New England Biolabs - New England Biolabs

New England Biolabs
Založený1974
ZakladatelDonald Comb
Hlavní sídlo240 County Road, Ipswich, Massachusetts 01938
Klíčoví lidé
  • James Ellard, generální ředitel
Počet zaměstnanců
350
webová stránkawww.neb.com

New England Biolabs (NEB) vyrábí a dodává rekombinantní a nativní enzymová činidla pro přírodní věda výzkum,[1] stejně jako poskytování řešení[módní slovo ] vedlejší editace genomu, syntetická biologie a sekvenování nové generace.[2] NEB také poskytuje bezplatný přístup k výzkumným nástrojům, jako jsou REBASE, InBASE a Polbase.

Společnost

Společnost byla založena v roce 1974 společností Donald Comb jako kooperativní laboratoř zkušených vědců a původně vyráběla restrikční enzymy v komerčním měřítku. Společnost poté začala vyrábět orientovaná na řešení[módní slovo ] produkty. V roce 2006 získala přibližně 1,7 milionu USD Inovační výzkum v oblasti malého podnikání (SBIR) na tento výzkum uděluje granty v letech 2009 až 2013.[1]

NEB produkuje 230 rekombinantní a 30 nativních restrikční enzymy pro genomický výzkumu, jakož i nicking enzymy a DNA methylázy. Provádí výzkum v oblastech souvisejících s proteomika, Sekvenování DNA, a objev drog. NEB vědci také provádějí základní výzkum v Molekulární biologie a Parazitologie.[1]

Společnost má dceřiné společnosti v Singapur, Kanada, Čína, Francie, Německo, Japonsko, Velká Británie a Austrálie,[1][3] a distributoři v Jižní Amerika, Austrálie a dalších zemích v Evropa a Asie.[4] Její sídlo je v Ipswichi, MA. Vývoj současného sídla byl zahájen v roce 2000 a byl dokončen v roce 2005.[5] Donald Comb působil jako předseda představenstva a generální ředitel společnosti od jejího založení v roce 1974 až do roku 2005. V roce 2005 byl ve funkci generálního ředitele nahrazen James Ellard, ačkoli Comb zůstal předsedou. NEB ve svém sídle zaměstnává více než 450 lidí.[6] V souladu s politikou společnosti musí všichni vědci a někteří vedoucí pracovníci pracovat alespoň jeden den v měsíci na telefonní lince zákaznické podpory a odpovídat na otázky technické podpory týkající se produktů společnosti.[1]

Vážený pane Richard John Roberts je vedoucím vědeckým pracovníkem společnosti.[1][7] Sdílel rok 1993 Nobelova cena za fyziologii nebo lék s Phillip Allen Sharp za objev introny v eukaryotické DNA a mechanismus sestřihu genů.

V roce 2015 se NEB zavázaly k vytvoření GMP výrobní závod poblíž jejího sídla v Ipswichi, Massachusetts,[8] a zařízení o rozloze 40 000 čtverečních stop bylo dokončeno v roce 2018.[9] Výrobní závod Rowley Cleanroom Manufacturing pro více produktů vyrábí výrobky třídy GMP a má mechanický mezipatro o rozloze 10 000 čtverečních stop.[10]

Aplikace a nástroje

Luna soupravy

V lednu 2017 NEB vydala univerzální kvantitativní polymerázovou řetězovou reakci v reálném čase Luna (qPCR ) a kvantitativní polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí (RT-qPCR ) soupravy.[11] Soupravy Luna se používají pro kvantifikaci DNA nebo RNA.[11]

NEBNext produkty

V prosinci 2017 společnost vydala NEBNext Ultra II FS DNA prep prep kit pro sekvenování nové generace (NGS).[12] V říjnu 2019 společnost NEB vydala nový produkt pro depleci RNA, NEBNext Globin & rRNA Depletion Kit (Human / Mouse / Rat) a NEBNext rRNA Depletion Kit (Bacteria).[13] Soupravy nabízejí specifické vyčerpání druhů RNA, které interferují s analýzou kódujících a nekódujících RNA.[13][14] Ve stejném měsíci společnost oznámila své NEBNext Direct Genotyping Solution.[15] Produkt poskytuje jednodenní automatizovaný pracovní postup genotypizace pro různé aplikace v systému Zemědělská biotechnologie.[15]

V lednu 2020 podepsala společnost NEB dohodu se společností ERS Genomics Limited, která společnosti NEB poskytla práva na prodej Nástroje CRISPR / Cas9 a činidla, používaná pro editaci genů.[16]

Klonování a syntetická biologie

Klonovací sada NEBuilder HiFi DNA Assembly Cloning Kit a Master Mix umožňují klonování v jednom kroku a vícenásobné sestavení fragmentů DNA. Patentovaná DNA polymeráza ve směsi enzymů HiFi NEBuilder dokáže sestavit fragmenty DNA v rozmezí od 100 bp do 19 kb. NEB rovněž nabízí Gibson Assembly Master Mix.[17]

Monarchové čištění nukleových kyselin

NEB poskytuje čisticí soupravy pro DNA i RNA. [18][19] V květnu 2019 společnost NEB vydala Monarch Genomic DNA Purification Kit, která je navržena tak, aby minimalizovala kontaminaci RNA a umožnila purifikaci velkých fragmentů DNA s vysokým výtěžkem. [18] Produkty pro čištění nukleových kyselin NEB byly použity v různých studiích, včetně:

  • Čištění genomové DNA používané k objevení přirozeně se vyskytujících modifikací DNA v bakteriofágy.[20]
  • Čištění RNA z biopsií rány ke studiu vztahu mezi genetikou, rozmanitostí mikrobiomu rány a hojením rány.[19]
  • Čištění genomové DNA z embryí chobotnice použitých v prvním genový knockout v hlavonožce.[21]
  • Čištění RNA z myších vzorků ve studii identifikující cestu, která selektivně reguluje rakovinné kmenové buňky, které mohou být zodpovědné za rezistenci na léčbu, metastázy nádoru a recidivu onemocnění.[22]
  • Čištění celkové RNA z Arabidopsis sazenice ve studii prokazující první známou reakci biologického receptoru na rádiová frekvence vystavení.[23]

Odpověď na COVID-19

New England Biolabs vyvinul kolorimetrický smyčkově zprostředkovaná izotermická amplifikace (LAMP) test pro výzkumné použití.[24][25] Tento test lze použít k testování přítomnosti viru detekcí nukleových kyselin, přičemž výsledky se vrátí za pouhých 30 minut.[24] V roce 2020 byla metoda LAMP jedním z několika molekulárních testů používaných k detekci RNA z SARS-CoV-2, kmen koronaviru, který způsobuje COVID-19.[26]

Soupravy pro izolaci RNA byly také použity k vývoji testů k detekci SARS-CoV-2. Sada Monarch Total RNA Miniprep od NEB nebyla navržena speciálně pro extrakci virové RNA, ale byla úspěšně použita různými společnostmi k extrakci virové RNA z biologických vzorků.[27] NEB také vydala doplňkový protokol pro zpracování slin, bukálních výtěrů a nasofaryngeálních vzorků.[27]

Databáze

Společnost provozuje bezplatné vědecké databáze. REBASE, databáze restrikčních enzymů, obsahuje podrobnosti o komerčních a výzkumných endonukleázách.[28] V roce 2011 společnost založila Polbase, online databázi, která poskytuje informace konkrétně o polymerázách.[29][30] Další bezplatnou databází NEB je InBase, inteinová databáze, která obsahuje registr Intein a informace o každém inteinu.[28]

Partnerství

V roce 2001 NEB spoluzaložila námořní DNA knihovnu Ocean Genome Legacy (OGL), která podle Boston Globe„Katalogizuje vzorky organismů z celého světa, které mají být zpřístupněny vědcům k výzkumu“. Ačkoli se OGLF původně nacházel v areálu NEB, přesídlil do kampusu Nahant v Severovýchodní univerzita v roce 2014.[29][30][31] Aby umožnil prodej svých činidel v místě použití, vytvořil NEB prostřednictvím partnerství se společnostmi Ionia Corp. a Salesforce.com digitální rozhraní pro mrazicí boxy s enzymovým pouzdrem pro použití v úložištích zákazníků. Data společnost používá jako prodejní logistiku i jako součást budoucího vývoje výzkumu enzymů.[32][33] Rovněž spolupracuje s Harvardská Univerzita o iniciativách recyklace a rekultivace, když její výrobky a obaly skončí na konci svého používání nebo životního cyklu.[34] Od roku 2015, NEB také měl distribuční dohoda s VWR.[2]

V červnu 2019 NEB, Waters a Genos oznámili, že budou spolupracovat na projektu The Human Glycome, globální iniciativě mapující strukturu a funkci člověka glykany.[35] NEB dodá verzi své technologie Rapid PNGase F, která pomůže při zvýšené přípravě vzorků a zlepšení propustnosti procesu.[35]

Téhož měsíce společnost NEB uzavřela partnerství se společností Bioz, Inc., společností zabývající se technologiemi umělé inteligence, s cílem poskytnout svým zákazníkům přístup k příkladům aplikací jejich produktů v reálném světě.[36]

Reference

Poznámky

  1. ^ A b C d E F Philippidis, Alex (15. března 2013). „New England Biolabs Looks Past Enzymes“. Novinky z genetického inženýrství a biotechnologie. 33 (6): 08–09. doi:10.1089 / gen.33.6.02. Citováno 8. června 2016.
  2. ^ A b Zaměstnanci (1. dubna 2015). „Novinky: Produkty a služby“. Novinky z genetického inženýrství a biotechnologie (Papír). 35 (7): 8. doi:10.1089 / gen.35.21.05.
  3. ^ „New England Biolabs, Inc. otevírá osmou dceřinou společnost v Austrálii“. Bioprostor. Citováno 20. února 2020.
  4. ^ „New England BioLabs Company Overview“. Pracovní týden. Citováno 7. května 2014.
  5. ^ Bill Archambeault (27. listopadu 2000). „Společnost plánuje projekt ve výši 70 mil. USD na Ipswichově velkém panství'". Boston Business Journal. Citováno 7. května 2014.
  6. ^ „Reforest the Tropics a New England Biolabs, Inc. uzavřely dohodu o výsadbě 100 hektarů lesa za účelem vyrovnání emisí uhlíku“. 15. srpna 2019.
  7. ^ Michael Hickens (24. dubna 2014). „Ranní stahování: Tech Giants Act to Stop 'Next Heartbleed'". Wall Street Journal.
  8. ^ Zaměstnanci (12. června 2015). „New England Biolabs ohlašuje plány na výrobu GMP“. Farmaceutické zpracování.
  9. ^ „Procesní chladicí systém šetří vodu i energii v New England BioLabs“. HPAC Engineering. 2. května 2018.
  10. ^ „New England Biolabs, Inc“. Columbia. Citováno 3. února 2020.
  11. ^ A b „Univerzální soupravy optimalizované pro kvantifikaci DNA a RNA“. Klinické laboratorní produkty. Citováno 2020-02-18.
  12. ^ „New England Biolabs Releases Next-Generation Sequencing Preparation Kit“. Klinické laboratorní produkty. Citováno 2020-02-25.
  13. ^ A b „Svět bio-IT“. www.bio-itworld.com. Citováno 2020-03-12.
  14. ^ „New England Biolabs pomáhá vědcům řešit transkriptomika v bakteriích a krvi“. Vědecký časopis. Citováno 2020-03-25.
  15. ^ A b „New England Biolabs uvádí NEBNext Direct Genotyping Solution“. Vědec. Citováno 2020-03-19.
  16. ^ „ERS Genomics a New England Biolabs podepisují dohodu o komercializaci nástrojů a reagencií CRISPR / Cas9“. News-Medical.net. 2020-01-09. Citováno 2020-02-06.
  17. ^ „New England Biolabs, Inc. zavádí nový způsob klonování a sestavení DNA: NEBuilder® HiFi“. Bioprostor. Citováno 2020-07-10.
  18. ^ A b "New England Biolabs Monarch Genomic DNA Purification Kit". GenomeWeb. Citováno 2020-09-16.
  19. ^ A b Tipton, Craig D .; Wolcott, Randall D .; Sanford, Nicholas E .; Miller, Clint; Pathak, Gita; Silzer, Talisa K .; Sun, Jie; Fleming, Derek; Rumbaugh, Kendra P .; Malý, Todd D .; Phillips, Nicole (2020-06-18). „Genetika pacientů souvisí s chronickým složením a hojením mikrobiomu rány“. PLOS patogeny. 16 (6): e1008511. doi:10.1371 / journal.ppat.1008511. ISSN  1553-7374. PMC  7302439. PMID  32555671.
  20. ^ „Identifikace a biosyntéza hypermodifikací thymidinu v genomové DNA rozšířených bakteriálních virů“. PNAS.
  21. ^ Crawford, Karen; Quiroz, Juan F. Diaz; Koenig, Kristen M .; Ahuja, Namrata; Albertin, Caroline B .; Rosenthal, Joshua J. C. (07.09.2020). „Vysoce účinný knockout genu pro pigmentaci chobotnice“. Aktuální biologie. 30 (17): 3484–3490.e4. doi:10.1016 / j.cub.2020.06.099. ISSN  0960-9822. PMID  32735817.
  22. ^ Wang, Guohao; Xu, Junji; Zhao, Jiangsha; Yin, Weiqin; Liu, Dayong; Chen, WanJun; Hou, Steven X. (2020-01-10). „Metabolismus lipidů zprostředkovaný Arf1 udržuje rakovinné buňky a jeho ablace indukuje u myší protinádorové imunitní odpovědi“. Příroda komunikace. 11 (1): 220. doi:10.1038 / s41467-019-14046-9. ISSN  2041-1723.
  23. ^ Albaqami, Maria; Hammad, Merfat; Pooam, Marootpong; Procopio, Maria; Sameti, Mahyar; Ritz, Thorsten; Ahmad, Margaret; Martino, Carlos F. (07.07.2020). „Kryptochrom Arabidopsis reaguje na radiofrekvenční (RF) elektromagnetická pole“. Vědecké zprávy. 10 (1): 11260. doi:10.1038 / s41598-020-67165-5. ISSN  2045-2322.
  24. ^ A b „Vědci z NYC stírají metrem při hledání SARS-CoV-2“. GEN. 2020-04-01. Citováno 2020-04-23.
  25. ^ Tanner, NA; Evans, TC (2014). "Smyčkově zprostředkovaná izotermická amplifikace pro detekci nukleových kyselin". Curr Protoc Mol Biol. 105: Jednotka 15.14. doi:10.1002 / 0471142727.mb1514s105. PMID  24510439.
  26. ^ Shen, Minzhe; Zhou, Ying; Ye, Jiawei; Abdullah Al-Maskri, Abdu Ahmed; Kang, Yu; Zeng, Su; Cai, Sheng (2020). „Nedávné pokroky a perspektivy detekce nukleových kyselin pro koronavirus“. Journal of Pharmaceutical Analysis. 10 (2): 97–101. doi:10.1016 / j.jpha.2020.02.010. PMID  32292623.
  27. ^ A b „Dostupnost souprav pro izolaci RNA není tak přímá, jak se uvádí“.
  28. ^ A b Terence A. Brown (1998). Molecular Biology Labfax, svazek 1. Elsevier. p. 41. ISBN  9780121360559. Citováno 7. května 2014.
  29. ^ A b „Produktové hodinky: Systém Thermo Fisher PikoReal; Polbase New England Biolabs“. Web genomu. 10. listopadu 2011.
  30. ^ A b Rodney H. Brown (10. listopadu 2011). „New England Biolabs zakládá polymerázovou databázi Polbase“. Boston Business Journal. Citováno 7. května 2014.
  31. ^ „Vědci shromažďující DNA z hlubin oceánu“. The Boston Globe. 2014-04-17.
  32. ^ Nigel Fenwick (7. dubna 2014). „CIO: Vyberte si svou digitální budoucnost“. Wall Street Journal. Citováno 7. května 2014.
  33. ^ Curt Woodward (6. května 2014). „LogMeIn získává Ionii za 12 milionů USD, čímž se zintenzivňuje zaměření„ internetu věcí “. Xconomy. Citováno 7. května 2014.
  34. ^ Michelle Taylor (8. dubna 2014). „Kolaborativní udržitelnost“. Laboratorní vybavení. Citováno 7. května 2014.
  35. ^ A b „Úvod do analýzy glykanů“. www.biocompare.com. Citováno 2020-02-11.
  36. ^ „Bioz uzavřel partnerství s NEB s cílem posílit výzkumné pracovníky v oblasti biologie“. Bioprostor. 13. června 2019. Citováno 2. března 2020.

externí odkazy