Syntenin-1 - Syntenin-1
Syntenin-1 je protein že u lidí je kódován SDCBP gen.[5]
Funkce
Protein kódovaný tímto genem byl původně identifikován jako molekula spojující signalizaci zprostředkovanou syndekanem do cytoskeletu. Synteninový protein obsahuje tandemově opakované PDZ domény, které vážou cytoplazmatické C-koncové domény různých transmembránových proteinů. Tento protein může také ovlivnit organizaci cytoskeletální membrány, adhezi buněk, obchodování s proteiny a aktivaci transkripčních faktorů. Protein je primárně lokalizován na spojích adherenů spojených s membránou a fokálních adhezích, ale nachází se také v endoplazmatickém retikulu a jádru. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících různé izoformy.[6]
Interakce
SDCBP bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137575 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028249 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Grootjans JJ, Zimmermann P, Reekmans G, Smets A, Degeest G, Dürr J, David G (leden 1998). „Syntenin, protein PDZ, který váže cytoplazmatické domény syndekanu“. Proc Natl Acad Sci USA. 94 (25): 13683–8. doi:10.1073 / pnas.94.25.13683. PMC 28366. PMID 9391086.
- ^ "Entrez Gene: SDCBP syndekan vázající protein (syntenin)".
- ^ Lin D, Gish GD, Songyang Z, Pawson T (únor 1999). „Karboxylový konec efrinů třídy B představuje motiv vázající doménu PDZ“. J. Biol. Chem. 274 (6): 3726–33. doi:10.1074 / jbc.274.6.3726. PMID 9920925.
- ^ A b Hirbec H, Francis JC, Lauri SE, Braithwaite SP, Coussen F, Mulle C, Dev KK, Coutinho V, Meyer G, Isaac JT, Collingridge GL, Henley JM, Couthino V (únor 2003). "Rychlá a diferenciální regulace AMPA a kainátových receptorů na hipokampálních mechových vláknech synapsemi PICK1 a GRIP". Neuron. 37 (4): 625–38. doi:10.1016 / s0896-6273 (02) 01191-1. PMC 3314502. PMID 12597860.
- ^ Hirbec H, Perestenko O, Nishimune A, Meyer G, Nakanishi S, Henley JM, Dev KK (květen 2002). „Proteiny PDZ PICK1, GRIP a syntenin váží více podtypů receptoru glutamátu. Analýza motivů vázajících PDZ“. J. Biol. Chem. 277 (18): 15221–4. doi:10.1074 / jbc.C200112200. PMID 11891216.
- ^ A b Geijsen N, Uings IJ, Pals C, Armstrong J, McKinnon M, Raaijmakers JA, Lammers JW, Koenderman L, Coffer PJ (srpen 2001). "Cytokinově specifická transkripční regulace prostřednictvím proteinu interagujícího s IL-5Ralfa". Věda. 293 (5532): 1136–8. doi:10.1126 / science.1059157. PMID 11498591. S2CID 28003281.
- ^ Jannatipour M, Dion P, Khan S, Jindal H, Fan X, Laganière J, Chishti AH, Rouleau GA (srpen 2001). „Schwannominová izoforma-1 interaguje se synteninem prostřednictvím domén PDZ“. J. Biol. Chem. 276 (35): 33093–100. doi:10,1074 / jbc.M105792200. PMID 11432873.
- ^ A b Tomoda T, Kim JH, Zhan C, Hatten ME (březen 2004). „Role Unc51.1 a jejích vazebných partnerů v růstu axonů CNS“. Genes Dev. 18 (5): 541–58. doi:10.1101 / gad.1151204. PMC 374236. PMID 15014045.
- ^ Chen F, Du Y, Zhang Z, Chen G, Zhang M, Shu HB, Zhai Z, Chen D (duben 2008). „Syntenin negativně reguluje signalizaci IL-1R / TLR4 zprostředkovanou TRAF6“. Buňka. Signál. 20 (4): 666–74. doi:10.1016 / j.cellsig.2007.12.002. PMID 18234474.
- ^ "Výsledky - mentha: interaktivní prohlížeč". mentha.uniroma2.it. Citováno 2017-05-04.
Další čtení
- Bass MD, Humphries MJ (2002). „Cytoplazmatické interakce syndekanu-4 organizují signalizaci adhezního receptoru a růstového faktoru“. Biochem. J. 368 (Pt 1): 1–15. doi:10.1042 / BJ20021228. PMC 1222989. PMID 12241528.
- Harrod TR, Justement LB (2003). "Hodnocení funkce transmembránového proteinu tyrosin fosfatázy CD148 v biologii lymfocytů". Immunol. Res. 26 (1–3): 153–66. doi:10,1385 / IR: 26: 1-3: 153. PMID 12403354. S2CID 26502472.
- Sarkar D, Boukerche H, Su ZZ, Fisher PB (2005). „mda-9 / syntenin: nedávné poznatky o novém genu pro buněčnou signalizaci a s metastázami“. Pharmacol. Ther. 104 (2): 101–15. doi:10.1016 / j.pharmthera.2004.08.004. PMID 15518882.
- „Dopis: Stav psychiatrie“. N. Engl. J. Med. 292 (18): 982. 1975. doi:10.1056 / NEJM197505012921826. PMID 1117941.
- Lin JJ, Jiang H, Fisher PB (1998). „Gen 9 spojený s diferenciací melanomu, mda-9, je gen reagující na lidský gama interferon“. Gen. 207 (2): 105–10. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00562-3. PMID 9511750.
- Torres R, Firestein BL, Dong H, Staudinger J, Olson EN, Huganir RL, Bredt DS, Gale NW, Yancopoulos GD (1999). "PDZ proteiny se vážou, shlukují a synapticky kolokalizují s Eph receptory a jejich efrinovými ligandy". Neuron. 21 (6): 1453–63. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80663-7. PMID 9883737. S2CID 15441813.
- Lin D, Gish GD, Songyang Z, Pawson T (1999). „Karboxylový konec efrinů třídy B představuje motiv vázající doménu PDZ“. J. Biol. Chem. 274 (6): 3726–33. doi:10.1074 / jbc.274.6.3726. PMID 9920925.
- Fernández-Larrea J, Merlos-Suárez A, Ureña JM, Baselga J, Arribas J (1999). „Role proteinu PDZ v časné sekreční dráze pro cílení proTGF-alfa na povrch buňky“. Mol. Buňka. 3 (4): 423–33. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80470-0. PMID 10230395.
- Fialka I, Steinlein P, Ahorn H, Böck G, Burbelo PD, Haberfellner M, Lottspeich F, Paiha K, Pasquali C, Huber LA (1999). „Identifikace synteninu jako proteinu apikálního časného endocytového kompartmentu v psích ledvinových buňkách Madin-Darby“. J. Biol. Chem. 274 (37): 26233–9. doi:10.1074 / jbc.274.37.26233. PMID 10473577.
- Grootjans JJ, Reekmans G, Ceulemans H, David G (2000). „Vazba Syntenin-syndekan vyžaduje syndekan-syntézu a spolupráci obou PDZ domén synteninu“. J. Biol. Chem. 275 (26): 19933–41. doi:10,1074 / jbc.M002459200. PMID 10770943.
- Koroll M, Rathjen FG, Volkmer H (2001). „Molekula neurofascinu pro rozpoznávání neurálních buněk interaguje se synteninem-1, ale ne se synteninem-2, přičemž obě tyto látky odhalují samoassociační aktivitu.“. J. Biol. Chem. 276 (14): 10646–54. doi:10,1074 / jbc.M010647200. PMID 11152476.
- Zimmermann P, Tomatis D, Rosas M, Grootjans J, Leenaerts I, Degeest G, Reekmans G, Coomans C, David G (2001). „Charakterizace synteninu, proteinu PDZ vázajícího se syndekan, jako složky buněčných adhezních míst a mikrofilamentů“. Mol. Biol. Buňka. 12 (2): 339–50. doi:10,1091 / mbc. 12.2.339. PMC 30947. PMID 11179419.
- Jannatipour M, Dion P, Khan S, Jindal H, Fan X, Laganière J, Chishti AH, Rouleau GA (2001). „Schwannominová izoforma-1 interaguje se synteninem prostřednictvím domén PDZ“. J. Biol. Chem. 276 (35): 33093–100. doi:10,1074 / jbc.M105792200. PMID 11432873.
- Geijsen N, Uings IJ, Pals C, Armstrong J, McKinnon M, Raaijmakers JA, Lammers JW, Koenderman L, Coffer PJ (2001). "Cytokinově specifická transkripční regulace prostřednictvím proteinu interagujícího s IL-5Ralfa". Věda. 293 (5532): 1136–8. doi:10.1126 / science.1059157. PMID 11498591. S2CID 28003281.
- Hirbec H, Perestenko O, Nishimune A, Meyer G, Nakanishi S, Henley JM, Dev KK (2002). „Proteiny PDZ PICK1, GRIP a syntenin váží více podtypů receptoru glutamátu. Analýza motivů vázajících PDZ“ (PDF). J. Biol. Chem. 277 (18): 15221–4. doi:10.1074 / jbc.C200112200. PMID 11891216. S2CID 13732968.
- Koo TH, Lee JJ, Kim EM, Kim KW, Kim HD, Lee JH (2002). „Syntenin je nadměrně exprimován a podporuje migraci buněk v buněčných liniích metastatického lidského karcinomu prsu a žaludku“. Onkogen. 21 (26): 4080–8. doi:10.1038 / sj.onc.1205514. PMID 12037664.
- Biederer T, Sara Y, Mozhayeva M, Atasoy D, Liu X, Kavalali ET, Südhof TC (2002). "SynCAM, molekula synaptické adheze, která řídí sestavu synapsí". Věda. 297 (5586): 1525–31. doi:10.1126 / science.1072356. PMID 12202822. S2CID 14529914.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |