VPS25 - VPS25

VPS25
Protein VPS25 PDB 2ZME.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyVPS25, DERP9, EAP20, FAP20, vakuolární třídění proteinů 25 homolog
Externí IDOMIM: 610907 MGI: 106354 HomoloGene: 6303 Genové karty: VPS25
Umístění genu (člověk)
Chromozom 17 (lidský)
Chr.Chromozom 17 (lidský)[1]
Chromozom 17 (lidský)
Genomické umístění pro VPS25
Genomické umístění pro VPS25
Kapela17q21.2Start42,773,449 bp[1]
Konec42,779,599 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE VPS25 gnf1h00737 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_032353

NM_001284411
NM_001284412
NM_001284414
NM_026776

RefSeq (protein)

NP_115729
NP_115729.1

NP_001271340
NP_001271341
NP_001271343
NP_081052

Místo (UCSC)Chr 17: 42,77 - 42,78 MbChr 11: 101,25 - 101,26 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš
Komplexní podjednotka ESCRT-II
PDB 1xb4 EBI.jpg
krystalová struktura podjednotky vps25 endosomálního transportního komplexu escrt-ii
Identifikátory
SymbolESCRT-II
PfamPF05871
InterProIPR008570

Protein spojený s vakuovým tříděním proteinů 25 je protein že u lidí je kódován VPS25 gen.[5][6]

Je to součást endosomu komplex ESCRT-II (Endozomální Třídicí komplexy potřebné pro transportní protein II). Komplexy ESCRT (ESCRT-I, -II, -III) organizují efektivní třídění ubikvitinovaný transmembránové receptory na lysozomy přes multivesikulární tělesa (MVB).[7] ESCRT-II rekrutuje transportní zařízení pro třídění proteinů na MVB.[8] Kromě toho člověk Bylo prokázáno, že ESCRT-II tvoří komplex s RNA polymeráza II činitel prodloužení ELL za účelem výkonu transkripční kontrolní činnost. ESCRT-II se přechodně asociuje s endozomální membrána a tím iniciuje tvorbu ESCRT-III, asociovaného s membránou proteinový komplex který funguje bezprostředně za ESCRT-II během třídění nákladu MVB. ESCRT-II zase funguje za ESCRT-I, proteinovým komplexem, který se váže na ubikvitinovaný endozomální náklad.[9]

ESCRT-II je trilobální komplex složený ze dvou kopií vps25, jedné kopie vps22 a C-koncová oblast vps36. The Krystalická struktura z vps25 odhalilo dvě domény s křídlovou spirálou, N-terminální doména vps25 interagující s vps22 a vps36.[10]


Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131475 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000078656 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Yorikawa C, Shibata H, Waguri S, Hatta K, Horii M, Katoh K, Kobayashi T, Uchiyama Y, Maki M (březen 2005). „Lidský CHMP6, myristoylovaný protein ESCRT-III, interaguje přímo s komponentou ESCRT-II EAP20 a reguluje třídění endozomálního nákladu“. Biochem J.. 387 (Pt 1): 17–26. doi:10.1042 / BJ20041227. PMC  1134928. PMID  15511219.
  6. ^ "Entrez Gene: VPS25 vakuolární protein třídění 25 homolog (S. cerevisiae)".
  7. ^ Gill DJ, Teo H, Sun J, Perisic O, Veprintsev DB, Emr SD, Williams RL (leden 2007). „Strukturální pohled na spojení ESCRT-I / -II a jeho role v obchodování s MVB“. EMBO J.. 26 (2): 600–12. doi:10.1038 / sj.emboj.7601501. PMC  1783442. PMID  17215868.
  8. ^ Teo H, Perisic O, Gonzalez B, Williams RL (říjen 2004). „ESCRT-II, komplex spojený s endozomy vyžadovaný pro třídění proteinů: krystalová struktura a interakce s ESCRT-III a membránami“. Dev. Buňka. 7 (4): 559–69. doi:10.1016 / j.devcel.2004.09.003. PMID  15469844.
  9. ^ Babst M, Katzmann DJ, Snyder WB, Wendland B, Emr SD (srpen 2002). „Komplex spojený s endosomy, ESCRT-II, rekrutuje transportní stroje pro třídění proteinů v multivezikulárním těle“. Dev. Buňka. 3 (2): 283–9. doi:10.1016 / S1534-5807 (02) 00219-8. PMID  12194858.
  10. ^ Wernimont AK, Weissenhorn W (prosinec 2004). „Krystalová struktura podjednotky VPS25 komplexu endosomálního přenosu ESCRT-II“. Struktura BMC. Biol. 4 (1): 10. doi:10.1186/1472-6807-4-10. PMC  539351. PMID  15579210.

Další čtení

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR008570