Determinant stability par - Par stability determinant
| FstAT | |
|---|---|
 Sekundární struktura FstAT | |
| Identifikátory | |
| Symbol | fstAT |
| Rfam | RF01797 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Gen; antitoxin |
| Domény | Enterococcus faecalis |
| PDB struktur | PDBe |
| První systém toxin-antitoxin typu I. | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | Fst_toxin | ||||||||
| Pfam | PF13955 | ||||||||
| TCDB | 1.C.64 | ||||||||
| OPM nadčeleď | 225 | ||||||||
| OPM protein | 2kv5 | ||||||||
| |||||||||
The odst determinant stability je 400 bp místo pAD1 plazmid který kóduje a toxin-antitoxinový systém typu I. v Enterococcus faecalis.[1][2] Byl to první takový plazmid modul závislosti najdete v grampozitivní bakterie.[3]
The odst lokus obsahuje dva geny: první který kóduje 33-aminokyselina toxický protein a gen pro RNAII, malý anti-toxin RNA, který inhibuje první překlad.[4] Tyto dva geny se nacházejí na opačné straně DNA prameny a sdílet a 5' oblast, kde se předpokládá, že mají antisense interakce.[4] Jejich RNA sekundární struktury byly předpovězeny výpočetně, komplementární oblasti se zdají být prezentovány na exponovaných smyčky pro interakci.[4]
odst udržuje pAD1 pomocí postsegregačního zabíjení (PSK). Pokud dceřiná buňka není zdědit the odst nestabilní RNAII rychle degraduje a zanechá fst toxin s dlouhým poločasem poškození, nebo poškození dceřiná buňka.[5]
Viz také
Reference
- ^ Weaver KE, Walz KD, Heine MS (listopad 1998). „Izolace derivátu Escherichia coli-Enterococcus faecalis kyvadlového vektoru pAM401 citlivého na teplotu pro udržování v E. faecalis a jeho použití při hodnocení mechanismu stabilizace plazmidu závislého na pAD1 par“. Plasmid. 40 (3): 225–232. doi:10.1006 / plas.1998.1368. PMID 9806859.
- ^ Weaver KE, Jensen KD, Colwell A, Sriram SI (duben 1996). "Funkční analýza plasmidu Enterococcus faecalis s plasmidem pAD1, determinantem stability, par". Mol. Microbiol. 20 (1): 53–63. doi:10.1111 / j.1365-2958.1996.tb02488.x. PMID 8861204.
- ^ Shokeen S, Greenfield TJ, Ehli EA, Rasmussen J, Perrault BE, Weaver KE (březen 2009). „Intramolekulární spirála proti směru zajišťuje stabilitu RNA kódující toxin v Enterococcus faecalis“. J. Bacteriol. 191 (5): 1528–1536. doi:10.1128 / JB.01316-08. PMC 2648210. PMID 19103923.
- ^ A b C Greenfield TJ, Ehli E, Kirshenmann T, Franch T, Gerdes K, Weaver KE (srpen 2000). „Antisense RNA par lokusu pAD1 reguluje expresi toxického peptidu s 33 aminokyselinami neobvyklým mechanismem.“ Mol. Microbiol. 37 (3): 652–660. doi:10.1046 / j.1365-2958.2000.02035.x. PMID 10931358.
- ^ Gerdes K, Gultyaev AP, Franch T, Pedersen K, Mikkelsen ND (1997). "Antisense RNA regulovaná programovaná smrt buněk". Annu. Genet. 31: 1–31. doi:10.1146 / annurev.genet.31.1.1. PMID 9442888.
Další čtení
- Gerdes K, Gultyaev AP, Franch T, Pedersen K, Mikkelsen ND (1997). "Antisense RNA regulovaná programovaná smrt buněk". Annu. Genet. 31: 1–31. doi:10.1146 / annurev.genet.31.1.1. PMID 9442888.
- Poulsen LK, Larsen NW, Molin S, Andersson P (listopad 1989). „Rodina genů kódujících funkci zabíjení buněk může být zachována u všech gramnegativních bakterií.“ Mol. Microbiol. 3 (11): 1463–1472. doi:10.1111 / j.1365-2958.1989.tb00131.x. PMID 2693900.
- Hayes F (září 2003). „Toxiny-antitoxiny: údržba plazmidů, programovaná buněčná smrt a zastavení buněčného cyklu“. Věda. 301 (5639): 1496–1499. doi:10.1126 / science.1088157. PMID 12970556.
- Gerdes K, Rasmussen PB, Molin S (květen 1986). „Unikátní typ udržovací funkce plazmidu: postsegregační zabíjení buněk bez plazmidu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 83 (10): 3116–3120. doi:10.1073 / pnas.83.10.3116. PMC 323463. PMID 3517851.