ARHGDIB - ARHGDIB

ARHGDIB
Protein ARHGDIB PDB 1ds6.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyARHGDIB, D4, GDIA2, GDID4, LYGDI, Ly-GDI, RAP1GN1, RhoGDI2, Rho GDP disociační inhibitor beta
Externí IDOMIM: 602843 MGI: 101940 HomoloGene: 20318 Genové karty: ARHGDIB
Umístění genu (člověk)
Chromozom 12 (lidský)
Chr.Chromozom 12 (lidský)[1]
Chromozom 12 (lidský)
Genomic location for ARHGDIB
Genomic location for ARHGDIB
Kapela12p12.3Start14,942,031 bp[1]
Konec14,961,728 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE ARHGDIB 201288 at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

397

11857

Ensembl

ENSG00000111348

ENSMUSG00000030220

UniProt

P52566

Q61599

RefSeq (mRNA)

NM_001175
NM_001321420
NM_001321421
NM_001321422
NM_001321423

RefSeq (protein)

NP_001166
NP_001308349
NP_001308350
NP_001308351
NP_001308352

Místo (UCSC)Chr 12: 14,94 - 14,96 MbChr 6: 136,92 - 136,94 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Rho GDP-disociační inhibitor 2 je protein že u lidí je kódován ARHGDIB gen.[5][6][7] Aliasy tohoto genu zahrnují RhoGDI2, GDID4, Rho GDI 2, a další.[8]

Interakce

ARHGDIB bylo prokázáno komunikovat s VAV1[9] a Src.[10]

Genová rodina

RhoGDI2 (ARHGDIB) je součástí tříčlenné rodiny: RhoGDI1, RhoGDI2 (také známý jako RhoGDIB, D4-GDI nebo Ly-GDI) a RhoGDI3. RhoGDI1 je exprimován v mnoha orgánech a je nejlépe studovaným členem rodiny.[11][12][13] RhoGDI2 se původně věřilo, že je exprimován specificky v buňkách tvořících krev[6] ale následně bylo zjištěno, že je vysoce exprimován také v celé řadě dalších typů buněk.[14] RhoGDI3 je převážně exprimován v mozku, plicích, ledvinách, varlatech a pankreatu,[15][16] a je zaměřen na specifické části buňky, jako je Golgi, kde může hrát roli v transportu nebo proteinech v buňkách.[17][18]

Zapojení nemoci

Navzdory vysokému stupni podobnosti sekvencí se RhoGDI1 a RhoGDI2 velmi liší ve svých vazebných afinitách pro specifické GTPasy,[19] a co je důležitější, v jejich rolích při tvorbě nádoru a šíření nádoru do dalších orgánů (proces metastáza ).[20] Například RhoGDI2 funguje jako supresor metastáz, ale nikoli a supresor nádoru v rakovina močového měchýře buňky,[14][21] zatímco RhoGDI1 je všudypřítomný supresor růstu nádoru ve všech dosud prozkoumaných modelech rakoviny močového měchýře),[22] což naznačuje, že jejich buněčné funkce se musí lišit, aby způsobily tyto rozdílné účinky.

I když existují jasné vazby mezi změnami hladin proteinu RhoGDI2 a progresí onemocnění a / nebo metastázami u několika typů rakoviny, mechanickým základům způsobu působení RhoGDI2 za karcinogenních buněčných podmínek se teprve začíná porozumět. Důkazy ukazují, že RhoGDI2 inhibuje endotelin osa a přeslech s makrofágy v mikrometastatickém mikroprostředí k inhibici metastatického růstu.[23] RhoGDI2 jako takový by se mohl ukázat jako důležitý při regulaci doby klidu nádoru. Cílení na tuto osu orálně dostupnými antagonisty endotelinového receptoru[24] se může ukázat jako efektivní při napodobování inhibiční role RhoGDI2 prevencí infiltrace makrofágů do mikrometastatické niky.[25] Nedávná práce také určila, že genetické a farmakologické cílení chemokinového (motivu C-C) ligandu 2 (CCL2 ) také známý jako monocytový chemotaktický protein-1 (MCP-1) nebo malý indukovatelný cytokin A2, jeho receptor CCR2 a farmakologická ablace makrofágů může také fenokopovat účinek exprese RhoGDI2 na prevenci metastatické kolonizace plic67 a že RhoGDI2 potlačuje versican, protein, u kterého bylo prokázáno, že podporuje migraci buněk[26] a metastázy v několika modelech nádorů.

Na rozdíl od jeho role jako látky potlačující metastázy v rakovině močového měchýře, v prsu, se uvádí, že exprese RhoGDI2 je u rakoviny zvýšena[27] a podporovat invazi buněk rakoviny prsu,[28] zatímco jiná zpráva našla dvoufázový expresní vzorec RhoGDI2 u rakoviny prsu se sníženou expresí korelující s metastázami lymfatických uzlin.[29]

Protilátky ARHGDIB mohou být markerem pro dlouhodobou ztrátu štěpu ledvin u příjemců ledvin zemřelých dárců.[30]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111348 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030220 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Lelias JM, Adra CN, Wulf GM, Guillemot JC, Khagad M, Caput D, Lim B (březen 1993). „cDNA klonování lidské mRNA přednostně exprimované v hematopoetických buňkách as homologií s inhibitorem disociace GDP pro proteiny vázající rho GTP“. Proc Natl Acad Sci U S A. 90 (4): 1479–83. Bibcode:1993PNAS ... 90.1479L. doi:10.1073 / pnas.90.4.1479. PMC  45897. PMID  8434008.
  6. ^ A b Scherle P, Behrens T, Staudt LM (září 1993). „Ly-GDI, inhibitor disociace GDP RhoA GTP-vazebného proteinu, je přednostně exprimován v lymfocytech.“. Proc Natl Acad Sci U S A. 90 (16): 7568–72. Bibcode:1993PNAS ... 90.7568S. doi:10.1073 / pnas.90.16.7568. PMC  47183. PMID  8356058.
  7. ^ „Entrez Gene: ARHGDIB Rho GDP disociation inhibitor (GDI) beta“.
  8. ^ „Genové karty: ARHGDIB“.
  9. ^ Groysman M, Russek CS, Katzav S (únor 2000). „Vav, faktor výměny nukleotidů GDP / GTP, interaguje s GDI, proteiny, které inhibují disociaci GDP / GTP“. FEBS Lett. 467 (1): 75–80. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01121-2. PMID  10664460. S2CID  40103095.
  10. ^ Wu Y, Moissoglu K, Wang H, Wang X, Frierson HF, Schwartz MA, Theodorescu D (duben 2009). „Src fosforylace RhoGDI2 reguluje jeho funkci potlačující metastázy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 106 (14): 5807–12. Bibcode:2009PNAS..106,5807W. doi:10.1073 / pnas.0810094106. PMC  2667073. PMID  19321744.
  11. ^ DerMardirossian C, Bokoch GM (červenec 2005). "GDI: centrální regulační molekuly v aktivaci Rho GTPázy". Trends Cell Biol. 15 (7): 356–63. doi:10.1016 / j.tcb.2005.05.001. PMID  15921909.
  12. ^ Dovas A, Couchman JR (srpen 2005). „RhoGDI: více funkcí v regulaci aktivit GTPasy rodiny Rho“. Biochem. J. 390 (Pt 1): 1–9. doi:10.1042 / BJ20050104. PMC  1184558. PMID  16083425.
  13. ^ Garcia-Mata R, Boulter E, Burridge K (srpen 2011). „„ Neviditelná ruka “: regulace RHO GTPáz RHOGDI. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 12 (8): 493–504. doi:10.1038 / nrm3153. PMC  3260518. PMID  21779026.
  14. ^ A b Theodorescu D, Sapinoso LM, Conaway MR, Oxford G, Hampton GM, Frierson HF (červen 2004). „Snížená exprese potlačujícího metastázy RhoGDI2 je spojena se sníženým přežitím u pacientů s rakovinou močového měchýře“. Clin. Cancer Res. 10 (11): 3800–6. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-03-0653. PMID  15173088.
  15. ^ Adra CN, Manor D, Ko JL, Zhu S, Horiuchi T, Van Aelst L, Cerione RA, Lim B (duben 1997). „RhoGDIgamma: inhibitor disociace GDP pro proteiny Rho s preferenční expresí v mozku a slinivce břišní“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (9): 4279–84. Bibcode:1997PNAS ... 94.4279A. doi:10.1073 / pnas.94.9.4279. PMC  20713. PMID  9113980.
  16. ^ Zalcman G, Closson V, Camonis J, Honoré N, Rousseau-Merck MF, Tavitian A, Olofsson B (listopad 1996). „RhoGDI-3 je nový inhibitor disociace GDP (GDI). Identifikace necytosolického proteinu GDI interagujícího s malými proteiny vázajícími GTP RhoB a RhoG“. J. Biol. Chem. 271 (48): 30366–74. doi:10.1074 / jbc.271.48.30366. PMID  8939998.
  17. ^ Brunet N, Morin A, Olofsson B (květen 2002). „RhoGDI-3 reguluje RhoG a cílí tento protein na Golgiho komplex prostřednictvím své jedinečné N-terminální domény.“ Provoz. 3 (5): 342–57. doi:10.1034 / j.1600-0854.2002.30504.x. PMID  11967128. S2CID  19351109.
  18. ^ Dransart E, Morin A, Cherfils J, Olofsson B (únor 2005). "Odpojení inhibičních a převáděcích funkcí inhibitorů disociace rho GDP". J. Biol. Chem. 280 (6): 4674–83. doi:10,1074 / jbc.M409741200. PMID  15513926.
  19. ^ Gorvel JP, Chang TC, Boretto J, Azuma T, Chavrier P (leden 1998). "Diferenciální vlastnosti D4 / LyGDI versus RhoGDI: fosforylace a selektivita rho GTPázy". FEBS Lett. 422 (2): 269–73. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00020-9. PMID  9490022. S2CID  10817327.
  20. ^ Harding MA, Theodorescu D (květen 2010). „Signalizace RhoGDI poskytuje cíle pro léčbu rakoviny“. Eur. J. Cancer. 46 (7): 1252–9. doi:10.1016 / j.ejca.2010.02.025. PMID  20347589.
  21. ^ Gildea JJ, Seraj MJ, Oxford G, Harding MA, Hampton GM, Moskaluk CA, Frierson HF, Conaway MR, Theodorescu D (listopad 2002). „RhoGDI2 je gen potlačující invazi a metastázy u lidské rakoviny“. Cancer Res. 62 (22): 6418–23. PMID  12438227.
  22. ^ Moissoglu K, McRoberts KS, Meier JA, Theodorescu D, Schwartz MA (duben 2009). „Rho GDP disociační inhibitor 2 potlačuje metastázy nekonvenční regulací RhoGTPáz“. Cancer Res. 69 (7): 2838–44. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-1397. PMC  2701105. PMID  19276387.
  23. ^ Said N, Smith S, Sanchez-Carbayo M, Theodorescu D (leden 2011). „Nádorový endotelin-1 zvyšuje metastatickou kolonizaci plic v myších xenoimplantátových modelech rakoviny močového měchýře“. J. Clin. Investovat. 121 (1): 132–47. doi:10,1172 / JCI42912. PMC  3007145. PMID  21183790.
  24. ^ Nelson J, Bagnato A, Battistini B, Nisen P (únor 2003). „Osa endotelinu: objevující se role v rakovině“. Nat. Rev. Rakovina. 3 (2): 110–6. doi:10.1038 / nrc990. PMID  12563310. S2CID  22954469.
  25. ^ Said N, Sanchez-Carbayo M, Smith SC, Theodorescu D (duben 2012). „RhoGDI2 potlačuje plicní metastázy u myší snížením exprese nádoru versikánu a infiltrace makrofágů“. J. Clin. Investovat. 122 (4): 1503–18. doi:10,1172 / JCI61392. PMC  3314474. PMID  22406535.
  26. ^ Wu Y, Siadaty MS, Berens ME, Hampton GM, Theodorescu D (listopad 2008). „Překrývající se profily genové exprese buněčné migrace a invaze nádoru u lidského karcinomu močového měchýře identifikují metalothionein 1E a nikotinamid N-methyltransferázu jako nové regulátory buněčné migrace“. Onkogen. 27 (52): 6679–89. doi:10.1038 / dne 2008.264. PMC  5373842. PMID  18724390.
  27. ^ Moon HG, Jeong SH, Ju YT, Jeong CY, Lee JS, Lee YJ, Hong SC, Choi SK, Ha WS, Park ST, Jung EJ (září 2010). „Up-regulace RhoGDI2 u lidské rakoviny prsu a její prognostické důsledky“. Cancer Res Treat. 42 (3): 151–6. doi:10.4143 / crt.2010.42.3.151. PMC  2953778. PMID  20948920.
  28. ^ Zhang Y, Zhang B (červen 2006). „D4-GDI, regulátor Rho GTPázy, podporuje invazivitu buněk rakoviny prsu“. Cancer Res. 66 (11): 5592–8. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-4004. PMID  16740694.
  29. ^ Hu LD, Zou HF, Zhan SX, Cao KM (červen 2007). „Dvoufázová exprese RhoGDI2 v progresi rakoviny prsu a její negativní vztah k metastázám v lymfatických uzlinách“. Oncol. Rep. 17 (6): 1383–9. doi:10.3892 / nebo 17.6.1383. PMID  17487395.
  30. ^ Kamburova, EG; Gruijters, ML; Kardol-Hoefnagel, T; Wisse, BW; Joosten, já; Allebes, WA; van der Meer, A; Hilbrands, LB; Baas, MC; Spierings, E; Hack, CE; van Reekum, FE; van Zuilen, AD; Verhaar, MC; Bots, ML; Drop, ACAD; Plaisier, L; Melchers, RCA; Seelen, MAJ; Sanders, JS; Hepkema, BG; Lambeck, AJA; Bungener, LB; Roozendaal, C; Tilanus, MGJ; Voorter, CE; Wieten, L; van Duijnhoven, EM; Gelens, MACJ; Christiaans, MHL; van Ittersum, FJ; Nurmohamed, SA; Lardy, NM; Swelsen, W; van der Pant, KAMI; van der Weerd, NC; Ten Berge, IJM; Hoitsma, A; van der Boog, PJM; de Fijter, JW; Betjes, MGH; Heidt, S; Roelen, DL; Claas, FH; Bemelman, FJ; Otten, HG (13. června 2019). „Protilátky proti ARHGDIB jsou spojeny s dlouhodobou ztrátou štěpu ledvinami“. American Journal of Transplantation. 19 (12): 3335–3344. doi:10.1111 / ajt.15493. PMC  6899679. PMID  31194283.

externí odkazy

Další čtení