Pyrobaculum aerophilum - Pyrobaculum aerophilum

Pyrobaculum aerophilum
Vědecká klasifikace
Doména:	Archaea
Království:	Crenarchaeota
Kmen:	Crenarchaeota
Třída:	Thermoprotei
Objednat:	Termoprotealy
Rodina:	Thermoproteaceae
Rod:	Pyrobaculum
Druh:	P. aerophilum
Binomické jméno
	Pyrobaculum aerophilum; Völkl a kol., 1993

Pyrobaculum aerophilum je jednobuněčný mikroorganismus rodu Pyrobaculum. První Pyrobaculum druh, který má být sekvenován, byl P. aerophilum. Je to tyčový tvar hypertermofilní archaeum poprvé izolován z vroucího otvoru mořské vody na pláži Maronti, Ischia. Tvoří charakteristické koncové sférické těleso (tzv. „Golfové hole“) Termoproteus a Pyrobaculum. Jeho typový kmen je IM2; DSM 7523).^[1] Jeho optimální teplota pro růst je kolem bod varu pro vodu.^[2] Jeho optimální pH pro růst je 7,0. Bylo zjištěno, že síra inhibuje svůj růst.^[1]

Jeho sekvence kruhového genomu je 2 222 430 Bp na délku a obsahuje 2605 sekvencí kódujících protein (CDS). Je schopen aerobního dýchání. Jeho název odkazuje na tuto schopnost: aerophilum pocházející z řecký: ἀήρ ("aero"), což znamená vzduch, a φιλο (philo), což znamená milovat. Produkuje kolonie, které jsou kulaté a šedavě žluté. V průběhu používá organické i anorganické sloučeniny dýchání.^[1]^[3]

Analýza celého genomu prokázala, že ve svých mRNA chybí 5 'nepřekládané oblasti. To znamená, že nezaměstnává Shine-Delgarno sekvence pro zahájení syntézy proteinů.^[4]

Reference

^ ^A ^b ^C Völkl P; Huber R; Drobner E; et al. (Září 1993). „Pyrobaculum aerophilum sp. Nov., Nový hypertermofilní archaeum redukující dusičnany“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 59 (9): 2918–26. PMC 182387. PMID 7692819. Citováno 2013-07-25.
^ Ausili, Alessio; Vitale, Annalisa; Labella, Tullio; Rosso, Francesco; et al. (2012). „Alkohol dehydrogenáza z hypertermofilního archaeonu Pyrobaculum aerophilum: Stabilita při vysoké teplotě“. Archivy biochemie a biofyziky. 525 (1): 40–46. doi:10.1016 / j.abb.2012.05.019. ISSN 0003-9861. PMID 22683471.
^ Cozen, A.E .; Weirauch, M. T .; Pollard, K. S.; Bernick, D. L .; et al. (2008). "Transkripční mapa respirační všestrannosti u hypertermofilního Crenarchaeon Pyrobaculum aerophilum". Journal of Bacteriology. 191 (3): 782–794. doi:10.1128 / JB.00965-08. ISSN 0021-9193. PMC 2632070. PMID 19047344.
^ Fitz-Gibbon, Sorel T .; Ladner, Heidi; Kim, Ung-Jin; Stetter, Karl O .; Simon, Melvin I .; Miller, Jeffrey H. (2002-01-22). „Genome sequence of the hyperthermophilic crenarchaeon Pyrobaculum aerophilum“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (2): 984–989. Bibcode:2002PNAS ... 99..984F. doi:10.1073 / pnas.241636498. ISSN 0027-8424. PMC 117417. PMID 11792869.

Další čtení

Fitz-Gibbon ST; Ladner H; Kim UJ; Stetter KO; et al. (Leden 2002). „Genome sequence of the hyperthermophilic crenarchaeon Pyrobaculum aerophilum“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (2): 984–9. Bibcode:2002PNAS ... 99..984F. doi:10.1073 / pnas.241636498. PMC 117417. PMID 11792869.
Kaper, T .; Talik, B .; Ettema, T. J .; Bos, H .; et al. (2005). „Amylomaltáza z Pyrobaculum aerophilum IM2 produkuje termoreverzibilní škrobové gely“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 71 (9): 5098–5106. doi:10.1128 / AEM.71.9.5098-5106.2005. ISSN 0099-2240. PMC 1214675. PMID 16151092.
Vallin, I .; Low, H. (1968). "Účinek piericidinu A na procesy spojené s energií v submochondriálních částicích". European Journal of Biochemistry. 5 (3): 402–408. doi:10.1111 / j.1432-1033.1968.tb00383.x. ISSN 0014-2956.
Solomons, J. T. Graham; Johnsen, Ulrike; Schoenheit, Peter; Davies, Christopher (27. srpna 2013). „3-Fosfoglycerát je alosterický aktivátor pyruvátkinázy z Hyperthermophilic ArchaeonPyrobaculum aerophilum“. Biochemie. 52 (34): 5865–5875. doi:10.1021 / bi400761b. PMID 23879743.

externí odkazy

Tento Crenarchaeota související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[pmid7692819-1] A ^b ^C Völkl P; Huber R; Drobner E; et al. (Září 1993). „Pyrobaculum aerophilum sp. Nov., Nový hypertermofilní archaeum redukující dusičnany“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 59 (9): 2918–26. PMC 182387. PMID 7692819. Citováno 2013-07-25.

[AusiliVitale2012-2] Ausili, Alessio; Vitale, Annalisa; Labella, Tullio; Rosso, Francesco; et al. (2012). „Alkohol dehydrogenáza z hypertermofilního archaeonu Pyrobaculum aerophilum: Stabilita při vysoké teplotě“. Archivy biochemie a biofyziky. 525 (1): 40–46. doi:10.1016 / j.abb.2012.05.019. ISSN 0003-9861. PMID 22683471.

[CozenWeirauch2008-3] Cozen, A.E .; Weirauch, M. T .; Pollard, K. S.; Bernick, D. L .; et al. (2008). "Transkripční mapa respirační všestrannosti u hypertermofilního Crenarchaeon Pyrobaculum aerophilum". Journal of Bacteriology. 191 (3): 782–794. doi:10.1128 / JB.00965-08. ISSN 0021-9193. PMC 2632070. PMID 19047344.

[4] Fitz-Gibbon, Sorel T .; Ladner, Heidi; Kim, Ung-Jin; Stetter, Karl O .; Simon, Melvin I .; Miller, Jeffrey H. (2002-01-22). „Genome sequence of the hyperthermophilic crenarchaeon Pyrobaculum aerophilum“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (2): 984–989. Bibcode:2002PNAS ... 99..984F. doi:10.1073 / pnas.241636498. ISSN 0027-8424. PMC 117417. PMID 11792869.

[1]

[2]

[3]

[4]