STAXI RNA motiv - STAXI RNA motif - Wikipedia
| STAXI RNA | |
|---|---|
 Konsenzuální sekundární struktura STAXI RNA | |
| Identifikátory | |
| Symbol | STAXI |
| Rfam | RF01728 |
| Další údaje | |
| RNA typ | sRNA |
| Domény | Enterobacteriales |
| PDB struktur | PDBe |
The Ssbp, topoizomeráza, antirestrikce, motiv RNA XerDC Integrase (STAXI RNA motiv) je konzervovaný RNA struktura podobná identifikována pomocí bioinformatika.[1] STAXI RNA se nacházejí poblíž geny kódování bílkoviny které interagují s DNA (Ssbp, topoizomeráza, XerDC integráza ) nebo jsou spojeny s takovými proteiny (antirestrikce proteiny, které inhibují restrikční enzymy ). Toto pozorování zvýšilo možnost, že instance motivu STAXI fungují jako jednovláknové molekuly DNA, možná během replikace DNA nebo Oprava DNA. Na druhou stranu motivy STAXI často obsahují koncové smyčky odpovídající stabilní UNCG tetraloop, ale DNA verze tohoto tetraloopu (TNCG) není nijak zvlášť stabilní. Motiv STAXI se skládá z jednoduchého pseudoknot struktura, která se opakuje dvakrát nebo vícekrát (viz schéma).
Ve stejné studii byla identifikována řada dalších RNA, včetně:
- Motiv Bacteroidales-1 RNA
- Chlorobi-1 RNA motiv
- Motiv RNA JUMPstart
- Motiv RNA-Lactis-plasmid
- Ocean-V RNA motiv
- motiv potC RNA
- motiv psaA RNA
- TwoAYGGAY RNA motiv
- vůdce ykkC-yxkD
Reference
- ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J a kol. (Březen 2010). „Srovnávací genomika odhaluje 104 kandidátských strukturovaných RNA z bakterií, archea a jejich metagenomů“. Genome Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.
externí odkazy
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |