Alternativní mitochondriální kód plochého červu - Alternative flatworm mitochondrial code - Wikipedia

Alternativní mitochondriální kód plochého červu (překladová tabulka 14) je a genetický kód nalezený v mitochondriích Platyhelminthes a Nematody.

Kód

AA = FFLLSSSSYYY * CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNNKSSSSVVVVAAAADDEEGGGG

Začíná = ----------------------------------- M ------------- ---------------

Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGG

Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG

Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Základny: adenin (A), cytosin (C), guanin (G) a tymin (T) nebo uracil (U).

Aminokyseliny: Alanin (Ala, A), Arginin (Arg, R), Asparagin (Asn, N), Kyselina asparagová (Asp, D), Cystein (Cys, C), Kyselina glutamová (Glu, E), Glutamin (Gln, Q), Glycin (Gly, G), Histidin (Jeho, H), Isoleucin (Ile, I), Leucin (Leu, L), Lysin (Lys, K), Methionin (Met, M), Fenylalanin (Phe, F), Prolin (Pro, P), Serine (Ser, S), Threonin (Thr, T), Tryptofan (Trp, W), Tyrosin (Tyr, Y), Valine (Val, V)

Rozdíly od standardního kódu


Kodony DNA	Kodony RNA	Tento kód (14)	Standardní kód (1)
`AAA`	`AAA`	`Asn` `(N)`	`Lys` `(K)`
`AGA`	`AGA`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
`AGG`	`AGG`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
`TAA`	`UAA`	`Tyr` `(Y)`	`STOP = Ter` `(*)`
`TGA`	`UGA`	`Trp` `(Ž)`	`STOP = Ter` `(*)`

Systematický rozsah a komentáře

Platyhelminthes (ploché červy) a Nematoda (škrkavky).

Kód 14 se liší od kódu 9 (mitochondriální kód ostnokožců a plochých červů ) pouze překladem UAA do Tyru, nikoli STOP. Studie v roce 2000^[1] nenašel žádný důkaz, že kodon UAA kóduje Tyr u plochých červů, ale existují i jiné názory. Je jich velmi málo GenBank záznamy, které jsou přeloženy kódem 14, ale testovací překlad ukazuje, že překládání těchto záznamů kódem 9 může způsobit předčasné ukončení. V poslední době bylo zjištěno, že UAA kóduje tyrosin u hlístic Radopholus similis^[2] a Radopholus arabocoffeae.^[3]