Alphafusellovirus - Alphafusellovirus
| Alphafusellovirus | |
|---|---|
Klasifikace virů  | |
| (bez hodnocení): | Virus |
| Oblast: | incertae sedis |
| Království: | incertae sedis |
| Kmen: | incertae sedis |
| Třída: | incertae sedis |
| Objednat: | incertae sedis |
| Rodina: | Fuselloviridae |
| Rod: | Alphafusellovirus |
| Zadejte druh | |
| Virus ve tvaru vřetena Sulfolobus 1 | |
Alphafusellovirus je rod viry, v rodině Fuselloviridae. Druhy rodu Sulfolobus (sulfolobus shibatae, Sulfolobus solfataricus a Sulfolobus islandicus) slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje sedm druhů tohoto rodu, včetně druhů druhů Sulfolobus vřetenovitý virus 1 (SSV1 nebo SSV-1)[1][2]
Taxonomie
Skupina: dsDNA
- Rodina: Fuselloviridae
- Rod: Alphafusellovirus
- Virus ve tvaru vřetena Sulfolobus 1 (SSV1)
- Virus ve tvaru vřetena Sulfolobus 2 (SSV2)
- Virus ve tvaru vřetena Sulfolobus 4 (SSV4)
- Virus ve tvaru vřetena Sulfolobus 5 (SSV5)
- Virus ve tvaru vřetena Sulfolobus 7 (SSV7)
- Virus ve tvaru vřetena Sulfolobus 8 (SSV8)
- Virus ve tvaru vřetena Sulfolobus 9 (SSV9)
SSV může také znamenat „virus opičího sarkomu“, což je synonymum „Virus vlčího opičího sarkomu (WMSV) '(fam. Retroviridae ). SSV6 patří do rodu Betafusellovirus.
Struktura
Viry v Alphafusellovirus jsou obaleny, s geometrií ve tvaru citronu. Průměr je kolem 60 nm, s délkou 100 nm. Genomy jsou kruhové, asi 17,3 kB dlouhé.[1]Biochemická charakterizace SSV1, typového druhu rodu Alphafusellovirus, ukázala, že viriony se skládají ze čtyř strukturních proteinů kódovaných viry, VP1 až VP4, a jednoho chromatinového proteinu vázajícího DNA buněčného původu. Virionové proteiny VP1, VP3 a VP4 procházejí posttranslační modifikací glykosylací, zdánlivě na více místech. VP1 je také proteolyticky zpracován. Viriony SSV1 obsahují glycerol dibifytanyl glycerol tetraether (GDGT) lipidy, které se, zdá se, získávají virem selektivním způsobem z hostitelské cytoplazmatické membrány.[3]
| Rod | Struktura | Symetrie | Capsid | Genomické uspořádání | Genomická segmentace |
|---|---|---|---|---|---|
| Alphafusellovirus | Ve tvaru citronu | Obal | Oběžník | Monopartitní |
Životní cyklus
Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne adsorpcí do hostitelské buňky. Transkripce se šablonami DNA je metoda transkripce. Jako přirozeného hostitele slouží Sulfolobus shibatae, sulfolobus solfataricus a sulfolobus islandicus.[1] Bylo prokázáno, že SSV1, typový druh rodu, je uvolňován z hostitele, aniž by způsoboval lýzu buněk pučícím mechanismem, podobně jako u obalených eukaryotických virů.[4]
| Rod | Podrobnosti o hostiteli | Tkáňový tropismus | Vstupní údaje | Podrobnosti o vydání | Replikační web | Místo montáže | Přenos |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Alphafusellovirus | Archea: termolofilní | Žádný | Injekce | Pučící | Cytoplazma | Cytoplazma | Pasivní difúze |
Reference
- ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 12. června 2015.
- ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 12. června 2015.
- ^ Quemin ER, Pietilä MK, Oksanen HM, Forterre P, Rijpstra WI, Schouten S, Bamford DH, Prangishvili D, Krupovic M (2015). „Sulfolobus vřetenovitý virus 1 obsahuje glykosylované kapsidové proteiny, buněčný chromatinový protein a lipidy odvozené od hostitele“. J Virol. 89 (22): 11681–11691. doi:10.1128 / JVI.02270-15. PMC 4645638. PMID 26355093.
- ^ Quemin ER, Chlanda P, Sachse M, Forterre P, Prangishvili D, Krupovic M (2016). „Virus podobný eukaryotům v Archaea“. mBio. 7 (5): e01439-16. doi:10,1 128 / mBio.01439-16. PMC 5021807. PMID 27624130.