USO1 - USO1

USO1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2W3C
Identifikátory
Aliasy	USO1P115, TAP, VDP, faktor přenosu vezikul USO1
Externí ID	OMIM: 603344 MGI: 1929095 HomoloGene: 2754 Genové karty: USO1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	75,814,286 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	92,202,798 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • Golgiho aparát; • membrána; • Golgiho membrána; • transportní váček; • endoplazmatické retikulum; • perinukleární oblast cytoplazmy; • ER na Golgiho transportní membránu vezikul; • Golgiho zásobník; • fibrilární centrum;
Biologický proces	• fúze vezikul s Golgiho aparátem; • Fúze lipidové dvojvrstvy; • transcytóza; • ER na transport zprostředkovaný vezikuly Golgi; • Povlak vezikul COPII; • Dokování vezikul Golgi; • transport bílkovin; • transport intracelulárních proteinů; • transport zprostředkovaný vezikuly; • Golgiho organizace; • doprava; • malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou; • lokalizace sekrečních granulí; • regulace buněčné odpovědi na inzulínový stimul;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8615
	56041
	ENSG00000138768
	ENSMUSG00000029407
	O60763
	Q9Z1Z0
	NM_001290049; NM_003715
	NM_019490
	NP_001276978; NP_003706
	NP_062363
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Obecný vezikulární transportní faktor p115 je protein že u lidí je kódován USO1 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]^[9]^[10]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je protein periferní membrány, který se recykluje mezi cytosol a Golgiho aparát v době mezifáze. Je regulován fosforylace: defosforylovaný protein se asociuje s Golgiho membránou a disociuje z membrány při fosforylaci. Proteiny spojené s Ras 1 rekrutuje tento protein k pokrytí proteinového komplexu IICOPII ) vezikuly během pučení z endoplazmatické retikulum (ER), kde interaguje se sadou asociovaných s vezikuly COPII SNARE za vzniku komplexu cis-SNARE, který podporuje cílení na Golgiho aparát. Transport z ER do cis / mediální Golgiho kompartmentu vyžaduje působení tohoto genového produktu, GOLGA2 a gigantin postupně.^[10]

Interakce

USO1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138768 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029407 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Sohda M, Misumi Y, Yano A, Takami N, Ikehara Y (březen 1998). „Fosforylace dokovacího proteinu vezikulů p115 reguluje jeho asociaci s Golgiho membránou“. J Biol Chem. 273 (9): 5385–8. doi:10.1074 / jbc.273.9.5385. PMID 9478999.
^ Nakamura N, Lowe M, Levine TP, Rabouille C, Warren G (červen 1997). „Vezikulární dokovací protein p115 váže mitoticky regulovaným způsobem GM130, protein matice cis-Golgi.“ Buňka. 89 (3): 445–55. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80225-1. PMID 9150144. S2CID 2135774.
^ Whyte JR, Munro S (červen 2002). "Komplexy uvázání váčků v membránovém provozu". J Cell Sci. 115 (Pt 13): 2627–37. PMID 12077354.
^ Short B, Haas A, Barr FA (červen 2005). "Golginy a GTPasy, které dávají identitu a strukturu Golgiho aparátu". Biochim Biophys Acta. 1744 (3): 383–95. doi:10.1016 / j.bbamcr.2005.02.001. PMID 15979508.
^ Puthenveedu MA, Linstedt AD (únor 2004). „Náhrada genu odhaluje, že interakce p115 / SNARE jsou nezbytné pro biogenezi Golgiho“. Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (5): 1253–6. doi:10.1073 / pnas.0306373101. PMC 337039. PMID 14736916.
^ ^A ^b "Entrez Gene: VDP vezikulární dokovací protein p115".
^ ^A ^b ^C ^d Kratší J, Beard MB, Seemann J, Dirac-Svejstrup AB, Warren G (duben 2002). "Sekvenční uvázání golginů a katalýza sestavení SNAREpin proteinem p115 vázajícím vezikuly". J. Cell Biol. 157 (1): 45–62. doi:10.1083 / jcb.200112127. PMC 2173270. PMID 11927603.
^ ^A ^b ^C Allan BB, Moyer BD, Balch WE (červenec 2000). "Rab1 nábor p115 do komplexu cis-SNARE: programování nadějných COPII váčků pro fúzi". Věda. 289 (5478): 444–8. doi:10.1126 / science.289.5478.444. PMID 10903204.

Další čtení

Waters MG, Clary DO, Rothman JE (1992). „Pro intercisternální transport v Golgiho zásobníku je vyžadován nový protein o periferní membráně 115 kD“. J. Cell Biol. 118 (5): 1015–26. doi:10.1083 / jcb.118.5.1015. PMC 2289595. PMID 1512287.
Barr FA, Nakamura N, Warren G (1998). „Mapování interakce mezi GRASP65 a GM130, složkami proteinového komplexu podílejícího se na skládání Golgi cisternae“. EMBO J.. 17 (12): 3258–68. doi:10.1093 / emboj / 17.12.3258. PMC 1170664. PMID 9628863.
Nelson DS, Alvarez C, Gao YS, García-Mata R, Fialkowski E, Sztul E (1998). „Membránový transportní faktor TAP / p115 cykluje mezi Golgiho a dřívějšími sekrečními oddíly a obsahuje odlišné domény potřebné pro jeho lokalizaci a funkci.“. J. Cell Biol. 143 (2): 319–31. doi:10.1083 / jcb.143.2.319. PMC 2132831. PMID 9786945.
Allan BB, Moyer BD, Balch WE (2000). "Rab1 nábor p115 do komplexu cis-SNARE: programování nadějných COPII váčků pro fúzi". Věda. 289 (5478): 444–8. doi:10.1126 / science.289.5478.444. PMID 10903204.
Dirac-Svejstrup AB, Kratší J, Waters MG, Warren G (2000). „Fosforylace proteinu p115 vázajícího vezikuly enzymem podobným kasein kináze II je nutná pro opětovné sestavení Golgiho z izolovaných mitotických fragmentů.“. J. Cell Biol. 150 (3): 475–88. doi:10.1083 / jcb.150.3.475. PMC 2175190. PMID 10931861.
Alvarez C, Garcia-Mata R, Hauri HP, Sztul E (2001). „Interaktivní proteiny p115 GM130 a gigantin se účastní endoplazmatického retikula-Golgiho přenosu“. J. Biol. Chem. 276 (4): 2693–700. doi:10,1074 / jbc.M007957200. PMID 11035033.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Brunati AM, Marin O, Folda A, Meggio F, Pinna LA (2001). „Možné důsledky kasein kinázy Golgiho aparátu ve fosforylaci proteinu p115 Ser-940 dokujícího vezikuly: studie s peptidovými substráty“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 284 (3): 817–22. doi:10.1006 / bbrc.2001.5049. PMID 11396975.
Kratší J, Beard MB, Seemann J, Dirac-Svejstrup AB, Warren G (2002). "Sekvenční uvázání golginů a katalýza sestavení SNAREpin proteinem p115 vázajícím vezikuly". J. Cell Biol. 157 (1): 45–62. doi:10.1083 / jcb.200112127. PMC 2173270. PMID 11927603.
Krátký B, Preisinger C, Schaletzky J, Kopajtich R, Barr FA (2003). „GTPáza Rab6 reguluje nábor komplexu dynaktinu na Golgiho membrány“. Curr. Biol. 12 (20): 1792–5. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 01221-6. PMID 12401177. S2CID 14031165.
Chiu R, Novikov L, Mukherjee S, Shields D (2003). „Fragment štěpení kaspázy p115 indukuje fragmentaci Golgiho aparátu a apoptózu“. J. Cell Biol. 159 (4): 637–48. doi:10.1083 / jcb.200208013. PMC 2173109. PMID 12438416.
Han SJ, Lee JH, Kim CG, Hong SH (2003). "Identifikace p115 jako proteinu vázajícího se na PLCgamma1 a role homologických domén Src PLCgamma1 ve vezikulárním transportu". Biochem. Biophys. Res. Commun. 300 (3): 649–55. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02884-X. PMID 12507498.
García-Mata R, Sztul E (2003). "Membránově vázaný protein p115 interaguje s GBF1, ARF guanin-nukleotidovým výměnným faktorem". EMBO Rep. 4 (3): 320–5. doi:10.1038 / sj.embor.embor762. PMC 1315890. PMID 12634853.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138768 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029407 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9478999-5] Sohda M, Misumi Y, Yano A, Takami N, Ikehara Y (březen 1998). „Fosforylace dokovacího proteinu vezikulů p115 reguluje jeho asociaci s Golgiho membránou“. J Biol Chem. 273 (9): 5385–8. doi:10.1074 / jbc.273.9.5385. PMID 9478999.

[pmid9150144-6] Nakamura N, Lowe M, Levine TP, Rabouille C, Warren G (červen 1997). „Vezikulární dokovací protein p115 váže mitoticky regulovaným způsobem GM130, protein matice cis-Golgi.“ Buňka. 89 (3): 445–55. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80225-1. PMID 9150144. S2CID 2135774.

[pmid12077354-7] Whyte JR, Munro S (červen 2002). "Komplexy uvázání váčků v membránovém provozu". J Cell Sci. 115 (Pt 13): 2627–37. PMID 12077354.

[pmid15979508-8] Short B, Haas A, Barr FA (červen 2005). "Golginy a GTPasy, které dávají identitu a strukturu Golgiho aparátu". Biochim Biophys Acta. 1744 (3): 383–95. doi:10.1016 / j.bbamcr.2005.02.001. PMID 15979508.

[pmid14736916-9] Puthenveedu MA, Linstedt AD (únor 2004). „Náhrada genu odhaluje, že interakce p115 / SNARE jsou nezbytné pro biogenezi Golgiho“. Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (5): 1253–6. doi:10.1073 / pnas.0306373101. PMC 337039. PMID 14736916.

[entrez-10] A ^b "Entrez Gene: VDP vezikulární dokovací protein p115".

[pmid11927603-11] A ^b ^C ^d Kratší J, Beard MB, Seemann J, Dirac-Svejstrup AB, Warren G (duben 2002). "Sekvenční uvázání golginů a katalýza sestavení SNAREpin proteinem p115 vázajícím vezikuly". J. Cell Biol. 157 (1): 45–62. doi:10.1083 / jcb.200112127. PMC 2173270. PMID 11927603.

[pmid10903204-12] A ^b ^C Allan BB, Moyer BD, Balch WE (červenec 2000). "Rab1 nábor p115 do komplexu cis-SNARE: programování nadějných COPII váčků pro fúzi". Věda. 289 (5478): 444–8. doi:10.1126 / science.289.5478.444. PMID 10903204.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]