Sulfobacillus thermosulfidooxidans - Sulfobacillus thermosulfidooxidans

Sulfobacillus thermosulfidooxidans
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Firmicutes
Třída:
Incertae sedis
Rod:
Sulfobacillus
Druh:
S. thermosulfidooxidans
Binomické jméno
Sulfobacillus thermosulfidooxidans
Golovacheva a Karavaiko 1991[1]

Sulfobacillus thermosulfidooxidans je druh z bakterie z rod Sulfobacillus. Je to acidofilní, mixotrofní, mírně termofilní, Grampozitivní, sporulující fakultativní anaerobní. Jak jeho název napovídá, je schopen oxidující síra.[2][3][4]

Taxonomie

S. thermosulfidooxidans, stejně jako rod Sulfobacillus, byly poprvé popsány v roce 1978 na základě izolátů z Kazachstán.[5][1] S. thermosulfidooxidans je druh druhu rodu.[1] Rod má nejistou taxonomickou polohu,[3][1] pravděpodobně souvisí s rodem Thermaerobacter a možná představující buď hlubokou větev Firmicutes nebo samostatný kmen.[3][6]

Distribuce a ekologie

S. thermosulfidooxidans je široce distribuován v přírodních i umělých kyselé prostředí, včetně horké prameny a kyselý důl odvodnění. Kmeny byly izolovány z různých míst včetně Čína,[7] Chile,[4] Kazachstán,[5] Kalifornie,[2] a Zambie.[7] Ve srovnání s jinými bakteriemi, které se často vyskytují v podobných prostředích, Sulfobacillus druhy jsou obvykle přítomny v relativně malém množství.[2][7]

Růst a metabolismus

S. thermosulfidooxidans je acidofilní a mírně termofilní; zatímco různé kmeny se mírně liší pH a optimum teplotního růstu, všichni preferují prostředí kolem pH 2,0 s optimálními růstovými teplotami v rozmezí od 45 ° C do 55 ° C.[5][8][3][4] S. thermosulfidooxidans je žehlička - a síra -oxidující, schopný oxidace elementární síry, tetrathionát, a sulfidy.[2]

Genom

The genomy několika S. thermosulfidooxidans kmeny byly sekvenovány, což ukazuje velikost genomu 3,2-3,9 megabáze, s Obsah GC 48-49%[4][2][3][7] a řada bioinformaticky definována geny kódující proteiny v rozmezí od minima asi 3200[3] na maximum asi 3900.[2] Všechny sekvenované genomy obsahují velké množství geny spojený s síra oxidace; například geny kódující sirná oxygenáza reduktáza (SOR) a heterodisulfid reduktáza -jako enzymy.[2][3][7] Genetický základ oxidační kapacity železa tohoto druhu je méně jasný, ale pravděpodobně zahrnuje a sulfocyanin protein.[2][3][7] Genom také obsahuje velké množství transportní proteiny, včetně těch, které se specializují na ion kovu výtok a několik CRISPR / Cas systémy.[3] Existují důkazy o horizontální přenos genů jako významný přispěvatel do S. thermosulfidooxidans evoluce, včetně neočekávaného vztahu mezi genem SOR a podobnými geny nalezenými pouze v archaea.[2][3][7]

Reference

  1. ^ A b C d "Rod Sulfobacillus". Seznam prokaryotických jmen se stáním v nomenklatuře. Citováno 18. listopadu 2018.
  2. ^ A b C d E F G h i Spravedlnost, Nicholas B; Norman, Anders; Brown, Christopher T; Singh, Andrea; Thomas, Brian C; Banfield, Jillian F (2014). „Srovnání environmentálních a izolovaných genomů Sulfobacillus odhaluje různé metabolity uhlíku, síry, dusíku a vodíku“. BMC Genomics. 15 (1): 1107. doi:10.1186/1471-2164-15-1107. PMC  4378227. PMID  25511286.
  3. ^ A b C d E F G h i j Guo, Xue; Yin, Huaqun; Liang, Yili; Hu, Qi; Zhou, Xishu; Xiao, Yunhua; Ma, Liyuan; Zhang, Xian; Qiu, Guanzhou; Liu, Xueduan; Mormile, Melanie R. (18. června 2014). „Srovnávací analýza genomu odhaluje metabolickou všestrannost a environmentální adaptace kmene ST Sulfobacillus thermosulfidooxidans ST“. PLOS ONE. 9 (6): e99417. doi:10.1371 / journal.pone.0099417. PMC  4062416. PMID  24940621.
  4. ^ A b C d Travisany, D .; Di Genova, A .; Sepulveda, A .; Bobadilla-Fazzini, R. A .; Parada, P .; Maass, A. (26. října 2012). „Návrh genomové sekvence kmene Cutipay Sulfobacillus thermosulfidooxidans, domorodých bakterií izolovaných z přirozeně extrémního těžebního prostředí v severním Chile“. Journal of Bacteriology. 194 (22): 6327–6328. doi:10.1128 / JB.01622-12. PMC  3486405. PMID  23105067.
  5. ^ A b C Golovacheva, RS; Karavaĭko, GI (1978). „[Sulfobacillus, nový rod termofilních sporulujících bakterií]“. Mikrobiologie. 47 (5): 815–22. PMID  101742.
  6. ^ Ludwig, Wolfgang; Schleifer, Karl-Heinz; Whitman, William B. (2001). "Revidovaná cestovní mapa kmene Firmicutes". In Vos, Paul; Garrity, George; Jones, Dorothy; Krieg, Noel R .; Ludwig, Wolfgang; Rainey, Fred A .; Schleifer, Karl-Heinz; Whitman, William B. (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 3: The Firmicutes (2. vyd.). Springer. ISBN  978-0-387-95041-9.
  7. ^ A b C d E F G Zhang, Xian; Liu, Xueduan; Liang, Yili; Guo, Xue; Xiao, Yunhua; Ma, Liyuan; Miao, Bo; Liu, Hongwei; Peng, Deliang; Huang, Wenkun; Zhang, Yuguang; Yin, Huaqun; Drake, Harold L. (1. dubna 2017). „Adaptivní vývoj extrémního acidofilu Sulfobacillus thermosulfidooxidans, který je potenciálně poháněn horizontálním přenosem genů a ztrátou genů“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 83 (7). doi:10.1128 / AEM.03098-16. PMC  5359484. PMID  28115381.
  8. ^ Bogdanova, T. I. (1. května 2006). „Sulfobacillus thermotolerans sp. Nov., Termotolerantní, chemolithotrofní bakterie“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 56 (5): 1039–1042. doi:10.1099 / ijs.0.64106-0. PMID  16627651.