TIMP1 - TIMP1 - Wikipedia

TIMP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1D2B, 1OO9, 1UEA, 2J0T, 3MA2, 3V96
Identifikátory
Aliasy	TIMP1, CLGI, EPA, EPO, HCI, TIMP, TIMP-1, TIMP inhibitor metalopeptidázy 1
Externí ID	OMIM: 305370 MGI: 98752 HomoloGene: 36321 Genové karty: TIMP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	47,586,789 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	20,874,735 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita inhibitoru peptidázy; • GO: aktivita inhibitoru enzymu 0048551; • aktivita cytokinů; • vazba kovových iontů; • vazba proteázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita inhibitoru metaloendopeptidázy; • aktivita růstového faktoru; • vazba iontů zinku;
Buněčná složka	• extracelulární matrix; • extracelulární oblast; • bazální membrána; • extracelulární exosom; • lumen destiček alfa granule; • extracelulární; • lumen endoplazmatického retikula; • kolagen;
Biologický proces	• reakce na cytokiny; • negativní regulace aktivity peptidázy; • stárnutí; • reakce na peptidový hormon; • degranulace krevních destiček; • hojení ran; • negativní regulace apoptotického procesu; • demontáž extracelulární matice; • negativní regulace migrace buněk trofoblastu; • reakce na organickou látku; • aktivace buněk; • vývoj chrupavky; • regulace integrinem zprostředkované signální dráhy; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • reakce na hormon; • negativní regulace proteolýzy membránového proteinu ektodomény; • negativní regulace aktivity endopeptidázy; • GO: 0048553 negativní regulace katalytické aktivity; • negativní regulace aktivity metalopeptidázy; • posttranslační modifikace; • buněčný proteinový metabolický proces; • regulace aktivity receptoru; • náhrada pojivové tkáně podílející se na hojení ran zánětlivou odpovědí; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7076
	21857
	ENSG00000102265
	ENSMUSG00000001131
	P01033; Q6FGX5
	P12032
	NM_003254
	NM_001044384; NM_001294280; NM_011593
	NP_003245; NP_003245.1
	NP_001037849; NP_001281209; NP_035723
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Inhibitor metalopeptidázy TIMP 1, také známý jako TIMP1, a tkáňový inhibitor metaloproteináz, je glykoprotein, který je exprimován z několika tkání organismů.

Tento protein je členem Rodina TIMP. The glykoprotein je přirozený inhibitor z matricové metaloproteinázy (MMP), skupina peptidáz účastnících se degradace extracelulární matrix. Kromě své inhibiční role proti většině známých MMP je kódovaný protein schopen podporovat buňka proliferace v široké škále buněčných typů a může mít také antiapoptotickou funkci.

Funkce

TIMP1 je inhibiční molekula, která reguluje matrixové metaloproteinázy (MMP) a disintegrin-metaloproteinázy (ADAM a ADAMTS).^[5] Při regulaci MMP hraje TIMP1 zásadní roli ve složení extracelulární matrix (ECM), hojení ran,^[6] a těhotenství.^[7]^[8]^[9]

Dysregulovaná aktivita TIMP1 byla zahrnuta do rakoviny.^[10] V těhotenství hraje TIMP1 regulační roli v procesu implantace, zejména invazi cytotrofoblastů do děložního endometria.^[11] Dále hraje roli při regulaci transkripčního profilu tkání plodu a placenty spojených s časnými stádii těhotenství.^[12] Studie připisují tuto roli mechanismu zahrnujícímu strukturu chromatinu v promotorové oblasti TIMP1, což implikuje nové farmaceutické možnosti pro terapeutickou regulaci TIMP1. V souladu s tím lze manipulovat s TIMP1 in vitro pomocí technik, jako je knock-out TIMP1.^[13]^[14]^[15]

Ostatní jména

Erytroidní potenciační aktivita (EPA)
Lidský inhibitor kolagenázy (HCI)

Regulace výrazu TIMP

Transkripce z toho gen je vysoce indukovatelný v reakci na mnohé cytokiny a hormony. Kromě toho je výraz z některých, ale ne všech neaktivních X chromozomy naznačuje, že tato genová inaktivace je polymorfní člověk ženy. Tento gen je umístěn v intronu 6 z synapsin I gen a přepisuje se v opačném směru.^[16]

V adrenokortikálních buňkách trofický hormon ACTH indukuje expresi TIMP-1 a zvýšení exprese TIMP je také spojeno se sníženou aktivitou kolagenázy.^[17]

Bylo zjištěno, že zvýšená exprese TIMP1 souvisí s horší prognózou různých nádorů, jako je např karcinom hrtanu ^[18] nebo melanom.^[19]

Viz také

TIMP2, TIMP3, TIMP4

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102265 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001131 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Brew K, Nagase H (leden 2010). „Tkáňové inhibitory metaloproteináz (TIMP): starodávná rodina se strukturální a funkční rozmanitostí“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1803 (1): 55–71. doi:10.1016 / j.bbamcr.2010.01.003. PMC 2853873. PMID 20080133.
^ Brew K, Dinakarpandian D, Nagase H (březen 2000). "Tkáňové inhibitory metaloproteináz: vývoj, struktura a funkce". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - proteinová struktura a molekulární enzymologie. 1477 (1–2): 267–83. doi:10.1016 / S0167-4838 (99) 00279-4. PMID 10708863.
^ Graham CH, Lala PK (srpen 1991). "Mechanismus řízení invaze trofoblastů in situ". Journal of Cellular Physiology. 148 (2): 228–34. doi:10.1002 / jcp.1041480207. PMID 1652588.
^ Nothnick WB, Soloway P, Curry TE (květen 1997). „Posouzení role tkáňového inhibitoru metaloproteinázy-1 (TIMP-1) během periovulačního období u samic myší bez funkčního genu TIMP-1“. Biologie reprodukce. 56 (5): 1181–8. doi:10.1095 / biolreprod56.5.1181. PMID 9160717.
^ Nothnick WB (září 2000). „Narušení tkáňového inhibitoru genu pro metaloproteinázu-1 vede u změněných reprodukčních cyklů a morfologie dělohy u samic myší v reprodukčním věku“. Biologie reprodukce. 63 (3): 905–12. doi:10.1095 / biolreprod63.3.905. PMID 10952938.
^ Kim YS, Kim SH, Kang JG, Ko JH (2012). „Úroveň exprese a dynamika glykanu určují čisté účinky TIMP-1 na progresi rakoviny“. Zprávy BMB. 45 (11): 623–8. doi:10.5483 / BMBRep.2012.45.11.233. PMC 4133808. PMID 23187000.
^ Graham CH, Lala PK (srpen 1991). "Mechanismus řízení invaze trofoblastů in situ". Journal of Cellular Physiology. 148 (2): 228–34. doi:10.1002 / jcp.1041480207. PMID 1652588.
^ Vincent ZL, MD Mitchell, Ponnampalam AP (prosinec 2015). „Regulace TIMP-1 v lidské placentě a fetálních membránách lipopolysacharidem a demethylačním činidlem 5-aza-2'-deoxycytidinem“. Reprodukční biologie a endokrinologie. 13: 136. doi:10.1186 / s12958-015-0132-r. PMC 4687108. PMID 26691525.
^ Gong Y, Scott E, Lu R, Xu Y, Oh WK, Yu Q (2013-10-15). „TIMP-1 podporuje akumulaci fibroblastů spojených s rakovinou a progresi rakoviny“. PLOS ONE. 8 (10): e77366. doi:10.1371 / journal.pone.0077366. PMC 3797040. PMID 24143225.
^ Jourquin J, Tremblay E, Bernard A, Charton G, Chaillan FA, Marchetti E, Roman FS, Soloway PD, Dive V, Yiotakis A, Khrestchatisky M, Rivera S (listopad 2005). „Tkáňový inhibitor metaloproteináz-1 (TIMP-1) moduluje smrt neuronů, axonální plasticitu a učení a paměť“. Evropský žurnál neurovědy. 22 (10): 2569–78. doi:10.1111 / j.1460-9568.2005.04426.x. PMID 16307599.
^ Graham CH, Lala PK (srpen 1991). "Mechanismus řízení invaze trofoblastů in situ". Journal of Cellular Physiology. 148 (2): 228–34. doi:10.1002 / jcp.1041480207. PMID 1652588.
^ „Entrez Gene: TIMP1 TIMP metallopeptidase inhibitor 1“.
^ Reichenstein M, Reich R, LeHoux JG, Hanukoglu I (únor 2004). „ACTH indukuje expresi TIMP-1 a inhibuje kolagenázu v buňkách kůry nadledvin“. Molekulární a buněčná endokrinologie. 215 (1–2): 109–14. CiteSeerX 10.1.1.538.7614. doi:10.1016 / j.mce.2003.11.011. PMID 15026182.
^ Ma J, Wang J, Fan W, Pu X, Zhang D, Fan C, Xiong L, Zhu H, Xu N, Chen R, Liu S (prosinec 2013). „Upregulovaný TIMP-1 koreluje se špatnou prognózou karcinomu dlaždicových buněk hrtanu“. International Journal of Clinical and Experimental Pathology. 7 (1): 246–54. PMC 3885479. PMID 24427345.
^ Tarhini AA, Lin Y, Yeku O, LaFramboise WA, Ashraf M, Sander C, Lee S, Kirkwood JM (leden 2014). „Podpis čtyř markerů TNF-RII, TGF-α, TIMP-1 a CRP je prognostický pro horší přežití u vysoce rizikového chirurgicky resekovaného melanomu“. Journal of Translational Medicine. 12: 19. doi:10.1186/1479-5876-12-19. PMC 3909384. PMID 24457057.

Další čtení

Hornebeck W (prosinec 2003). „Down-regulace tkáňového inhibitoru matrix metaloproteázy-1 (TIMP-1) ve staré lidské kůži přispívá k degradaci matrix a zhoršenému růstu a přežití buněk“. Pathologie-Biologie. 51 (10): 569–73. doi:10.1016 / j.patbio.2003.09.003. PMID 14622947.
Gardner J, Ghorpade A (prosinec 2003). "Tkáňový inhibitor metaloproteinázy (TIMP) -1: rovnováha TIMPed matrixových metaloproteináz v centrálním nervovém systému". Journal of Neuroscience Research. 74 (6): 801–6. doi:10.1002 / jnr.10835. PMC 3857704. PMID 14648584.

externí odkazy

The MEROPS online databáze peptidáz a jejich inhibitorů: I35.001
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P01033 (Inhibitor metaloproteinázy 1) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102265 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001131 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[5] Brew K, Nagase H (leden 2010). „Tkáňové inhibitory metaloproteináz (TIMP): starodávná rodina se strukturální a funkční rozmanitostí“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - výzkum molekulárních buněk. 1803 (1): 55–71. doi:10.1016 / j.bbamcr.2010.01.003. PMC 2853873. PMID 20080133.

[6] Brew K, Dinakarpandian D, Nagase H (březen 2000). "Tkáňové inhibitory metaloproteináz: vývoj, struktura a funkce". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - proteinová struktura a molekulární enzymologie. 1477 (1–2): 267–83. doi:10.1016 / S0167-4838 (99) 00279-4. PMID 10708863.

[7] Graham CH, Lala PK (srpen 1991). "Mechanismus řízení invaze trofoblastů in situ". Journal of Cellular Physiology. 148 (2): 228–34. doi:10.1002 / jcp.1041480207. PMID 1652588.

[8] Nothnick WB, Soloway P, Curry TE (květen 1997). „Posouzení role tkáňového inhibitoru metaloproteinázy-1 (TIMP-1) během periovulačního období u samic myší bez funkčního genu TIMP-1“. Biologie reprodukce. 56 (5): 1181–8. doi:10.1095 / biolreprod56.5.1181. PMID 9160717.

[9] Nothnick WB (září 2000). „Narušení tkáňového inhibitoru genu pro metaloproteinázu-1 vede u změněných reprodukčních cyklů a morfologie dělohy u samic myší v reprodukčním věku“. Biologie reprodukce. 63 (3): 905–12. doi:10.1095 / biolreprod63.3.905. PMID 10952938.

[pmid23187000-10] Kim YS, Kim SH, Kang JG, Ko JH (2012). „Úroveň exprese a dynamika glykanu určují čisté účinky TIMP-1 na progresi rakoviny“. Zprávy BMB. 45 (11): 623–8. doi:10.5483 / BMBRep.2012.45.11.233. PMC 4133808. PMID 23187000.

[11] Graham CH, Lala PK (srpen 1991). "Mechanismus řízení invaze trofoblastů in situ". Journal of Cellular Physiology. 148 (2): 228–34. doi:10.1002 / jcp.1041480207. PMID 1652588.

[12] Vincent ZL, MD Mitchell, Ponnampalam AP (prosinec 2015). „Regulace TIMP-1 v lidské placentě a fetálních membránách lipopolysacharidem a demethylačním činidlem 5-aza-2'-deoxycytidinem“. Reprodukční biologie a endokrinologie. 13: 136. doi:10.1186 / s12958-015-0132-r. PMC 4687108. PMID 26691525.

[13] Gong Y, Scott E, Lu R, Xu Y, Oh WK, Yu Q (2013-10-15). „TIMP-1 podporuje akumulaci fibroblastů spojených s rakovinou a progresi rakoviny“. PLOS ONE. 8 (10): e77366. doi:10.1371 / journal.pone.0077366. PMC 3797040. PMID 24143225.

[14] Jourquin J, Tremblay E, Bernard A, Charton G, Chaillan FA, Marchetti E, Roman FS, Soloway PD, Dive V, Yiotakis A, Khrestchatisky M, Rivera S (listopad 2005). „Tkáňový inhibitor metaloproteináz-1 (TIMP-1) moduluje smrt neuronů, axonální plasticitu a učení a paměť“. Evropský žurnál neurovědy. 22 (10): 2569–78. doi:10.1111 / j.1460-9568.2005.04426.x. PMID 16307599.

[15] Graham CH, Lala PK (srpen 1991). "Mechanismus řízení invaze trofoblastů in situ". Journal of Cellular Physiology. 148 (2): 228–34. doi:10.1002 / jcp.1041480207. PMID 1652588.

[16] „Entrez Gene: TIMP1 TIMP metallopeptidase inhibitor 1“.

[pmid15026182-17] Reichenstein M, Reich R, LeHoux JG, Hanukoglu I (únor 2004). „ACTH indukuje expresi TIMP-1 a inhibuje kolagenázu v buňkách kůry nadledvin“. Molekulární a buněčná endokrinologie. 215 (1–2): 109–14. CiteSeerX 10.1.1.538.7614. doi:10.1016 / j.mce.2003.11.011. PMID 15026182.

[pmid_=_24427345-18] Ma J, Wang J, Fan W, Pu X, Zhang D, Fan C, Xiong L, Zhu H, Xu N, Chen R, Liu S (prosinec 2013). „Upregulovaný TIMP-1 koreluje se špatnou prognózou karcinomu dlaždicových buněk hrtanu“. International Journal of Clinical and Experimental Pathology. 7 (1): 246–54. PMC 3885479. PMID 24427345.

[pmid_=_24457057-19] Tarhini AA, Lin Y, Yeku O, LaFramboise WA, Ashraf M, Sander C, Lee S, Kirkwood JM (leden 2014). „Podpis čtyř markerů TNF-RII, TGF-α, TIMP-1 a CRP je prognostický pro horší přežití u vysoce rizikového chirurgicky resekovaného melanomu“. Journal of Translational Medicine. 12: 19. doi:10.1186/1479-5876-12-19. PMC 3909384. PMID 24457057.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]