RNF4 - RNF4

RNF4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EA6, 2XEU, 4PPE
Identifikátory
Aliasy	RNF4SLX5, SNURF, RES4-26, protein prstového prstu 4
Externí ID	OMIM: 602850 MGI: 1201691 HomoloGene: 37711 Genové karty: RNF4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	2,625,320 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	34,355,629 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba na androgenní receptory; • identická vazba na protein; • vazba nukleosomů; • aktivita transferázy; • vazba transkripčního faktoru; • Vazba polymeru SUMO; • vazba iontů zinku; • aktivita koaktivátoru transkripce nukleárního receptoru závislá na ligandu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Tělo PML; • nukleoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• signální dráha androgenového receptoru; • regulace transkripce, DNA-šablony; • ubikvitinace spojená s proteinem K63; • reakce na látku obsahující arsen; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • ubikvitinace spojená s proteinem K11; • regulace sestavy kinetochore; • ubikvitinace spojená s proteinem K48; • ubikvitinace spojená s proteinem K6; • ubikvitinace bílkovin; • regulace sestavy vřetena; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • autoubiquitination bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6047
	19822
	ENSG00000063978
	ENSMUSG00000029110
	P78317
	Q9QZS2
	NM_002938; NM_001185009; NM_001185010
	NM_011278; NM_001304269; NM_001304270
	NP_001171938; NP_001171939; NP_002929
	NP_001291198; NP_001291199; NP_035408
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Prstový protein na prstenci 4 je protein že u lidí je kódován RNF4 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem obsahuje a Prst doména prsten a funguje jako transkripční faktor. Ukázalo se, že tento protein interaguje s a inhibuje aktivitu TRPS1, supresor transkripce transkripce zprostředkované GATA. Transkripční represor ZNF278 /PATZ1 Bylo zjištěno, že interaguje s tímto proteinem, a tím snižuje vylepšení androgenní receptor -závislá transkripce zprostředkovaná tímto proteinem. Studie myší a krysích protějšků naznačují roli tohoto proteinu v spermatogeneze.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že RNF4 komunikovat s TCF20,^[7] PATZ1^[8]^[9] a Androgenní receptor.^[9]^[10]^[11]

Viz také

Prst doména prsten

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000063978 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029110 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Chiariotti L, Benvenuto G, Fedele M, Santoro M, Simeone A, Fusco A, Bruni CB (leden 1998). "Identifikace a charakterizace nového mapování genu RING-finger (RNF4) na 4p16.3". Genomika. 47 (2): 258–65. doi:10.1006 / geno.1997.5105. PMID 9479498.
^ ^A ^b „Entrez Gene: protein prstenů RNF4 4“.
^ Lyngsø C, Bouteiller G, Damgaard CK, Ryom D, Sanchez-Muñoz S, Nørby PL, Bonven BJ, Jørgensen P (srpen 2000). "Interakce mezi transkripčním faktorem SPBP a pozitivním kofaktorem RNF4. Souhra mezi proteiny vázajícími zinkové prsty". The Journal of Biological Chemistry. 275 (34): 26144–9. doi:10,1074 / jbc.M003405200. PMID 10849425.
^ Fedele M, Benvenuto G, Pero R, Majello B, Battista S, Lembo F, Vollono E, Day PM, Santoro M, Lania L, Bruni CB, Fusco A, Chiariotti L (březen 2000). „Nový člen rodiny BTB / POZ, PATZ, se sdružuje s prstovým proteinem RNF4 RING a působí jako transkripční represor“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (11): 7894–901. doi:10.1074 / jbc.275.11.7894. PMID 10713105.
^ ^A ^b Pero R, Lembo F, Palmieri EA, Vitiello C, Fedele M, Fusco A, Bruni CB, Chiariotti L (únor 2002). „PATZ tlumí RNF4 zprostředkované zvýšení transkripce závislé na androgenním receptoru“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (5): 3280–5. doi:10,1074 / jbc.M109491200. PMID 11719514.
^ Moilanen AM, Poukka H, Karvonen U, Häkli M, Jänne OA, Palvimo JJ (září 1998). „Identifikace nového proteinu prstu RING jako koregulátoru při transkripci genů zprostředkovaných steroidními receptory“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (9): 5128–39. doi:10,1128 / mcb.18.9.5128. PMC 109098. PMID 9710597.
^ Poukka H, Aarnisalo P, Santti H, Jänne OA, Palvimo JJ (leden 2000). „Coregulator malý nukleární RING prstový protein (SNURF) zvyšuje transkripci zprostředkovanou Sp1 a steroidními receptory různými mechanismy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (1): 571–9. doi:10.1074 / jbc.275.1.571. PMID 10617653.

Další čtení

Moilanen AM, Poukka H, Karvonen U, Häkli M, Jänne OA, Palvimo JJ (září 1998). „Identifikace nového proteinu prstu RING jako koregulátoru při transkripci genů zprostředkovaných steroidními receptory“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (9): 5128–39. doi:10,1128 / mcb.18.9.5128. PMC 109098. PMID 9710597.
Hadano S, Ishida Y, Ikeda JE (červen 1998). „Primární struktura a genomická organizace pěti nových transkriptů umístěných v blízkosti genu Huntingtonovy choroby na lidském chromozomu 4p16.3“. Výzkum DNA. 5 (3): 177–86. doi:10.1093 / dnares / 5.3.177. PMID 9734812.
Poukka H, Aarnisalo P, Santti H, Jänne OA, Palvimo JJ (leden 2000). „Coregulator malý nukleární RING prstový protein (SNURF) zvyšuje transkripci zprostředkovanou Sp1 a steroidními receptory různými mechanismy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (1): 571–9. doi:10.1074 / jbc.275.1.571. PMID 10617653.
Fedele M, Benvenuto G, Pero R, Majello B, Battista S, Lembo F, Vollono E, Day PM, Santoro M, Lania L, Bruni CB, Fusco A, Chiariotti L (březen 2000). „Nový člen rodiny BTB / POZ, PATZ, se sdružuje s prstovým proteinem RNF4 RING a působí jako transkripční represor“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (11): 7894–901. doi:10.1074 / jbc.275.11.7894. PMID 10713105.
Galili N, Nayak S, Epstein JA, Buck CA (květen 2000). „Rnf4, protein RING exprimovaný ve vyvíjejícím se nervovém a reprodukčním systému, interaguje s Gscl, genem v kritické oblasti DiGeorge“. Dynamika vývoje. 218 (1): 102–11. doi:10.1002 / (SICI) 1097-0177 (200005) 218: 1 <102 :: AID-DVDY9> 3.0.CO; 2-A. PMID 10822263.
Lyngsø C, Bouteiller G, Damgaard CK, Ryom D, Sanchez-Muñoz S, Nørby PL, Bonven BJ, Jørgensen P (srpen 2000). "Interakce mezi transkripčním faktorem SPBP a pozitivním kofaktorem RNF4. Souhra mezi proteiny vázajícími zinkové prsty". The Journal of Biological Chemistry. 275 (34): 26144–9. doi:10,1074 / jbc.M003405200. PMID 10849425.
Häkli M, Karvonen U, Jänne OA, Palvimo JJ (červen 2001). „Prstový protein RING SNURF je bifunkční protein, který má DNA vazebnou aktivitu“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (26): 23653–60. doi:10,1074 / jbc.M009891200. PMID 11319220.
Saville B, Poukka H, Wormke M, Janne OA, Palvimo JJ, Stoner M, Samudio I, Safe S (leden 2002). "Kooperativní koaktivace estrogenového receptoru alfa v lidských buňkách rakoviny prsu ZR-75 pomocí SNURF a proteinu vázajícího TATA". The Journal of Biological Chemistry. 277 (4): 2485–97. doi:10,1074 / jbc.M109021200. PMID 11696545.
Pero R, Lembo F, Palmieri EA, Vitiello C, Fedele M, Fusco A, Bruni CB, Chiariotti L (únor 2002). „PATZ tlumí RNF4 zprostředkované zvýšení transkripce závislé na androgenním receptoru“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (5): 3280–5. doi:10,1074 / jbc.M109491200. PMID 11719514.
Yan W, Hirvonen-Santti SJ, Palvimo JJ, Toppari J, Jänne OA (říjen 2002). „Exprese nukleárního prstového proteinu RING SNURF / RNF4 během vývoje varlat u krys naznačuje roli ve zrání spermatidů“. Mechanismy rozvoje. 118 (1–2): 247–53. doi:10.1016 / S0925-4773 (02) 00261-7. PMID 12351196. S2CID 15579434.
Pero R, Lembo F, Chieffi P, Del Pozzo G, Fedele M, Fusco A, Bruni CB, Chiariotti L (září 2003). "Translační regulace nového transkriptu RNF4 specifického pro varlata". Molekulární reprodukce a vývoj. 66 (1): 1–7. doi:10,1002 / mrd.10322. PMID 12874792. S2CID 6206480.
Kaiser FJ, Möröy T, Chang GT, Horsthemke B, Lüdecke HJ (říjen 2003). „Prstový protein RING RNF4, koregulátor transkripce, interaguje s transkripčním faktorem TRPS1“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (40): 38780–5. doi:10,1074 / jbc.M306259200. PMID 12885770.
Lin DY, Fang HI, Ma AH, Huang YS, Pu YS, Jenster G, Kung HJ, Shih HM (prosinec 2004). „Negativní modulace transkripční aktivity androgenového receptoru pomocí Daxx“. Molekulární a buněčná biologie. 24 (24): 10529–41. doi:10.1128 / MCB.24.24.10529-10541.2004. PMC 533990. PMID 15572661.

externí odkazy

RNF4 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000063978 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029110 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9479498-5] Chiariotti L, Benvenuto G, Fedele M, Santoro M, Simeone A, Fusco A, Bruni CB (leden 1998). "Identifikace a charakterizace nového mapování genu RING-finger (RNF4) na 4p16.3". Genomika. 47 (2): 258–65. doi:10.1006 / geno.1997.5105. PMID 9479498.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: protein prstenů RNF4 4“.

[pmid10849425-7] Lyngsø C, Bouteiller G, Damgaard CK, Ryom D, Sanchez-Muñoz S, Nørby PL, Bonven BJ, Jørgensen P (srpen 2000). "Interakce mezi transkripčním faktorem SPBP a pozitivním kofaktorem RNF4. Souhra mezi proteiny vázajícími zinkové prsty". The Journal of Biological Chemistry. 275 (34): 26144–9. doi:10,1074 / jbc.M003405200. PMID 10849425.

[pmid10713105-8] Fedele M, Benvenuto G, Pero R, Majello B, Battista S, Lembo F, Vollono E, Day PM, Santoro M, Lania L, Bruni CB, Fusco A, Chiariotti L (březen 2000). „Nový člen rodiny BTB / POZ, PATZ, se sdružuje s prstovým proteinem RNF4 RING a působí jako transkripční represor“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (11): 7894–901. doi:10.1074 / jbc.275.11.7894. PMID 10713105.

[pmid11719514-9] A ^b Pero R, Lembo F, Palmieri EA, Vitiello C, Fedele M, Fusco A, Bruni CB, Chiariotti L (únor 2002). „PATZ tlumí RNF4 zprostředkované zvýšení transkripce závislé na androgenním receptoru“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (5): 3280–5. doi:10,1074 / jbc.M109491200. PMID 11719514.

[pmid9710597-10] Moilanen AM, Poukka H, Karvonen U, Häkli M, Jänne OA, Palvimo JJ (září 1998). „Identifikace nového proteinu prstu RING jako koregulátoru při transkripci genů zprostředkovaných steroidními receptory“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (9): 5128–39. doi:10,1128 / mcb.18.9.5128. PMC 109098. PMID 9710597.

[pmid10617653-11] Poukka H, Aarnisalo P, Santti H, Jänne OA, Palvimo JJ (leden 2000). „Coregulator malý nukleární RING prstový protein (SNURF) zvyšuje transkripci zprostředkovanou Sp1 a steroidními receptory různými mechanismy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (1): 571–9. doi:10.1074 / jbc.275.1.571. PMID 10617653.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]