Pancrustacea - Pancrustacea
Pancrustacea | |
---|---|
Vědecká klasifikace ![]() | |
Království: | Animalia |
Kmen: | Arthropoda |
Clade: | Pancrustacea Zrzavý & Štys, 1997 |
Subphyla | |
Synonyma | |
Tetraconata Dohle, 2001 |
Pancrustacea je clade, zahrnující všechny korýši a hexapods.[1] Toto seskupení je v rozporu s Atelocerata hypotéza, ve které Myriapoda a Hexapoda jsou sesterské taxony, a Korýš jsou jen vzdáleněji příbuzní. Od roku 2010 je taxon Pancrustacea považován za dobře přijímaný.[2] Clade byl také povolán Tetraconata, s odkazem na čtyři kuželové buňky v ommatidia.[3] Někteří vědci preferují toto jméno jako prostředek, jak se vyhnout záměně s použitím výrazu „pan-“ k označení kladu, který obsahuje skupina korun a všichni zástupci jejích kmenových skupin.[4]
Molekulární studie
A monofyletický Pancrustacea byla podpořena několika molekulárními studiemi,[5][6][7][8][9] ve většině z nich je poddruh Crustacea paraphyletic pokud jde o hmyz (tj. že hmyz pochází od předků korýšů).
Důkazy pro tento kladu pocházejí z molekulárních údajů a morfologických charakteristik. Molekulární data sestávají z porovnání jaderný ribozomální RNA geny, mitochondriální geny ribozomální RNA a protein kódující geny. Morfologická data se skládají z ommatidial struktury (viz oko členovce ), přítomnost někoho neuroblasty, a forma a styl axonogeneze průkopníkem neurony.[10][11]
Regier et al. (2005)
Ve studii z roku 2005 o jaderných genomech Regier et al. navrhuji, aby Hexapoda nejvíce souvisí s Branchiopoda a Cephalocarida + Remipedia, tedy hexapody jsou „suchozemští korýši“, což podporuje hypotézu Pancrustacea, která maxilopody nejsou monofyletické (na následujících kladogramech jsou podtřídy Maxillopoda zvýrazněno). Kromě toho se objevily určité důkazy proti Ostracoda monophyly: ta podtřída Ostracoda Podocopa může tvořit clade s Branchiura.[5]
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cladogram po Regierovi et al. (2005).[5] |
Regier et al. (2010)
Studie jaderných genomů z roku 2010 (Regier et al.) silně podporuje Pancrustacea a silně favorizuje Mandibulata (Myriapoda + Pancrustacea) Paradoxopoda (Myriapoda + Chelicerata ). Podle této studie je Pancrustacea rozdělena do čtyř linií: Oligostraca (Ostracoda, Mystacocarida, Branchiura, Pentastomida ), Vericrustacea (Malacostraca, Thecostraca, Copepoda, Branchiopoda ), Xenocarida (Cephalocarida, Remipedia ) a Hexapoda, s Xenocarida jako sesterskou skupinou Hexapoda (zahrnující "Miracrustacea").[6]
Nové pláště navržené Regierem et al. jsou:
- Vericrustacea ("opravdoví korýši") — Branchiopoda, Copepoda, Malacostraca, Thecostraca;
- Multicrustacea ("četní korýši") — Copepoda, Malacostraca, Thecostraca;
- Communostraca ("ty bez skořápky") — Malacostraca, Thecostraca;
- Miracrustacea ("překvapující korýši") — Cephalocarida, Remipedia, Hexapoda;
- Xenocarida ("podivné krevety") — Cephalocarida, Remipedia.
Z těchto navržených subtypů byla v pozdějších molekulárních studiích potvrzena pouze multicrustacea.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cladogram po Regierovi et al. (2010).[6] |
von Reumont et al. (2012)
V molekulární studii z roku 2012 von Reumont et al. vyzvěte monofyii Vericrustacea: představují čtyři verze cladogramu Pancrustacea (obrázky 1–4) a ve všech čtyřech číslech Remipedia je sesterská skupina Hexapoda, a Branchiopoda je sesterská skupina (Remipedia + Hexapoda ). Jejich data tedy silně naznačují, že Branchiopoda je více spjata s Hexapodou a Remipedií než s Multicrustacea. Na základě těchto údajů navrhují následující scénář vývoje Branchiopoda, Remipedia a Hexapoda: pod vlivem dravých ryb jdou jejich společní předkové do litorální zóna, pak předkové Branchiopoda jdou do pomíjivé sladkovodní stanoviště, zatímco předkové Remipedie jdou do Anchialine jeskyně a předkové Hexapody jdou do přistát.[12]
Jondeung et al. (2012)
Další molekulární studie (mitochondriálních genomů), kterou v roce 2012 provedl Jondeung et al., silně podporují monofyletickou Pancrustacea a místa Malacostraca + Entomostraca a Branchiopoda jako sesterský clade Hexapodovi a místům Cirripedia + Remipedia jako bazální linie Pancrustacea.[13]
Oakley et al. (2013)
V roce 2013 kombinovaná studie morfologie, včetně fosilií, a molekulárních údajů, včetně vyjádřeného tagu sekvence, mitochondriálního genomu, nukleárního genomu a údajů o ribozomální DNA Oakley et al. získal podporu pro tři subtypové rostliny: Oligostraca (Ostracoda, Mystacocarida, Branchiura, Pentastomida), Multicrustacea (Copepoda, Thecostraca, Malacostraca) a kladu, který označují jako Allotriocarida (Branchiopoda, Cephalocarida, Remipedia, Hexapoda), as Ostracoda. V rámci Multicrustacea získali podporu pro clade, kterému navrhují jméno Hexanauplia: Thecostraca + Copepoda. Vztahy uvnitř Allotriocarida zůstávají nejisté: sesterský taxon Hexapoda je buď Remipedia, nebo klade Branchiopoda + Cephalocarida, autoři se však přiklánějí k první verzi (viz „Závěr“, 4), která je rovněž v souladu s von Reumontem et al. (2012).[14][12]
Nově navržené společností Oakley et al. clades jsou:
- Hexanauplia (odkazuje na šest („hexa-“) naupliar molts ) — Copepoda, Thecostraca;
- Allotriocarida („allotrios“ je "podivný", "carida" je "krevety") — Cephalocarida, Branchiopoda, Remipedia, Hexapoda.[14]
Poznámka: Allotriocarida navrhl v roce 2005 také Regier et al. jako Clade # 33,[5] ale vztahy v něm byly jiné a nevybrali si pro to jméno.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cladogram následující po Oakley et al. (2013)[14] |
Rota-Stabelli et al. (2013)
V roce 2013 Rota-Stabelli et al. použil signál v 62 genech kódujících protein shromážděných Regierem et al. v roce 2010 zlepšit znalosti vnitřních vztahů ve skupině Pancrustacea. Tato sada dat vyvozuje vysoce podporovanou nukleotid strom, který se podstatně liší od odpovídajícího, ale špatně podporovaného, aminokyselina jeden. Rozpor mezi stromy založenými na nukleotidech a aminokyselinách je způsoben substitucemi v synonymech kodon rodiny (zejména rodiny serin -TCN a AGY): různé linie členovců jsou odlišně předpojaté ve svém používání serin, arginin, a leucin synonymní kodony a zkreslení serinu koreluje s topologií odvozenou od nukleotidů, ale ne s aminokyselinami. Autoři naznačují, že paralelní, částečně kompozičně řízené, synonymum zkreslení použití kodonů ovlivňuje nukleotidovou topologii. Jak mohou probíhat substituce mezi rodinami serinových kodonů threonin nebo cystein meziprodukty mohou být serinem ovlivněny také datové sady aminokyselin zkreslení použití kodonů. Analýzy naznačují, že a Dayhoff překódování strategie by částečně zmírnilo účinky takového zkreslení. I když aminokyseliny poskytují alternativní hypotézu vztahů pankreatu, nukleotidy ani verze aminokyselin tohoto souboru dat nepřináší dostatek skutečných fylogenetických informací k důkladnému vyřešení vztahů ve skupině, což by mělo být stále považováno za nevyřešené. Aminokyselinový strom se však zdá být pravděpodobnější, protože se zdá, že neobsahuje synonymní zkreslení kodonové rodiny ovlivňující nukleotidový strom. Většina závěrů založených na aminokyselinových sekvencích podporuje clade, který zahrnuje Branchiopoda, Remipedia, Copepoda a Hexapoda (skupina A). Při použití nejlepšího modelu substituce aminokyselin CATGTR, taky Cephalocarida spadá do této skupiny. Ve všech analýzách skupina A (s nebo bez Cephalocarida) je sesterská skupina kladu složená z Malacostraca, Oligostraca a Thecostraca (skupina B).[15]
Následující obrázek ukazuje strom vyplývající z Dayhoff překódování.
. |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Poloha tantulocaridy
Podle Petrunina A.S. a Kolbasov G.A., šestá podtřída Maxillopoda Tantulokarida může ležet uvnitř Thecostraca, tvořící clade s thecostracan infraclass Cirripedia (pokud ano, Thecostraca kromě Tantulocarida je paraphyletic):[16][17]
| |||||||||||||||||||||
Thecostraca cladogram following Petrunina (2012), strana 19, obrázek 8[17] |
Viz také
Reference
- ^ J. Zrzavý & P. Štys (květen 1997). „Základní tělesný plán členovců: poznatky z evoluční morfologie a vývojové biologie“. Journal of Evolutionary Biology. 10 (3): 353–367. doi:10.1046 / j.1420-9101.1997.10030353.x.
- ^ Omar Rota-Stabelli; Ehsan Kayal; Dianne Gleeson; Jennifer Daub; Jeffrey L. Boore; Maximilian J. Telford; Davide Pisani; Mark Blaxter; Dennis V. Lavrov (2010). „Ecdysozoanská mitogenomika: Důkazy o společném původu legovaných bezobratlých, Panarthropoda“. Biologie genomu a evoluce. 2: 425–440. doi:10.1093 / gbe / evq030. PMC 2998192. PMID 20624745. Archivovány od originál dne 10.7.2012.
- ^ W. Dohle (2001). „Jsou hmyz suchozemští korýši? Diskuse o některých nových faktech a argumentech a návrh vlastního jména„ Tetraconata “pro monofyletickou jednotku Crustacea + Hexapoda.“ Annales de la Société Entomologique de France. 37 (1–2): 85–103.
- ^ Stefan Richter, Ole S. Møller a Christian S. Wirkner (2009). „Pokroky ve fylogenetice korýšů“ (PDF). Arthropod Systematika a fylogeneze. 67 (2): 275–286. Archivovány od originál (PDF ) dne 2017-10-22. Citováno 2010-12-08.
- ^ A b C d J. C. Regier; J. W. Shultz; R. E. Kambic (22. února 2005). "Pancrustacean fylogeneze: hexapods jsou suchozemští korýši a maxillopods nejsou monophyletic". Sborník Královské společnosti B. 272 (1561): 395–401. doi:10.1098 / rspb.2004.2917. PMC 1634985. PMID 15734694.
- ^ A b C Jerome C. Regier; Jeffrey W. Shultz; Andreas Zwick; April Hussey; Bernard Ball; Regina Wetzer; Joel W. Martin; Clifford W. Cunningham (25. února 2010). „Vztahy členovců odhalené fylogenomickou analýzou sekvencí kódujících nukleární proteiny“. Příroda. 463 (7284): 1079–1083. doi:10.1038 / nature08742. PMID 20147900.
- ^ Jeffrey W. Shultz a Jerome C. Regier (22. května 2000). „Fylogenetická analýza členovců pomocí dvou genů kódujících nukleární bílkoviny podporuje subtypy korýšů a hexapodů“ (PDF). Sborník Královské společnosti B. 267 (1447): 1011–1019. doi:10.1098 / rspb.2000.1104. PMC 1690640. PMID 10874751.
- ^ Gonzalo Giribet & Carles Ribera (červen 2000). "Přehled fylogeneze členovců: nová data založená na sekvencích ribozomální DNA a přímé optimalizaci znaků". Kladistika. 16 (2): 204–231. doi:10.1111 / j.1096-0031.2000.tb00353.x.
- ^ Francesco Nardi; Giacomo Spinsanti; Jeffrey L. Boore; Antonio Carapelli; Romano Dallai; Francesco Frati (21. března 2003). „Původ hexapodů: monofyletický nebo parafyletický?“ (PDF). Věda. 299 (5614): 1887–1889. doi:10.1126 / science.1078607. PMID 12649480.[trvalý mrtvý odkaz ]
- ^ Stefan Richter (2002). „Koncept Tetraconata: vztahy hexapod-korýš a fylogeneze korýšů“. Organismy Rozmanitost a evoluce. 2 (3): 217–237. doi:10.1078/1439-6092-00048.
- ^ Casey W. Dunn; Andreas Hejnol; David Q. Matus; Kevin Pang; William E. Browne; Stephen A. Smith; Elaine Seaver; Greg W. Rouse; Matthias Obst; Gregory D. Edgecombe; Martin V. Sørensen; Steven H. D. Haddock; Andreas Schmidt-Rhaesa; Akiko Okusu; Reinhardt Møbjerg Kristensen; Ward C. Wheeler; Mark Q. Martindale; Gonzalo Giribet (10. dubna 2008). „Široké fylogenomické vzorkování zlepšuje rozlišení zvířecího stromu života“. Příroda. 452 (10): 745–749. doi:10.1038 / nature06614. PMID 18322464.
- ^ A b C d E Bjoern M. von Reumont; Ronald A. Jenner; Matthew A. Wills; Emiliano Dell'Ampio; Průsmyk Günther; Ingo Ebersberger; Benjamin Meyer; Stefan Koenemann; Thomas M. Iliffe; Alexandros Stamatakis; Oliver Niehuis; Karen Meusemann; Bernhard Misof (březen 2012). „Pancrustaceanská fylogeneze ve světle nových fylogenomických dat: podpora Remipedie jako možné sesterské skupiny Hexapoda“. Molekulární biologie a evoluce. 29 (3): 1031–1045. doi:10,1093 / molbev / msr270. PMID 22049065.
- ^ Amnuay Jondeung; Wirangrong Karinthanyakit; Jitlada Kaewkhumsan (prosinec 2012). „Kompletní mitochondriální genom kraba černého bahna, Scylla serrata (Crustacea: Brachyura: Portunidae) a jeho fylogenetická poloha mezi (pan) korýši“. Zprávy o molekulární biologii. 39 (12): 10921–10937. doi:10.1007 / s11033-012-1992-2. PMID 23053985.
- ^ A b C Todd H. Oakley; Joanna M. Wolfe; Annie R. Lindgren; Alexander K.Zaharoff (leden 2013). „Fylotranskriptomika, která přivede poddané do stáda: monofyletická ostracoda, fosilní umístění a pankreatická fylogeneze“. Molekulární biologie a evoluce. 30 (1): 215–233. doi:10,1093 / molbev / mss216. PMID 22977117.
- ^ Omar Rota-Stabelli; Nicolas Lartillot; Nicolas Lartillot; Davide Pisani (1. ledna 2013). „Předpětí užívání serinových kodonů v hluboké fylogenomice: vztahy pancrustacea jako případová studie“ (PDF). Systematická biologie. 62 (1): 121–133. doi:10.1093 / sysbio / sys077. PMID 22962005.
- ^ Петрунина А.С., Колбасов Г.А. (2011). „Dva druhy tantulokaridy z Bílého moře: co nového nám mohou říct o morfologii, anatomii a fylogenezi těchto drobných parazitických korýšů?“ 11. mezinárodní konference o Copepodě.
- ^ A b Петрунина Александра Сергеевна. (2012). Микроскопические ракообразные класса Tantulocarida: морфология, анатомия, систематика a филогения.