ELL (gen) - ELL (gene)

ELL

Protein ELL PDB 2doa.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
2DOA

Identifikátory

ELL, C19orf17, ELL1, MEN, PPP1R68, elongační faktor pro RNA polymerázu II

Externí ID

OMIM: 600284 MGI: 109377 HomoloGene: 4762 Genové karty: ELL

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 19 (lidský)^[1]

Kapela	19p13.11	Start	18,442,663 bp^[1]
Kapela	19p13.11	Konec	18,522,116 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 8 (myš)^[2]

Kapela	8 \| 8 B3.3	Start	70,539,457 bp^[2]
Kapela	8 \| 8 B3.3	Konec	70,592,858 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba fosfatázy • GO: 0001948 vazba na proteiny
Buněčná složka	• Cajal tělo • jaderná skvrna • histonové lokusové tělo • nukleoplazma • transkripčně aktivní chromatin • komplex faktoru prodloužení transkripce • buněčné jádro
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony • transkripce snRNA z promotoru RNA polymerázy III • negativní regulace aktivity fosfatázy • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II • v embryonálním vývoji dělohy • transkripce z promotoru RNA polymerázy II • transkripce, chráněná DNA • pozitivní regulace transkripce s templátem DNA, prodloužení • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy III • pozitivní regulace prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II • transkripce snRNA z promotoru RNA polymerázy II
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


8178


13716


ENSG00000105656


ENSMUSG00000070002


P55199


O08856

RefSeq (mRNA)


NM_006532


NM_007924

RefSeq (protein)


NP_006523


NP_031950

Místo (UCSC)

Chr 19: 18,44 - 18,52 Mb

Chr 8: 70,54 - 70,59 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Faktor prodloužení RNA polymerázy II ELL je enzym že u lidí je kódován ELL gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

Ukázalo se, že ELL (gen) komunikovat s P53.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105656 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000070002 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Thirman MJ, Levitan DA, Kobayashi H, Simon MC, Rowley JD (leden 1995). „Klonování ELL, genu, který fúzuje s MLL at (11; 19) (q23; p13.1) při akutní myeloidní leukémii“. Proc Natl Acad Sci U S A. 91 (25): 12110–4. doi:10.1073 / pnas.91.25.12110. PMC 45386. PMID 7991593.
^ Shilatifard A, Lane WS, Jackson KW, Conaway RC, Conaway JW (duben 1996). "Faktor prodloužení RNA polymerázy II kódovaný lidským genem ELL". Věda. 271 (5257): 1873–6. doi:10.1126 / science.271.5257.1873. PMID 8596958. S2CID 46101044.
^ „Entrez Gene: ELL elongation factor RNA polymerase II“.
^ Shinobu N, Maeda T, Aso T, Ito T, Kondo T, Koike K, Hatakeyama M (červen 1999). „Fyzická interakce a funkční antagonismus mezi faktorem prodloužení RNA polymerázy II ELL a p53“. J. Biol. Chem. 274 (24): 17003–10. doi:10.1074 / jbc.274.24.17003. PMID 10358050.

Další čtení

Iwabuchi K, Bartel PL, Li B, Marraccino R, Fields S (1994). „Dva buněčné proteiny, které se vážou na divoký typ, ale ne mutantní p53“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (13): 6098–102. doi:10.1073 / pnas.91.13.6098. PMC 44145. PMID 8016121.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Shilatifard A, Haque D, Conaway RC, Conaway JW (1997). "Struktura a funkce elongačního faktoru RNA polymerázy II ELL. Identifikace dvou překrývajících se funkčních domén ELL, které určují jeho interakci s polymerázou a komplexem ternárního prodloužení". J. Biol. Chem. 272 (35): 22355–63. doi:10.1074 / jbc.272.35.22355. PMID 9268387.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Shilatifard A (1998). „Identifikace a čištění komplexu Holo-ELL. Důkaz přítomnosti proteinů asociovaných s ELL, které potlačují transkripční inhibiční aktivitu ELL“. J. Biol. Chem. 273 (18): 11212–7. doi:10.1074 / jbc.273.18.11212. PMID 9556611.
Li XY, Green MR (1998). „Buněčný koaktivátor Tat-SF1 HIV-1 Tat je obecným faktorem prodloužení transkripce“. Genes Dev. 12 (19): 2992–6. doi:10.1101 / gad.12.19.2992. PMC 317190. PMID 9765201.
Shinobu N, Maeda T, Aso T, Ito T, Kondo T, Koike K, Hatakeyama M (1999). „Fyzická interakce a funkční antagonismus mezi faktorem prodloužení RNA polymerázy II ELL a p53“. J. Biol. Chem. 274 (24): 17003–10. doi:10.1074 / jbc.274.24.17003. PMID 10358050.
Schmidt AE, Miller T, Schmidt SL, Shiekhattar R, Shilatifard A (1999). „Klonování a charakterizace podjednotky EAP30 komplexu ELL, která poskytuje derepresi transkripce RNA polymerázou II“. J. Biol. Chem. 274 (31): 21981–5. doi:10.1074 / jbc.274.31.21981. PMID 10419521.
Kim MK, Nikodem VM (2000). „hnRNP U inhibuje fosforylaci karboxyterminální domény pomocí TFIIH a potlačuje prodloužení RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. 19 (10): 6833–44. doi:10.1128 / MCB.19.10.6833. PMC 84680. PMID 10490622.
Lavau C, Luo RT, Du C, Thirman MJ (2000). „Retrovirem zprostředkovaný genový přenos MLL-ELL transformuje primární myeloidní progenitory a způsobuje akutní myeloidní leukémie u myší“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (20): 10984–9. doi:10.1073 / pnas.190167297. PMC 27135. PMID 10995463.
Simone F, Polak PE, Kaberlein JJ, Luo RT, Levitan DA, Thirman MJ (2001). „EAF1, nový faktor spojený s ELL, který je delokalizován expresí fúzního proteinu MLL-ELL“. Krev. 98 (1): 201–9. doi:10.1182 / krev. V98.1.201. PMID 11418481.
Luo RT, Lavau C, Du C, Simone F, Polak PE, Kawamata S, Thirman MJ (2001). „Elongační doména ELL je postradatelná, ale její interakční doména s faktorem 1 spojená s ELL je nezbytná pro leukemogenezi vyvolanou MLL-ELL.“. Mol. Buňka. Biol. 21 (16): 5678–87. doi:10.1128 / MCB.21.16.5678-5687.2001. PMC 87288. PMID 11463848.
Simone F, Luo RT, Polak PE, Kaberlein JJ, Thirman MJ (2003). „Faktor 2 související s ELL (EAF2), funkční homolog EAF1 s alternativními vazebnými vlastnostmi ELL“. Krev. 101 (6): 2355–62. doi:10.1182 / krev-2002-06-1664. PMID 12446457.
Polak PE, Simone F, Kaberlein JJ, Luo RT, Thirman MJ (2003). „ELL a EAF1 jsou složky Cajalova těla, které jsou narušeny u leukémie MLL-ELL“. Mol. Biol. Buňka. 14 (4): 1517–28. doi:10,1091 / mbc.E02-07-0394. PMC 153119. PMID 12686606.
Wiederschain D, Kawai H, Gu J, Shilatifard A, Yuan ZM (2003). "Molekulární základ funkční inaktivace p53 leukemickým proteinem MLL-ELL". Mol. Buňka. Biol. 23 (12): 4230–46. doi:10.1128 / MCB.23.12.4230-4246.2003. PMC 156137. PMID 12773566.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.