Pan-test interferenční sloučeniny - Pan-assay interference compounds

Diagram znázorňující reprezentativní interferenční sloučeninu pro různé testy. Molekula podobná léku specificky interaguje s cílem B, ale sloučenina podobná PAINS ne specificky interaguje s více cíli

Pan-test interferenční sloučeniny (BOLESTI) jsou chemické sloučeniny které často dávají falešně pozitivní výsledky v vysoce výkonné obrazovky.[1] BOLESTI mají tendenci reagovat nespecificky s četnými biologické cíle spíše než konkrétně ovlivnit jeden požadovaný cíl.[2] Řada rušivých funkční skupiny sdílí mnoho PAINS.[2][3][4]

I když bylo navrženo několik filtrů, které se používají v virtuální projekce a počítačově podporovaný design léčiv,[5] přesnost filtrů s ohledem na sloučeniny, které označují a neoznačují, byla kritizována.[6]

Mezi běžné BOLESTI patří toxoflavin, isothiazolony, hydroxyfenylhydrazony, kurkumin, fenol-sulfonamidy, rhodaniny, enones, chinony, a katecholy.[7]

Viz také

Reference

  1. ^ Dahlin JL, Nissink JW, Strasser JM, Francis S, Higgins L, Zhou H, Zhang Z, Walters MA (březen 2015). „BOLESTI v testu: chemické mechanismy interference testu a promiskuitní enzymatické inhibice pozorované během HTS zachycujícího sulfhydryl“. Journal of Medicinal Chemistry. 58 (5): 2091–113. doi:10.1021 / jm5019093. PMC  4360378. PMID  25634295.
  2. ^ A b Baell J, Walters MA (září 2014). „Chemistry: Chemical podvodníci znemožňují objevování drog“. Příroda. 513 (7519): 481–3. Bibcode:2014 Natur.513..481B. doi:10.1038 / 513481a. PMID  25254460.
  3. ^ Dahlin JL, Walters MA (červenec 2014). „Základní role chemie ve vysoce výkonném třídícím třídění“. Budoucí léčivá chemie. 6 (11): 1265–90. doi:10,4155 / fmc.14,60. PMC  4465542. PMID  25163000.
  4. ^ Baell, JB (25. března 2016). „Feeling Nature's PAINS: Natural Products, Natural Product Drugs, and Pan Assay Interference Compounds (PAINS)“. Journal of Natural Products. 79 (3): 616–28. doi:10.1021 / acs.jnatprod.5b00947. PMID  26900761.
  5. ^ Baell JB, Holloway GA (duben 2010). "Nové substrukturní filtry pro odstranění interferenčních sloučenin pro stanovení (PAINS) ze screeningových knihoven a pro jejich vyloučení v biologických zkouškách". Journal of Medicinal Chemistry. 53 (7): 2719–40. CiteSeerX  10.1.1.394.9155. doi:10.1021 / jm901137j. PMID  20131845.
  6. ^ Capuzzi SJ, Muratov EN, Tropsha A (březen 2017). „Phantom PAINS: Problémy s užitečností výstrah pro interferenční sloučeniny Pan-Assay“. Journal of Chemical Information and Modeling. 57 (3): 417–427. doi:10.1021 / acs.jcim.6b00465. PMC  5411023. PMID  28165734.
  7. ^ Jonathan Baell a Michael A. Walters (24. září 2014). „Chemistry: Chemical podvodníci znemožňují objevování drog“. Příroda. 513 (7519): 481–483. Bibcode:2014 Natur.513..481B. doi:10.1038 / 513481a. PMID  25254460.

Další čtení