PARL - PARL

PARL
Identifikátory
Aliasy	PARL, PSARL, PSARL1, PSENIP2, RHBDS1, PRO2207, rhomboid spojený s presenilinem
Externí ID	OMIM: 607858 MGI: 1277152 HomoloGene: 10239 Genové karty: PARL
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	20,302,387 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy; • aktivita peptidázy serinového typu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • aktivita endopeptidázy serinového typu; • aktivita endopeptidázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • mitochondriální vnitřní membrána; • membrána; • buněčné jádro; • mitochondrie;
Biologický proces	• regulace metabolického procesu reaktivních forem kyslíku; • regulace cílení proteinů na mitochondrie; • regulace proteolýzy; • proteolýza; • proteolýza membránových proteinů; • regulace organizace mitochondrií; • mitochondriální transmembránový transport iontů vápníku;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55486
	381038
	ENSG00000175193
	ENSMUSG00000033918
	Q9H300
	Q5XJY4
NM_001037639; NM_001037640; NM_018622; NM_001324436; NM_001324437;
	NM_001324438
	NM_001005767
	NP_001032728; NP_001311365; NP_001311366; NP_001311367; NP_061092
	NP_001005767
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein podobný kosočtverci spojený s preseniliny, mitochondriální také známý jako mitochondriální intramembránová štěpící proteáza PARL je vnitřní mitochondriální membrána protein že u lidí je kódován PARL gen na chromozomu 3.^[4] Je členem kosodélník rodina intramembránových serinových proteáz.^[5] Tento protein je součástí signální transdukce a apoptóza, stejně jako neurodegenerativní onemocnění a cukrovka typu 2.^[4]^[6]

Struktura

Členové rodiny rhomboidů sdílejí konzervované jádro šesti transmembránový helixy (TMHs), se Ser a Jeho zbytky potřebnými k vytvoření katalytické dyad vložené do TMH-4, respektive TMH-6. Tato dyáda se nachází hluboko pod povrchem membrány, což naznačuje, že v ní dochází k hydrolýze peptidových vazeb hydrofobní fosfolipidová dvojvrstva membrána. Jako člen podrodiny Parl má PARL další N-terminál TMH, které mohou tvořit smyčku s katalytickým jádrem. ^[7]

Funkce

Tento gen kóduje mitochondriální integrální membránový protein. Následující proteolytický při zpracování tohoto proteinu se vytvoří malý peptid (P-beta) a translokuje se do jádra. Tento gen může být zapojen do signální transdukce prostřednictvím regulované intramembránové proteolýzy membránově vázaných prekurzorových proteinů. Variace tohoto genu byla spojena se zvýšeným rizikem cukrovka typu 2. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících různé izoformy.^[4]

Kromě toho je PARL zapojen do apoptózy prostřednictvím svých interakcí s mitochondriální GTPáza optická atrofie 1 (OPA1 ) a Rodina Bcl-2 související protein HAX1. OPA1 hlavně reguluje mitochondriální fúze v mitochondriální vnitřní membrána, ale poté proteolytické štěpení PARL, jeho krátká, rozpustná forma přispívá k inhibici apoptózy zpomalením cytochrom c uvolnění, a tedy proapoptotickou signalizaci. Alternativně může PARL inhibovat apoptózu koordinací s HAX1 k aktivaci proteázy HtrA2, čímž zabrání akumulaci proapoptózy Bax.^[6]

Klinický význam

Ukázalo se, že mutace proteinu podobného kosočtvercovému typu pS77N spojená s presenilinem není častou příčinou časného nástupu Parkinsonova choroba.^[8] Variace v proteinu spojeném s kosočtvercem spojeným s preseniliny (PSARL) sekvence a / nebo exprese mohou být důležitým novým rizikovým faktorem pro diabetes typu 2 a další složky metabolický syndrom.^[9] Mutace v PARL mohou být také zapojeny do Leber dědičná optická neuropatie narušením normální funkce systému mitochondrie, čímž propaguje gangliová buňka sítnice smrt a neurodegenerace.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že PARL interaguje s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033918 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C „Entrez Gene: PARL presenilin associated, rhomboid like“.
^ G. A. McQuibban, S. Saurya, M. Freeman, Nature 423, 537 (2003)
^ ^A ^b ^C ^d ^E Phasukkijwatana N, Kunhapan B, Stankovich J, Chuenkongkaew WL, Thomson R, Thornton T, Bahlo M, Mushiroda T, Nakamura Y, Mahasirimongkol S, Tun AW, Srisawat C, Limwongse C, Peerapittayamongkol C, Sura T, Suthammar (Červenec 2010). „Genome-wide linking scan and asociační studie PARL k expresi rodin LHON v Thajsku“. Genetika člověka. 128 (1): 39–49. doi:10.1007 / s00439-010-0821-8. PMID 20407791. S2CID 394164.
^ Pellegrini L, Scorrano L (červenec 2007). „Zkrat k smrti: Parl a Opa1 v regulaci mitochondriální morfologie a apoptózy“. Buněčná smrt a diferenciace. 14 (7): 1275–84. doi:10.1038 / sj.cdd.4402145. PMID 17464328.
^ Heinitz S, Klein C, Djarmati A (listopad 2011). „Mutace proteinu podobného kosočtvercovitého typu spojená s p.S77N s presenilinem není častou příčinou časného nástupu Parkinsonovy nemoci.“ Poruchy pohybu. 26 (13): 2441–2. doi:10,1002 / mds.23889. PMID 21953724.
^ Walder K, Kerr-Bayles L, Civitarese A, Jowett J, Curran J, Elliott K, Trevaskis J, Bishara N, Zimmet P, Mandarino L, Ravussin E, Blangero J, Kissebah A, Collier GR (březen 2005). „Mitochondriální rhomboidní proteáza PSARL je novým kandidátským genem pro diabetes 2. typu“. Diabetologie. 48 (3): 459–68. doi:10.1007 / s00125-005-1675-9. PMID 15729572.
^ Shi G, Lee JR, Grimes DA, Racacho L, Ye D, Yang H, Ross OA, Farrer M, McQuibban GA, Bulman DE (květen 2011). „Funkční alterace PARL přispívá k mitochondriální dysregulaci u Parkinsonovy nemoci“. Lidská molekulární genetika. 20 (10): 1966–74. doi:10,1093 / hmg / ddr077. PMID 21355049.

Další čtení

Jeyaraju DV, Xu L, Letellier MC, Bandaru S, Zunino R, Berg EA, McBride HM, Pellegrini L (prosinec 2006). „Fosforylace a štěpení presenilinu asociovaného rhomboidního proteinu (PARL) podporuje změny v mitochondriální morfologii“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (49): 18562–7. Bibcode:2006PNAS..10318562J. doi:10.1073 / pnas.0604983103. PMC 1693702. PMID 17116872.
Fawcett KA, Wareham NJ, Luan J, Syddall H, Cooper C, O'Rahilly S, Day IN, Sandhu MS, Barroso I (listopad 2006). „PARL Leu262Val není spojen s hladinami inzulínu nalačno v populacích Velké Británie“. Diabetologie. 49 (11): 2649–52. doi:10.1007 / s00125-006-0443-9. PMC 2672784. PMID 17019603.
Walder K, Kerr-Bayles L, Civitarese A, Jowett J, Curran J, Elliott K, Trevaskis J, Bishara N, Zimmet P, Mandarino L, Ravussin E, Blangero J, Kissebah A, Collier GR (březen 2005). „Mitochondriální rhomboidní proteáza PSARL je novým kandidátským genem pro diabetes 2. typu“. Diabetologie. 48 (3): 459–68. doi:10.1007 / s00125-005-1675-9. PMID 15729572.
Sík A, Passer BJ, Koonin EV, Pellegrini L (duben 2004). „Samoregulační štěpení mitochondriální intramembránově štěpící proteázy PARL poskytuje Pbeta, peptid zaměřený na jaderné látky“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (15): 15323–9. doi:10,1074 / jbc.M313756200. PMID 14732705.
McQuibban GA, Saurya S, Freeman M (květen 2003). „Remodelace mitochondriální membrány regulovaná konzervovanou kosodélníkovou proteázou“. Příroda. 423 (6939): 537–41. Bibcode:2003 Natur.423..537M. doi:10.1038 / nature01633. PMID 12774122. S2CID 4398146.
Pellegrini L, Passer BJ, Canelles M, Lefterov I, Ganjei JK, Fowlkes BJ, Koonin EV, D'Adamio L (duben 2001). „PAMP a PARL, dvě nové domnělé metaloproteázy interagující s COOH-koncem Presenilin-1 a -2“. Journal of Alzheimer's Disease. 3 (2): 181–190. doi:10.3233 / jad-2001-3203. PMID 12214059.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCm38Ensembl-1] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033918 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-4] A ^b ^C „Entrez Gene: PARL presenilin associated, rhomboid like“.

[5] G. A. McQuibban, S. Saurya, M. Freeman, Nature 423, 537 (2003)

[pmid20407791-6] A ^b ^C ^d ^E Phasukkijwatana N, Kunhapan B, Stankovich J, Chuenkongkaew WL, Thomson R, Thornton T, Bahlo M, Mushiroda T, Nakamura Y, Mahasirimongkol S, Tun AW, Srisawat C, Limwongse C, Peerapittayamongkol C, Sura T, Suthammar (Červenec 2010). „Genome-wide linking scan and asociační studie PARL k expresi rodin LHON v Thajsku“. Genetika člověka. 128 (1): 39–49. doi:10.1007 / s00439-010-0821-8. PMID 20407791. S2CID 394164.

[7] Pellegrini L, Scorrano L (červenec 2007). „Zkrat k smrti: Parl a Opa1 v regulaci mitochondriální morfologie a apoptózy“. Buněčná smrt a diferenciace. 14 (7): 1275–84. doi:10.1038 / sj.cdd.4402145. PMID 17464328.

[8] Heinitz S, Klein C, Djarmati A (listopad 2011). „Mutace proteinu podobného kosočtvercovitého typu spojená s p.S77N s presenilinem není častou příčinou časného nástupu Parkinsonovy nemoci.“ Poruchy pohybu. 26 (13): 2441–2. doi:10,1002 / mds.23889. PMID 21953724.

[9] Walder K, Kerr-Bayles L, Civitarese A, Jowett J, Curran J, Elliott K, Trevaskis J, Bishara N, Zimmet P, Mandarino L, Ravussin E, Blangero J, Kissebah A, Collier GR (březen 2005). „Mitochondriální rhomboidní proteáza PSARL je novým kandidátským genem pro diabetes 2. typu“. Diabetologie. 48 (3): 459–68. doi:10.1007 / s00125-005-1675-9. PMID 15729572.

[10] Shi G, Lee JR, Grimes DA, Racacho L, Ye D, Yang H, Ross OA, Farrer M, McQuibban GA, Bulman DE (květen 2011). „Funkční alterace PARL přispívá k mitochondriální dysregulaci u Parkinsonovy nemoci“. Lidská molekulární genetika. 20 (10): 1966–74. doi:10,1093 / hmg / ddr077. PMID 21355049.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]