NUBP2 - NUBP2
ParA / MinD ATPase jako | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||
Symbol | ParA | ||||||||
Pfam | PF10609 | ||||||||
InterPro | IPR019591 | ||||||||
|
Protein vázající nukleotidy 2 (NBP 2) také známý jako cytosolický Fe-S klastrový montážní faktor NUBP2 je protein že u lidí je kódován NUBP2 gen.[5]
NUBP2 je členem podrodiny genů NUBP / MRP proteinů vázajících ATP.[6] Existují dva typy eukaryoty NUBP1 a NUBP2 a jeden nový lidský gen, který definuje proteiny vázající nukleotidy NBP (NUBP /MRP - protein spojený s rezistencí na více léků)[5] v savčích buňkách vyžaduje zrání cytosolický[7] železo-síra (Fe / S )[8] proteiny jako Nubp1 se podílí na tvorbě extramitochondriálních proteinů Fe / S[6] inhibitor buněčného dělení MinD je homologní[9] a zahrnují dvě proteinové složky (FeS) proteinového montážního aparátu velmi podobného cytosolu[6] rozpustný[8] P smyčka[9] NTPáza kde Nar1[10][11] je nutné pro montáž,[12] identifikovaný Cfd1p[13][14] v cytosolické a jaderné biogenezi Fe / S proteinů[8] v droždí.[15] Nubp proteiny NTPáza Nbp35p.[11][12] Mysl je homologní ke členům v Mysl E. coli, příbuzný rodiny ParA.[9][16][17]
Morfologie
Další informace: Morfologie (biologie)
NBP35 bakteriální plazmidy F (klasický sexuální faktor Escherichia coli)[9] nachází se ve všech jaderných genech ve vegetativních a gametických bičících jednobuněčných zelených řas C. reinhardtii a biogenezi jaderného proteinu Fe / S, která je nutná pro sestavení cytosolického proteinu železo-síra; MNP = podobné MRP; MRP (Multiple Resistance and pH adaptation) MRP / NBP35-like P-loop NTPase similar to; a funguje jako minD_arch; buněčné dělení ATPáza MinD, archaeal a homology NUBP1. Gen NBP35 je konzervován v archaei[18] Bakterie, metazoa, houby a další eukaryoty a se značnými odchylkami od kvasinek; Cfd1-Nbp35 Fe-S člověku. V komplexu lešení[19] protein za vzniku velkých molekulárních sestav, které uchovávají Fe (III) a 4Fe-4S považováno za sekundární k defektům deaktivovaným k dosažení svých funkcí jako fyziologicky relevantní forma (proteiny) Fe / S proteiny Regulační protein železa 1 (IRP 1) je regulováno prostřednictvím[14] zabraňuje nedostatkům a zvýšeným rychlostem mutací[17] který charakterizoval rostlinnou P smyčkovou NTPázu se sekvenční podobností s Nbp35 homology NUBP1.[20]
Interakce
Bylo prokázáno, že NUBP2 komunikovat s...
- ACO1 Protein vázající prvek reagující na železo 1 (IRE-BP 1) (regulační protein železa 1) (IRP1)[14][21]
- MAPK8IP3 C-jun-amino-terminální kináza interagující protein 3 (JNK interagující protein 3) (JIP-3)[22]
- IGFALS Inzulín podobný růstový faktor vázající proteinový komplex kyselý labilní prekurzor řetězce (ALS)[22][23]
- KIF11 Kinesin-like protein KIF11 (Kinesin-related motor protein Eg5)[24]
- Prekurzor seenoproteinu P SEPP1 (SeP)[17]
- CA1 karboanhydráza 1 (EC 4.2.1.1) (karboanhydráza I) (karbonát dehydratáza I) (CA-I)[16][17][20]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000095906 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039183 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b Nakashima H, Grahovac MJ, Mazzarella R a kol. (1999). „Dva nové myší geny - Nubp2 mapované na t-komplex na chromozomu 17 a Nubp1 mapované na chromozom 16 - vytvářejí novou rodinu genů proteinů vázajících nukleotidy v eukaryotech.“ Genomika. 60 (2): 152–60. doi:10.1006 / geno.1999.5898. PMID 10486206.
- ^ A b C Stehling O, Netz DJ, Niggemeyer B a kol. (2008). „Lidský Nbp35 je nezbytný jak pro sestavení cytosolického proteinu železo-síra, tak pro homeostázu železa“. Mol. Buňka. Biol. 28 (17): 5517–28. doi:10.1128 / MCB.00545-08. PMC 2519719. PMID 18573874.
- ^ Netz DJ, Pierik AJ, Stümpfig M, Mühlenhoff U, Lill R (2007). „Komplex Cfd1-Nbp35 působí jako lešení pro sestavení proteinu železo-síra v kvasinkovém cytosolu“. Nat Chem Biol. 3 (5): 278–86. doi:10.1038 / nchembio872. PMID 17401378.
- ^ A b C Hausmann A, Aguilar Netz DJ, Balk J, Pierik AJ, Mühlenhoff U, Lill R (2005). „Eukaryotická P-smyčka NTPáza Nbp35: základní součást cytosolického a jaderného mechanismu montáže proteinu železo-síra“. Proc Natl Acad Sci U S A. 102 (9): 3266–71. Bibcode:2005PNAS..102.3266H. doi:10.1073 / pnas.0406447102. PMC 552912. PMID 15728363.
- ^ A b C d Motallebi-Veshareh M, Rouch DA, Thomas CM (1990). "Rodina ATPáz zapojených do aktivního dělení různých bakteriálních plazmidů". Mol. Microbiol. 4 (9): 1455–63. doi:10.1111 / j.1365-2958.1990.tb02056.x. PMID 2149583. S2CID 40829252.
- ^ Balk J, Aguilar Netz DJ, Tepper K, Pierik AJ, Lill R (2005). „Esenciální protein WD40 Cia1 je zapojen do pozdního kroku cytosolického a jaderného sestavení proteinu železo-síra“. Mol Cell Biol. 25 (24): 10833–41. doi:10.1128 / MCB.25.24.10833-10841.2005. PMC 1316972. PMID 16314508.
- ^ A b Rutherford JC, Ojeda L, Balk J, Mühlenhoff U, Lill R, Winge DR (2005). „Aktivace regulonu železa kvasinkovými transkripčními faktory Aft1 / Aft2 závisí na mitochondriální, nikoli však biogenezi cytosolického proteinu železo-síra“. J Biol Chem. 280 (11): 10135–40. doi:10,1074 / jbc.M413731200. PMID 15649888.
- ^ A b Balk J, Pierik AJ, Aguilar Netz DJ, Mühlenhoff U, Lill R (2005). „Nar1p, konzervovaný eukaryotický protein s podobností s hydrogenázami obsahujícími pouze Fe, funguje v biogenezi cytosolického železa a síry“. Biochem Soc Trans. 33 (Pt.1): 86–9. doi:10.1042 / BST0330086. PMID 15667273.
- ^ Yarunin A, Panse VG, Petfalski E, Dez C, Tollervey D, Hurt EC (2005). „Funkční souvislost mezi tvorbou ribozomu a biogenezí proteinů železo-síra“. EMBO J.. 24 (3): 580–8. doi:10.1038 / sj.emboj.7600540. PMC 548649. PMID 15660135.
- ^ A b C Roy A, Solodovnikova N, Nicholson T a kol. (2003). „Nový eukaryotický faktor pro cytosolickou sestavu klastrů Fe-S“. EMBO J.. 22 (18): 4826–35. doi:10.1093 / emboj / cdg455. PMC 212722. PMID 12970194.
- ^ Okuno T, Yamabayashi H, Kogure K (2010). "Srovnání intracelulární lokalizace Nubp1 a Nubp2 pomocí GFP fúzních proteinů". Mol Biol Rep. 37 (3): 1165–8. doi:10.1007 / s11033-009-9477-7. PMID 19263241. S2CID 998955.
- ^ A b Bignell C, Thomas CM (2001). "Bakteriální dělící proteiny ParA-ParB". J. Biotechnol. 91 (2): 1–34. doi:10.1016 / S0168-1656 (01) 00293-0. ISSN 0168-1656. PMID 11522360.
- ^ A b C d Fukushima K, Ogawa H, Takahashi K, Naito H, Funayama Y, Kitayama T, Yonezawa H, Sasaki I (2003). „Nepatogenní bakterie modulují expresi genů tlustého epitelu u myší bez zárodků“. Scand J Gastroenterol. 38 (6): 626–34. doi:10.1080/00365510310000376. ISSN 0036-5521. PMID 12825871. S2CID 25927173.
- ^ Kohbushi H, Nakai Y, Kikuchi S, Yabe T, Hori H, Nakai M (2009). „Homodimer Arabidopsis cytosolický Nbp35 může sestavit jak [2Fe-2S], tak [4Fe-4S] klastry ve dvou odlišných doménách.“ Biochem Biophys Res Commun. 378 (4): 810–5. doi:10.1016 / j.bbrc.2008.11.138. PMID 19084504.
- ^ Bych K, Netz DJ, Vigani G, Bill E, Lill R, Pierik AJ, Balk J (2008). „Základní cytosolický protein železo-síra Nbp35 působí bez partnera Cfd1 v zelené linii“. J Biol Chem. 283 (51): 35797–804. doi:10,1074 / jbc.M807303200. PMID 18957412.
- ^ A b „Entrez Gene: UniGene Hs.256549 Nucleotide binding protein 2 (MinD homolog, E. coli) (NUBP2)“.
- ^ „Entrez Gene: NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN 2; NUBP2 CYTOSOLIC FE-S CLUSTER DEFICIENT 1, S. CEREVISIAE, HOMOLOG OF; CFD1 Gene map locus: 16p13.3“.
- ^ A b Kargul GJ, Nagaraja R, Shimada T, Grahovac MJ, Lim MK, Nakashima H, Waeltz P, Ma P, Chen E, Schlessinger D, Ko MS (2000). „Jedenáct hustě seskupených genů, z toho šest nových, v 176 kb myší t-komplexové DNA“. Genome Res. 10 (7): 916–23. doi:10,1101 / gr. 10.7.916. PMC 310918. PMID 10899141.
- ^ Sano Y, Shimada T, Nakashima H, Nicholson RH, Eliason JF, Kocarek TA, Ko MS (2001). "Náhodná monoallelická exprese tří genů seskupených do 60 kb myší t komplex genomové DNA". Genome Res. 11 (11): 1833–41. doi:10,1101 / gr. 194301. PMC 311134. PMID 11691847.
- ^ Christodoulou A, Lederer CW, Surrey T, Vernos I, Santama N (2006). „Motorový protein KIFC5A interaguje s Nubp1 a Nubp2 a podílí se na regulaci duplikace centrozomu“. J Cell Sci. 119 (Pt 10): 2035–47. doi:10.1242 / jcs.02922. PMID 16638812.
Další čtení
- Guey LT, GarcÃa-Closas M, Murta-Nascimento C a kol. (2010). „Genetická náchylnost k odlišným subfenotypům rakoviny močového měchýře“. Eur. Urol. 57 (2): 283–92. doi:10.1016 / j.eururo.2009.08.001. PMC 3220186. PMID 19692168.
- Roy A, Solodovnikova N, Nicholson T a kol. (2003). „Nový eukaryotický faktor pro cytosolickou sestavu klastrů Fe-S“. EMBO J.. 22 (18): 4826–35. doi:10.1093 / emboj / cdg455. PMC 212722. PMID 12970194.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Shen M, Vermeulen R, Rajaraman P a kol. (2009). „Polymorfismy v genech vrozené imunity a riziko rakoviny plic v Xuanwei v Číně“. Environ. Mol. Mutagen. 50 (4): 285–90. doi:10.1002 / em.20452. PMC 2666781. PMID 19170196.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Hosgood HD, Menashe I, He X a kol. (2009). „PTEN identifikován jako důležitý rizikový faktor chronické obstrukční plicní nemoci“. Respir Med. 103 (12): 1866–70. doi:10.1016 / j.rmed.2009.06.016. PMC 2783799. PMID 19625176.
- Hosgood HD, Menashe I, Shen M a kol. (2008). „Hodnocení 380 kandidátních genů a náchylnost k rakovině plic založené na dráze naznačuje důležitost dráhy buněčného cyklu“. Karcinogeneze. 29 (10): 1938–43. doi:10.1093 / carcin / bgn178. PMC 2722857. PMID 18676680.