YME1L1 - YME1L1
ATP závislá metaloproteáza YME1L1 je enzym že u lidí je kódován YME1L1 gen.[5] YME1L1 patří do Rodina AAA z ATPázy a hlavně funkce při udržování mitochondriální morfologie. Mutace v tomto genu by způsobil infantilní nástup mitochondriopatie.[6]
Struktura
Gen
The YME1L1 gen se nachází na chromozom 10p 14, skládající se z 20 exony. Dvě varianty přepisu kódující různé izoformy byly nalezeny pro tento gen.
Protein
YME1L1 se skládá z 716 aminokyseliny a je velmi podobný všem mitochondriálním AAA proteázám a zejména droždí Yme1p. Pomocí sekvenční analýzy jsou identifikovány tři různé domény, včetně AAA konsensuální sekvence mezi aminokyselinami 317 a 502, an ATP / GTP motiv vazby a Motiv HEXXH typické pro a zinek -závislá vazba doména.[7]
Funkce
YME1L1 je zabudován do vnitřní mitochondriální membrána a je hojnější v tkáních s vysokým obsahem mitochondrií, jako je lidské lidské srdce, kosterní sval, a slinivka břišní RNA.[7][6] YME1L1 je členem rodiny AAA ATPáz a má důležitou roli pro udržování mitochondriální morfologie.[6] Jeho zralá forma se shromažďuje do homo-oligomerního komplexu uvnitř vnitřní mitochondriální membrány (IM).[8] Rozkládá jak mezimembránový prostor, tak proteiny IM, včetně proteinů pro přenos lipidů, složek proteinu translocases IM a optická atrofie GTPázy podobná dynaminu 1 (OPA1 ) [9][10][11] Ztráta YME1L1 se zrychluje OMA1 -závislé štěpení OPA1 v dlouhé formě, které vede k akumulaci OPA1 v krátké formě, se zvýšilo mitochondriální štěpení a fragmentace mitochondriální sítě.[12] Rovněž se uvádí, že YME1L1 řídí akumulaci dýchací řetězec podjednotek a je vyžadován pro apoptotický odpor, cristae morfogeneze, a proliferace buněk.[13]
Klinický význam
A homozygotní mutace v genu YME1L1 by způsobila infantilní nástup mitochondriopatie s těžkým mentálním postižením, svalovými poruchami a zrakovým nervem atrofie. The missense mutace ovlivňuje MPP místo zpracování a zhoršuje zrání YME1L1, což vede k jeho rychlé degradaci a také vede k defektu proliferace, abnormálnímu zpracování OPA1 a mitochondriální fragmentaci.[6]
Interakce
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136758 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026775 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Entrez Gene: YME1L1 YME1-like 1 (S. cerevisiae)“.
- ^ A b C d Hartmann B, Wai T, Hu H, MacVicar T, Musante L, Fischer-Zirnsak B, Stenzel W, Gräf R, van den Heuvel L, Ropers HH, Wienker TF, Hübner C, Langer T, Kaindl AM (6. srpna 2016) . „Homozygotní mutace YME1L1 způsobuje mitochondriopatii s optickou atrofií a fragmentaci mitochondriální sítě“. eLife. 5. doi:10,7554 / eLife.16078. PMC 4991934. PMID 27495975.
- ^ A b Coppola M, Pizzigoni A, Banfi S, Bassi MT, Casari G, Incerti B (květen 2000). "Identifikace a charakterizace YME1L1, nového genu souvisejícího s parapleginem". Genomika. 66 (1): 48–54. doi:10,1006 / geno.2000.6136. PMID 10843804.
- ^ Van Dyck L, Langer T (listopad 1999). „ATP-dependentní proteázy kontrolující mitochondriální funkci v kvasinkách Saccharomyces cerevisiae“. Buněčné a molekulární biologické vědy. 56 (9–10): 825–42. doi:10,1007 / s000180050029. PMID 11212342. S2CID 5825456.
- ^ Potting C, Tatsuta T, König T, Haag M, Wai T, Aaltonen MJ, Langer T (srpen 2013). „Komplexy TRIAP1 / PRELI zabraňují apoptóze zprostředkováním intramitochondriálního transportu kyseliny fosfatidové“. Buněčný metabolismus. 18 (2): 287–95. doi:10.1016 / j.cmet.2013.07.008. PMID 23931759.
- ^ A b Rainbolt TK, Saunders JM, Wiseman RL (leden 2015). „Degradace YME1L snižuje mitochondriální proteolytickou kapacitu během oxidačního stresu“. Zprávy EMBO. 16 (1): 97–106. doi:10.15252 / embr.201438976. PMC 4304733. PMID 25433032.
- ^ Anand R, Wai T, Baker MJ, Kladt N, Schauss AC, Rugarli E, Langer T (březen 2014). „Proteáza i-AAA YME1L a OMA1 štěpí OPA1 pro vyvážení mitochondriální fúze a štěpení.“. The Journal of Cell Biology. 204 (6): 919–29. doi:10.1083 / jcb.201308006. PMC 3998800. PMID 24616225.
- ^ Wai T, García-Prieto J, Baker MJ, Merkwirth C, Benit P, Rustin P, Rupérez FJ, Barbas C, Ibañez B, Langer T (prosinec 2015). "Nevyvážené zpracování OPA1 a mitochondriální fragmentace způsobují srdeční selhání u myší". Věda. 350 (6265): aad0116. doi:10.1126 / science.aad0116. PMID 26785494. S2CID 34322149.
- ^ Stiburek L, Cesnekova J, Kostkova O, Fornuskova D, Vinsova K, Wenchich L, Houstek J, Zeman J (březen 2012). „YME1L řídí akumulaci podjednotek dýchacího řetězce a je vyžadován pro apoptotickou rezistenci, morfogenezi cristae a buněčnou proliferaci“. Molekulární biologie buňky. 23 (6): 1010–23. doi:10,1091 / mbc.E11-08-0674. PMC 3302729. PMID 22262461.
- ^ MacVicar T, Langer T (červen 2016). „Zpracování OPA1 v buněčné smrti a nemoci - dlouhé a krátké“. Journal of Cell Science. 129 (12): 2297–306. doi:10.1242 / jcs.159186. PMID 27189080.
Další čtení
- Shah ZH, Hakkaart GA, Arku B, de Jong L, van der Spek H, Grivell LA, Jacobs HT (srpen 2000). „Lidský homolog kvasinkové mitochondriální AAA metaloproteázy Yme1p doplňuje disruptor kvasinek yme1“. FEBS Dopisy. 478 (3): 267–70. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01859-7. PMID 10930580. S2CID 42014862.
- Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Výzkum genomu. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
- Pellegrini L, Passer BJ, Canelles M, Lefterov I, Ganjei JK, Fowlkes BJ, Koonin EV, D'Adamio L (duben 2001). „PAMP a PARL, dvě nové domnělé metaloproteázy interagující s COOH-koncem Presenilin-1 a -2“. Journal of Alzheimer's Disease. 3 (2): 181–190. doi:10.3233 / jad-2001-3203. PMID 12214059.
Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |