NFKBIE - NFKBIE

NFKBIE
Identifikátory
Aliasy	NFKBIE, IKBE, inhibitor NFKB epsilon
Externí ID	OMIM: 604548 MGI: 1194908 HomoloGene: 36160 Genové karty: NFKBIE
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	44,265,788 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	45,563,169 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • perinukleární oblast cytoplazmy; • Golgiho aparát; • fibrilární centrum; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• cytoplazmatické sekvestrace transkripčního faktoru; • Transport D-serinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4794
	18037
	ENSG00000146232
	ENSMUSG00000023947
	O00221
	O54910
	NM_004556
	NM_008690; NM_001304956
	NP_004547
	NP_001291885; NP_032716
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Nukleární faktor zesilovače genu polypeptidu lehkého kappa v inhibitoru B-buněk, epsilon, také známý jako NFKBIE, je protein který je u lidí kódován NFKBIE gen.^[5]^[6]

Funkce

Exprese proteinu NFKBIE je dále regulována NF-kB aktivace a během myelopoéza. NFKBIE je schopen inhibovat NF-kB-řízený transaktivace prostřednictvím cytoplazmatické retence REL bílkoviny.^[6]

NFKB1 nebo NFKB2 je vázán REL, RELA nebo RELB za vzniku NF-κB transkripční faktor komplex. Komplex NF-kB je inhibován proteiny I-kappa-B (NFKBIA nebo NFKBIB ), které inaktivují NF-kappa-B jeho zachycením v cytoplazma. Fosforylace serinových zbytků na I-kappa-B proteinech kinázami (IKBKA nebo IKBKB ) označí je ke zničení prostřednictvím ubikvitinace dráha, což umožňuje aktivaci komplexu NF-kappa-B. Aktivovaný komplex NF-kB se translokuje do jádra a váže DNA na motivy vázající kappa-B, jako je 5-primární GGGRNNYYCC 3-primární nebo 5-primární HGGARNYYCC 3-primární (kde H je A, C nebo T; R je A nebo G purin a Y je C nebo T pyrimidin). U některých genů vyžaduje aktivace interakci NF-kB s jinými transkripčními faktory, jako je STAT (viz STAT6 ), AP-1 (ČERVEN ) a NFAT (viz NFATC1 ).^[5]

Interakce

NFKBIE bylo prokázáno komunikovat s NFKB2,^[7] RELA,^[7] NFKB1^[7] a REL.^[7]^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000146232 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023947 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: NFKBIE nukleární faktor zesilovače genů kappa lehkého polypeptidu v inhibitoru B-buněk, epsilon“.
^ ^A ^b Whiteside ST, Epinat JC, Rice NR, Israël A (březen 1997). „I kappa B epsilon, nový člen rodiny I kappa B, řídí aktivitu RelA a cRel NF-kappa B“. EMBO J.. 16 (6): 1413–26. doi:10.1093 / emboj / 16.6.1413. PMC 1169738. PMID 9135156.
^ ^A ^b ^C ^d Li, Z; Nabel G J (říjen 1997). „Nový člen rodiny proteinů I kappaB, I kappaB epsilon, inhibuje transkripci NF-kappaB zprostředkovanou RelA (p65)“. Mol. Buňka. Biol. Spojené státy. 17 (10): 6184–90. doi:10,1128 / mcb.17.10.6184. ISSN 0270-7306. PMC 232469. PMID 9315679.
^ Kumar, S; Gélinas C (říjen 1993). „I kappa B alfa zprostředkovaná inhibice vazby DNA v-Rel vyžaduje přímou interakci s motivem vazby DNA RXXRXRXXC Rel / kappa B“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA Spojené státy. 90 (19): 8962–6. Bibcode:1993PNAS ... 90,8962K. doi:10.1073 / pnas.90.19.8962. ISSN 0027-8424. PMC 47481. PMID 8415639.
^ Spiecker, M; Darius H; Liao J K (březen 2000). "Funkční role I kappa B-epsilonu v aktivaci endoteliálních buněk". J. Immunol. Spojené státy. 164 (6): 3316–22. doi:10,4049 / jimmunol.164.6.3316. ISSN 0022-1767. PMID 10706725.

Další čtení

Hansen SK, Baeuerle PA, Blasi F (1994). „Čištění, rekonstituce a I kappa B asociace komplexu c-Rel-p65 (RelA), silný aktivátor transkripce“. Mol. Buňka. Biol. 14 (4): 2593–603. doi:10,1128 / mcb.14.4.2593. PMC 358627. PMID 8139561.
Kumar S, Gélinas C (1993). „I kappa B alfa zprostředkovaná inhibice vazby v-Rel DNA vyžaduje přímou interakci s motivem vázání DNA RXXRXRXXC Rel / kappa B“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90 (19): 8962–6. Bibcode:1993PNAS ... 90,8962K. doi:10.1073 / pnas.90.19.8962. PMC 47481. PMID 8415639.
Whiteside ST, Epinat JC, Rice NR, Israël A (1997). „I kappa B epsilon, nový člen rodiny I kappa B, řídí aktivitu RelA a cRel NF-kappa B“. EMBO J.. 16 (6): 1413–26. doi:10.1093 / emboj / 16.6.1413. PMC 1169738. PMID 9135156.
Curristin SM, Bird KJ, Tubbs RJ, Ruddell A (1997). „VBP a RelA regulují transkripci zesílenou dlouhým terminálním opakováním viru ptačí leukózy v B buňkách“. J. Virol. 71 (8): 5972–81. doi:10.1128 / JVI.71.8.5972-5981.1997. PMC 191853. PMID 9223487.
Li Z, Nabel GJ (1997). „Nový člen rodiny proteinů I kappaB, I kappaB epsilon, inhibuje transkripci NF-kappaB zprostředkovanou RelA (p65)“. Mol. Buňka. Biol. 17 (10): 6184–90. doi:10,1128 / mcb.17.10.6184. PMC 232469. PMID 9315679.
Spiecker M, Darius H, Liao JK (2000). "Funkční role I kappa B-epsilonu v aktivaci endoteliálních buněk". J. Immunol. 164 (6): 3316–22. doi:10,4049 / jimmunol.164.6.3316. PMID 10706725.
Bourke E, Kennedy EJ, Moynagh PN (2001). „Ztráta Ikappa B-beta je spojena s prodlouženou aktivitou NF-kappa B v lidských gliových buňkách“ (PDF). J. Biol. Chem. 275 (51): 39996–40002. doi:10,1074 / jbc.M007693200. PMID 10998424. S2CID 56360025.
Lee SH, Hannink M (2002). "Charakterizace jaderných dovozních a vývozních funkcí Ikappy B (epsilon)". J. Biol. Chem. 277 (26): 23358–66. doi:10,1074 / jbc.M111559200. PMID 11970947.
Bruno ME, Borchers CH, Dial JM, et al. (2002). „Účinky TCDD na podjednotky IkappaB a IKK lokalizované v mikrosomech proteomikou“. Oblouk. Biochem. Biophys. 406 (2): 153–64. doi:10.1016 / S0003-9861 (02) 00452-6. PMID 12361703.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Emmerich F, Theurich S, Hummel M a kol. (2004). "Inaktivace I kappa B epsilon mutací v Hodgkinových / Reed-Sternbergových buňkách". J. Pathol. 201 (3): 413–20. doi:10,1002 / cesta. 1454. PMID 14595753. S2CID 33577004.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H a kol. (2004). "Fyzická a funkční mapa lidské signální transdukční dráhy TNF-alfa / NF-kappa B". Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038 / ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Nasu-Nishimura Y, Hayashi T, Ohishi T a kol. (2006). „Role proteinu RICS aktivujícího Rho GTPázu v růstu neuritů“. Geny buňky. 11 (6): 607–14. doi:10.1111 / j.1365-2443.2006.00966.x. PMID 16716191. S2CID 7935936.
Stefansson B, Brautigan DL (2006). „Podjednotka proteinové fosfatázy 6 se zachovanými cílovými cíli proteinové domény asociované se Sit4 IkappaBepsilon“. J. Biol. Chem. 281 (32): 22624–34. doi:10,1074 / jbc.M601772200. PMID 16769727.
Chapman SJ, Khor CC, Vannberg FO a kol. (2007). „Genetické polymorfismy IkappaB a invazivní pneumokokové onemocnění“. Dopoledne. J. Respir. Krit. Care Med. 176 (2): 181–7. doi:10,1164 / rccm. 200702-169OC. PMID 17463416.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000146232 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023947 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: NFKBIE nukleární faktor zesilovače genů kappa lehkého polypeptidu v inhibitoru B-buněk, epsilon“.

[pmid9135156-6] A ^b Whiteside ST, Epinat JC, Rice NR, Israël A (březen 1997). „I kappa B epsilon, nový člen rodiny I kappa B, řídí aktivitu RelA a cRel NF-kappa B“. EMBO J.. 16 (6): 1413–26. doi:10.1093 / emboj / 16.6.1413. PMC 1169738. PMID 9135156.

[pmid9315679-7] A ^b ^C ^d Li, Z; Nabel G J (říjen 1997). „Nový člen rodiny proteinů I kappaB, I kappaB epsilon, inhibuje transkripci NF-kappaB zprostředkovanou RelA (p65)“. Mol. Buňka. Biol. Spojené státy. 17 (10): 6184–90. doi:10,1128 / mcb.17.10.6184. ISSN 0270-7306. PMC 232469. PMID 9315679.

[pmid8415639-8] Kumar, S; Gélinas C (říjen 1993). „I kappa B alfa zprostředkovaná inhibice vazby DNA v-Rel vyžaduje přímou interakci s motivem vazby DNA RXXRXRXXC Rel / kappa B“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA Spojené státy. 90 (19): 8962–6. Bibcode:1993PNAS ... 90,8962K. doi:10.1073 / pnas.90.19.8962. ISSN 0027-8424. PMC 47481. PMID 8415639.

[pmid10706725-9] Spiecker, M; Darius H; Liao J K (březen 2000). "Funkční role I kappa B-epsilonu v aktivaci endoteliálních buněk". J. Immunol. Spojené státy. 164 (6): 3316–22. doi:10,4049 / jimmunol.164.6.3316. ISSN 0022-1767. PMID 10706725.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]