Ascidian mitochondriální kód - Ascidian mitochondrial code
Ascidiánský mitochondriální kód (překladová tabulka 13) je genetický kód nalezený v mitochondriích Ascidia.
Kód
AA = FFLLSSSSYY ** CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSGGVVVVAAAADDEEGGGGZačíná = --- M ------------------------------ MM -------------- -M ------------Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Základny: adenin (A), cytosin (C), guanin (G) a tymin (T) nebo uracil (U).
Aminokyseliny: Alanin (Ala, A), Arginin (Arg, R), Asparagin (Asn, N), Kyselina asparagová (Asp, D), Cystein (Cys, C), Kyselina glutamová (Glu, E), Glutamin (Gln, Q), Glycin (Gly, G), Histidin (Jeho, H), Isoleucin (Ile, I), Leucin (Leu, L), Lysin (Lys, K), Methionin (Met, M), Fenylalanin (Phe, F), Prolin (Pro, P), Serine (Ser, S), Threonin (Thr, T), Tryptofan (Trp, W), Tyrosin (Tyr, Y), Valine (Val, V)
Rozdíly od standardního kódu
| Kodony DNA | Kodony RNA | Tento kód (13) | Standardní kód (1) | |
|---|---|---|---|---|
| AGA | AGA | Gly (G) | Arg (R) | |
| AGG | AGG | Gly (G) | Arg (R) | |
| ATA | AUA | Se setkal (M) | Ile (Já) | |
| TGA | UGA | Trp (Ž) | STOP = Ter (*) |
Systematický rozsah a komentáře
Existují důkazy z fylogeneticky rozmanitého vzorku pláštěnci (Urochordata ) kód AGA a AGG pro glycin. V jiných organismech kód AGA / AGG buď arginin nebo serin a na obratlovcích mitochondrie kódují STOP. Důkaz translace glycinu na AGA / AGG byl poprvé nalezen v roce 1993 v roce 2006 Pyura stolonifera[1] a Halocynthia roretzi.[2] Poté to bylo potvrzeno sekvenováním tRNA[3] a sekvenování celých mitochondriálních genomů.[4][5]
Alternativní iniciační kodony
- ATA, GTG a TTG[5]
- ATT je počáteční kodon pro gen CytB v Halocynthia roretzi.[6]
Viz také
Reference
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.[7]
- ^ Durrheim GA, Corfield VA, Harley EH, Ricketts MH (1993). „Nukleotidová sekvence cytochromoxidázy (podjednotka III) z mitochondrie tunikátu Pyura stolonifera: důkaz, že AGR kóduje glycin ". Výzkum nukleových kyselin. 21 (15): 3587–8. doi:10.1093 / nar / 21.15.3587. PMC 331473. PMID 8393993.
- ^ Yokobori S, Ueda T, Watanabe K (leden 1993). "Kodony AGA a AGG jsou čteny jako glycin v ascidian mitochondriích". Journal of Molecular Evolution. 36 (1): 1–8. doi:10.1007 / bf02407301. PMID 8381878. S2CID 12603691.
- ^ Kondow A, Suzuki T, Yokobori S, Ueda T, Watanabe K (červen 1999). „Extra tRNAGly (U * CU) nalezený v ascidianských mitochondriích odpovědných za dekódování neuniverzálních kodonů AGA / AGG jako glycinu“. Výzkum nukleových kyselin. 27 (12): 2554–9. doi:10.1093 / nar / 27.12.2554. PMC 148460. PMID 10352185.
- ^ Yokobori S, Ueda T, Feldmaier-Fuchs G, Pääbo S, Ueshima R, Kondow A, Nishikawa K, Watanabe K (prosinec 1999). „Kompletní sekvence DNA mitochondriálního genomu ascidiána Halocynthia roretzi (Chordata, Urochordata) ". Genetika. 153 (4): 1851–62. PMC 1460873. PMID 10581290.
- ^ A b Yokobori S, Watanabe Y, Oshima T (listopad 2003). "Mitochondriální genom Ciona savignyi (Urochordata, Ascidiacea, Enterogona): srovnání genového uspořádání a genů tRNA s Halocynthia roretzi mitochondriální genom ". Journal of Molecular Evolution. 57 (5): 574–87. doi:10.1007 / s00239-003-2511-9. PMID 14738316. S2CID 19474615.
- ^ Gissi C, Pesole G (2003). "Mapování transkriptu a anotace genomu ascidian mtDNA pomocí dat EST". Výzkum genomu. 13 (9): 2203–12. doi:10,1101 / gr. 1227803. PMC 403730. PMID 12915488.
- ^ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. „Genetické kódy“. Prohlížeč taxonomie. National Center for Biotechnology Information (NCBI), USA National Library of Medicine. Citováno 5. června 2016.
 | Tento genetika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |