervalinemie a hyperleucin-isoleucinémie způsobená mutacemi v genu pro aminotransferázu s rozvětveným řetězcem pro aminokyseliny“. Journal of Inherited Metabolic Disease. 38 (5): 855–61. doi:10.1007 / s10545-015-9814-z. PMID 25653144. S2CID 24253640.
^ Tönjes M, Barbus S, Park YJ, Wang W, Schlotter M, Lindroth AM a kol. (Červenec 2013). „BCAT1 podporuje buněčnou proliferaci prostřednictvím katabolismu aminokyselin v gliomech nesoucích divoký typ IDH1“. Přírodní medicína. 19 (7): 901–908. doi:10,1038 / nm. 3217. PMC 4916649. PMID 23793099.
^ Thewes V, Simon R, Hlevnjak M, Schlotter M, Schroeter P, Schmidt K a kol. (Červenec 2017). „Aminokyselinová transamináza 1 s rozvětveným řetězcem udržuje růst antiestrogen-rezistentního a ERα-negativního karcinomu prsu“. Onkogen. 36 (29): 4124–4134. doi:10.1038 / dne 2017.32. PMID 28319069. S2CID 25098058.
^ Raffel S, Falcone M, Kneisel N, Hansson J, Wang W, Lutz C a kol. (Listopad 2017). „BCAT1 omezuje hladiny αKG v kmenových buňkách AML, což vede k hypermethylaci DNA podobné IDHmut“. Příroda. 551 (7680): 384–388. doi:10.1038 / příroda24294. PMID 29144447. S2CID 205261267.
^ Xu Y, Yu W, Yang T, Zhang M, Liang C, Cai X, Shao Q (květen 2018). „Nadměrná exprese BCAT1 je prognostický marker u rakoviny žaludku“. Lidská patologie. 75: 41–46. doi:10.1016 / j.humpath.2018.02.003. PMID 29447920.
^ Hattori A, Tsunoda M, Konuma T, Kobayashi M, Nagy T, Glushka J, Tayyari F, McSkimming D, Kannan N, Tojo A, Edison AS, Ito T (květen 2017). „Postup rakoviny přeprogramovaným metabolizmem BCAA u myeloidní leukémie“. Příroda. 545 (7655): 500–504. doi:10.1038 / příroda22314. PMC 5554449. PMID 28514443.

Další čtení

Yoshikawa R, Yanagi H, Shen CS, Fujiwara Y, Noda M, Yagyu T, Gega M, Oshima T, Yamamura T, Okamura H, Nakano Y, Morinaga T, Hashimoto-Tamaoki T (září 2006). „ECA39 je nový vzdálený biomarker související s metastázami u kolorektálního karcinomu“. World Journal of Gastroenterology. 12 (36): 5884–9. doi:10,3748 / wjg.v12.i36.5884. PMC 4100673. PMID 17007058.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000060982 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030268 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "Entrezův gen: rozvětvená aminokyselinová transamináza 1". Citováno 2016-04-21.

[6] „BCAT1 - aminokyselina s rozvětveným řetězcem, aminotransferáza, cytosolická - Homo sapiens (člověk) - gen a protein BCAT1“. www.uniprot.org. Citováno 2018-08-06.

[7] „BCKDH v cestě degradace BCAA“. Genome.jp. 6. srpna 2018. Citováno 6. srpna 2018.

[8] Zhou W, Feng X, Ren C, Jiang X, Liu W, Huang W, Liu Z, Li Z, Zeng L, Wang L, Zhu B, Shi J, Liu J, Zhang C, Liu Y, Yao K (červen 2013 ). „Nadměrná exprese BCAT1, cílového genu c-Myc, indukuje buněčnou proliferaci, migraci a invazi do karcinomu nosohltanu“. Molekulární rakovina. 12: 53. doi:10.1186/1476-4598-12-53. PMC 3698204. PMID 23758864.

[9] Schuldiner O, Eden A, Ben-Yosef T, Yanuka O, Simchen G, Benvenisty N (červenec 1996). „ECA39, konzervovaný gen regulovaný u myší c-Myc, se podílí na regulaci buněčného cyklu G1 / S v kvasinkách“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (14): 7143–8. doi:10.1073 / pnas.93.14.7143. PMC 38950. PMID 8692959.

[10] Ben-Yosef T, Eden A, Benvenisty N (červenec 1998). "Charakterizace myších genů BCAT: Bcat1, cíl c-Myc a jeho homolog, Bcat2". Savčí genom. 9 (7): 595–7. doi:10,1007 / s003359900825. PMID 9657861. S2CID 21062787.

[pmid25653144-11] Wang XL, Li CJ, Xing Y, Yang YH, Jia JP (září 2015). „Hypervalinemie a hyperleucin-isoleucinémie způsobená mutacemi v genu pro aminotransferázu s rozvětveným řetězcem pro aminokyseliny“. Journal of Inherited Metabolic Disease. 38 (5): 855–61. doi:10.1007 / s10545-015-9814-z. PMID 25653144. S2CID 24253640.

[12] Tönjes M, Barbus S, Park YJ, Wang W, Schlotter M, Lindroth AM a kol. (Červenec 2013). „BCAT1 podporuje buněčnou proliferaci prostřednictvím katabolismu aminokyselin v gliomech nesoucích divoký typ IDH1“. Přírodní medicína. 19 (7): 901–908. doi:10,1038 / nm. 3217. PMC 4916649. PMID 23793099.

[13] Thewes V, Simon R, Hlevnjak M, Schlotter M, Schroeter P, Schmidt K a kol. (Červenec 2017). „Aminokyselinová transamináza 1 s rozvětveným řetězcem udržuje růst antiestrogen-rezistentního a ERα-negativního karcinomu prsu“. Onkogen. 36 (29): 4124–4134. doi:10.1038 / dne 2017.32. PMID 28319069. S2CID 25098058.

[14] Raffel S, Falcone M, Kneisel N, Hansson J, Wang W, Lutz C a kol. (Listopad 2017). „BCAT1 omezuje hladiny αKG v kmenových buňkách AML, což vede k hypermethylaci DNA podobné IDHmut“. Příroda. 551 (7680): 384–388. doi:10.1038 / příroda24294. PMID 29144447. S2CID 205261267.

[15] Xu Y, Yu W, Yang T, Zhang M, Liang C, Cai X, Shao Q (květen 2018). „Nadměrná exprese BCAT1 je prognostický marker u rakoviny žaludku“. Lidská patologie. 75: 41–46. doi:10.1016 / j.humpath.2018.02.003. PMID 29447920.

[16] Hattori A, Tsunoda M, Konuma T, Kobayashi M, Nagy T, Glushka J, Tayyari F, McSkimming D, Kannan N, Tojo A, Edison AS, Ito T (květen 2017). „Postup rakoviny přeprogramovaným metabolizmem BCAA u myeloidní leukémie“. Příroda. 545 (7655): 500–504. doi:10.1038 / příroda22314. PMC 5554449. PMID 28514443.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]