SCFD1 - SCFD1

SCFD1
Identifikátory
Aliasy	SCFD1, C14orf163, RA410, SLY1, SLY1P, STXBP1L2, doména rodiny sec1 obsahující 1
Externí ID	OMIM: 618207 MGI: 1924233 HomoloGene: 5650 Genové karty: SCFD1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	30,735,850 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	51,450,101 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba N-konce proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • syntaxinová vazba; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • Golgiho aparát; • membrána endoplazmatického retikula; • membrána; • síť cis-Golgi; • buněčná membrána; • Golgiho transportní komplex; • Vezikuly spojené s Golgi; • Golgiho cisterna membrána; • endoplazmatické retikulum;
Biologický proces	• negativní regulace sestavy autofagozomu; • regulace ER na transport zprostředkovaný vezikulemi Golgi; • reakce na hypoxii; • regulace transportu bílkovin; • retrográdní transport zprostředkovaný vezikuly, Golgi do ER; • transport toxinů; • transport zprostředkovaný vezikulemi po Golgi; • dokování vezikul zapojené do exocytózy; • Povlak vezikul COPII; • buněčná morfogeneze; • transport bílkovin; • reakce na toxickou látku; • transport zprostředkovaný vezikuly;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23256
	76983
	ENSG00000092108
	ENSMUSG00000020952
	Q8WVM8
	Q8BRF7
NM_001257376; NM_001283031; NM_001283032; NM_001283033; NM_016106;
	NM_182835
	NM_029825; NM_001306178
NP_001244305; NP_001269960; NP_001269961; NP_001269962; NP_057190;
	NP_878255
	NP_001293107; NP_084101
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteiny obsahující doménu rodiny Sec1 je protein že u lidí je kódován SCFD1 gen.^[5]

Interakce

SCFD1 bylo prokázáno komunikovat s USO1.^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000092108 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020952 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: SCFD1 sec1 rodinná doména obsahující 1“.
^ Kratší J, Beard MB, Seemann J, Dirac-Svejstrup AB, Warren G (duben 2002). "Sekvenční uvázání golginů a katalýza sestavení SNAREpin proteinem p115 vázajícím vezikuly". J. Cell Biol. 157 (1): 45–62. doi:10.1083 / jcb.200112127. PMC 2173270. PMID 11927603.
^ Allan BB, Moyer BD, Balch WE (červenec 2000). "Rab1 nábor p115 do komplexu cis-SNARE: programování nadějných COPII váčků pro fúzi". Věda. 289 (5478): 444–8. doi:10.1126 / science.289.5478.444. PMID 10903204.

Další čtení

Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Hirose H, Arasaki K, Dohmae N, Takio K, Hatsuzawa K, Nagahama M, Tani K, Yamamoto A, Tohyama M, Tagaya M (2004). „Důsledek ZW10 při transportu membrány mezi endoplazmatickým retikulem a Golgi“. EMBO J.. 23 (6): 1267–78. doi:10.1038 / sj.emboj.7600135. PMC 381410. PMID 15029241.
Williams AL, Ehm S, Jacobson NC, Xu D, Hay JC (2004). „vazba rsly1 na syntaxin 5 je nutná pro transport endoplazmatického retikula na Golgi, ale nepodporuje přístupnost motivu SNARE“. Mol. Biol. Buňka. 15 (1): 162–75. doi:10,1091 / mbc.E03-07-0535. PMC 307537. PMID 14565970.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2003). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801.
Dulubova I, Yamaguchi T, Arac D, Li H, Huryeva I, Min SW, Rizo J, Sudhof TC (2003). „Konvergence a divergence v mechanismu vázání SNARE proteiny podobnými Sec1 / Munc18“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (1): 32–7. doi:10.1073 / pnas.232701299. PMC 140874. PMID 12506202.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro.“ DNA Res. 5 (6): 355–64. CiteSeerX 10.1.1.322.2143. doi:10.1093 / dnares / 5.6.355. PMID 10048485.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Matsuo N, Ogawa S, Takagi T, Wanaka A, Mori T, Matsuyama T, Pinsky DJ, Stern DM, Tohyama M (1997). „Klonování putativního proteinu spojeného s transportem vezikul, RA410, z kultivovaných krysích astrocytů a jeho exprese v ischemickém mozku krysy“. J. Biol. Chem. 272 (26): 16438–44. doi:10.1074 / jbc.272.26.16438. PMID 9195952.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000092108 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020952 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: SCFD1 sec1 rodinná doména obsahující 1“.

[pmid11927603-6] Kratší J, Beard MB, Seemann J, Dirac-Svejstrup AB, Warren G (duben 2002). "Sekvenční uvázání golginů a katalýza sestavení SNAREpin proteinem p115 vázajícím vezikuly". J. Cell Biol. 157 (1): 45–62. doi:10.1083 / jcb.200112127. PMC 2173270. PMID 11927603.

[pmid10903204-7] Allan BB, Moyer BD, Balch WE (červenec 2000). "Rab1 nábor p115 do komplexu cis-SNARE: programování nadějných COPII váčků pro fúzi". Věda. 289 (5478): 444–8. doi:10.1126 / science.289.5478.444. PMID 10903204.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]