NFKBIB - NFKBIB

NFKBIB
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1K3Z, 1OY3
Identifikátory
Aliasy	NFKBIB, IKBB, TRIP9, NFKB inhibitor beta
Externí ID	OMIM: 604495 MGI: 104752 HomoloGene: 37631 Genové karty: NFKBIB
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	38,908,893 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	28,767,512 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita převodníku signálu; • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• transkripce, chráněná DNA; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • signální transdukce; • pozitivní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4793
	18036
	ENSG00000104825; ENSG00000282905
	ENSMUSG00000030595
	Q15653
	Q60778
	NM_001001716; NM_001243116; NM_002503; NM_001369699; NM_001369700
	NM_010908; NM_001306222
	NP_001230045; NP_002494; NP_001356628; NP_001356629
	NP_001293151; NP_035038
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

NF-kappa-B inhibitor beta je protein že u lidí je kódován NFKBIB gen.^[5]

Funkce

NFKB1 (MIM 164011) nebo NFKB2 (MIM 164012) je vázán na REL (MIM 164910), RELA (MIM 164014) nebo RELB (MIM 604758) za vzniku komplexu NFKB. Komplex NFKB je inhibován proteiny I-kappa-B (NFKBIA, MIM 164008 nebo NFKBIB), které inaktivují NF-kappa-B jeho zachycením v cytoplazmě. Fosforylace serinových zbytků na I-kappa-B proteinech kinázami (IKBKA, MIM 600664 nebo IKBKB, MIM 603258) je označuje pro destrukci ubikvitinační cestou, což umožňuje aktivaci komplexu NF-kappa-B. Aktivovaný komplex NFKB se translokuje do jádra a váže DNA na motivy vázající kappa-B, jako je 5-primární GGGRNNYYCC 3-primární nebo 5-primární HGGARNYYCC 3-primární (kde H je A, C nebo T; R je A nebo G purin a Y je C nebo T pyrimidin). [Dodáváno společností OMIM]^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že NFKBIB komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000282905 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104825, ENSG00000282905 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030595 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Okamoto T, Ono T, Hori M, Yang JP, Tetsuka T, Kawabe T, Sonta S (listopad 1998). "Přiřazení genu IkappaB-beta NFKBIB k pásu lidského chromozomu 19q13.1 hybridizací in situ". Cytogenet Cell Genet. 82 (1–2): 105–6. doi:10.1159/000015077. PMID 9763672. S2CID 85077804.
^ "Entrez Gene: NFKBIB nukleární faktor zesilovače genů kappa lehkého polypeptidu v inhibitoru B-buněk, beta".
^ Woronicz JD, Gao X, Cao Z, Rothe M, Goeddel DV (říjen 1997). „IkappaB kináza-beta: aktivace NF-kappaB a tvorba komplexu s IkappaB kinázou-alfa a NIK“. Věda. 278 (5339): 866–9. doi:10.1126 / science.278.5339.866. PMID 9346485.
^ Chen Y, Wu J, Ghosh G (červen 2003). „KappaB-Ras se váže na unikátní inzert v ankyrinové repetiční doméně IkappaBbeta a reguluje cytoplazmatickou retenci komplexů IkappaBbeta x NF-kappaB“. J. Biol. Chem. 278 (25): 23101–6. doi:10,1074 / jbc.M301021200. PMID 12672800.
^ Suyang H, Phillips R, Douglas I, Ghosh S (říjen 1996). „Role nefosforylované, nově syntetizované I kappa B beta při trvalé aktivaci NF-kappa B“. Mol. Buňka. Biol. 16 (10): 5444–9. doi:10,1128 / mcb.16.10.5444. PMC 231544. PMID 8816457.
^ Na SY, Kim HJ, Lee SK, Choi HS, Na DS, Lee MO, Chung M, Moore DD, Lee JW (únor 1998). „IkappaBbeta interaguje s receptorem retinoidu X a inhibuje retinoid-dependentní transaktivaci v buňkách ošetřených lipopolysacharidy“. J. Biol. Chem. 273 (6): 3212–5. doi:10.1074 / jbc.273.6.3212. PMID 9452433.

Další čtení

Lee JW, Choi HS, Gyuris J, Brent R, Moore DD (1995). "Dvě třídy proteinů závislé buď na přítomnosti nebo nepřítomnosti hormonu štítné žlázy pro interakci s receptorem hormonu štítné žlázy". Mol. Endokrinol. 9 (2): 243–54. doi:10.1210 / me.9.2.243. PMID 7776974.
Harhaj E, Blaney J, Millhouse S, Sun SC (1996). "Diferenciální účinky molekul I kappa B na Tat zprostředkovanou transaktivaci HIV-1 LTR". Virologie. 216 (1): 284–7. doi:10.1006 / viro.1996.0062. PMID 8615004.
DiDonato J, Mercurio F, Rosette C, Wu-Li J, Suyang H, Ghosh S, Karin M (1996). „Mapování indukovatelných míst fosforylace IkappaB, která signalizují její ubikvitinaci a degradaci“. Mol. Buňka. Biol. 16 (4): 1295–304. doi:10,1128 / mcb.16.4.1295. PMC 231113. PMID 8657102.
Beauparlant P, Kwon H, Clarke M, Lin R, Sonenberg N, Wainberg M, Hiscott J (1996). "Transdominantní mutanti I kappa B alfa blokují Tat-tumorový nekrotický faktor synergickou aktivaci genové exprese viru lidské imunodeficience typu 1 a množení virů". J. Virol. 70 (9): 5777–85. doi:10.1128 / JVI.70.9.5777-5785.1996. PMC 190591. PMID 8709193.
Suyang H, Phillips R, Douglas I, Ghosh S (1996). „Role nefosforylované, nově syntetizované I kappa B beta při trvalé aktivaci NF-kappa B“. Mol. Buňka. Biol. 16 (10): 5444–9. doi:10,1128 / mcb.16.10.5444. PMC 231544. PMID 8816457.
Whiteside ST, Epinat JC, Rice NR, Israël A (1997). „I kappa B epsilon, nový člen rodiny I kappa B, řídí aktivitu RelA a cRel NF-kappa B“. EMBO J.. 16 (6): 1413–26. doi:10.1093 / emboj / 16.6.1413. PMC 1169738. PMID 9135156.
DiDonato JA, Hayakawa M, Rothwarf DM, Zandi E, Karin M (1997). „IkappaB kináza reagující na cytokiny, která aktivuje transkripční faktor NF-kappaB“. Příroda. 388 (6642): 548–54. doi:10.1038/41493. PMID 9252186. S2CID 4354442.
McKinsey TA, Chu ZL, Ballard DW (1997). „Fosforylace PEST domény IkappaBbeta reguluje funkci komplexů NF-kappaB / IkappaBbeta“. J. Biol. Chem. 272 (36): 22377–80. doi:10.1074 / jbc.272.36.22377. PMID 9278383.
Woronicz JD, Gao X, Cao Z, Rothe M, Goeddel DV (1997). „IkappaB kináza-beta: aktivace NF-kappaB a tvorba komplexu s IkappaB kinázou-alfa a NIK“. Věda. 278 (5339): 866–9. doi:10.1126 / science.278.5339.866. PMID 9346485.
Na SY, Kim HJ, Lee SK, Choi HS, Na DS, Lee MO, Chung M, Moore DD, Lee JW (1998). „IkappaBbeta interaguje s receptorem retinoidu X a inhibuje retinoid-dependentní transaktivaci v buňkách ošetřených lipopolysacharidy“. J. Biol. Chem. 273 (6): 3212–5. doi:10.1074 / jbc.273.6.3212. PMID 9452433.
Lee FS, Peters RT, Dang LC, Maniatis T (1998). „MEKK1 aktivuje jak IκB kinázu α, tak IκB kinázu β“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (16): 9319–24. doi:10.1073 / pnas.95.16.9319. PMC 21336. PMID 9689078.
Zandi E, Chen Y, Karin M (1998). "Přímá fosforylace IkappaB pomocí IKKalpha a IKKbeta: diskriminace mezi volným substrátem a substrátem vázaným na NF-kappaB". Věda. 281 (5381): 1360–3. doi:10.1126 / science.281.5381.1360. PMID 9721103.
Blázquez MV, Macho A, Ortiz C, Lucena C, López-Cabrera M, Sánchez-Madrid F, Muñoz E (1999). „Extracelulární HIV protein typu 1 Tat indukuje expresi CD69 aktivací NF-kappaB: možná korelace s proteiny vázajícími Tat na povrch buňky“. AIDS Res. Hučení. Retroviry. 15 (13): 1209–18. doi:10.1089/088922299310304. PMID 10480634.
Wu C, Ghosh S (1999). „beta-TrCP zprostředkovává signálem indukovanou ubikvitinaci IkappaBbeta“. J. Biol. Chem. 274 (42): 29591–4. doi:10.1074 / jbc.274.42.29591. PMID 10514424.
Kumar A, Dhawan S, Mukhopadhyay A, Aggarwal BB (2000). „Virus 1 lidské imunodeficience indukuje matrixovou metaloproteinázu-9 v monocytech aktivací nukleového transkripčního faktoru NF-kappaB zprostředkovanou proteinovou tyrosin fosfatázou.“ FEBS Lett. 462 (1–2): 140–4. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01487-8. PMID 10580107. S2CID 86721940.
Fenwick C, Na SY, Voll RE, Zhong H, Im SY, Lee JW, Ghosh S (2000). "Podtřída Ras proteinů, které regulují degradaci IkappaB". Věda. 287 (5454): 869–73. doi:10.1126 / science.287.5454.869. PMID 10657303.
Manna SK, Aggarwal BB (2000). „Diferenciální požadavek na p56lck u HIV-tat versus TNF-indukovaných buněčných odpovědí: účinky na NF-kappa B, aktivátorový protein-1, c-Jun N-koncová kináza a apoptóza“. J. Immunol. 164 (10): 5156–66. doi:10,4049 / jimmunol.164.10.5156. PMID 10799874.
Li X, Josef J, Marasco WA (2001). „Hiv-1 Tat může podstatně zvýšit schopnost NIK indukovat degradaci IkappaB“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 286 (3): 587–94. doi:10.1006 / bbrc.2001.5442. PMID 11511100.
Strana M, Tuckerman EM, Li TC, Laird SM (2002). "Exprese složek nukleárního faktoru kappa B v lidském endometriu". J. Reprod. Immunol. 54 (1–2): 1–13. doi:10.1016 / S0165-0378 (01) 00122-X. PMID 11839392.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000282905 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104825, ENSG00000282905 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030595 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9763672-5] Okamoto T, Ono T, Hori M, Yang JP, Tetsuka T, Kawabe T, Sonta S (listopad 1998). "Přiřazení genu IkappaB-beta NFKBIB k pásu lidského chromozomu 19q13.1 hybridizací in situ". Cytogenet Cell Genet. 82 (1–2): 105–6. doi:10.1159/000015077. PMID 9763672. S2CID 85077804.

[entrez-6] "Entrez Gene: NFKBIB nukleární faktor zesilovače genů kappa lehkého polypeptidu v inhibitoru B-buněk, beta".

[pmid9346485-7] Woronicz JD, Gao X, Cao Z, Rothe M, Goeddel DV (říjen 1997). „IkappaB kináza-beta: aktivace NF-kappaB a tvorba komplexu s IkappaB kinázou-alfa a NIK“. Věda. 278 (5339): 866–9. doi:10.1126 / science.278.5339.866. PMID 9346485.

[pmid12672800-8] Chen Y, Wu J, Ghosh G (červen 2003). „KappaB-Ras se váže na unikátní inzert v ankyrinové repetiční doméně IkappaBbeta a reguluje cytoplazmatickou retenci komplexů IkappaBbeta x NF-kappaB“. J. Biol. Chem. 278 (25): 23101–6. doi:10,1074 / jbc.M301021200. PMID 12672800.

[pmid8816457-9] Suyang H, Phillips R, Douglas I, Ghosh S (říjen 1996). „Role nefosforylované, nově syntetizované I kappa B beta při trvalé aktivaci NF-kappa B“. Mol. Buňka. Biol. 16 (10): 5444–9. doi:10,1128 / mcb.16.10.5444. PMC 231544. PMID 8816457.

[pmid9452433-10] Na SY, Kim HJ, Lee SK, Choi HS, Na DS, Lee MO, Chung M, Moore DD, Lee JW (únor 1998). „IkappaBbeta interaguje s receptorem retinoidu X a inhibuje retinoid-dependentní transaktivaci v buňkách ošetřených lipopolysacharidy“. J. Biol. Chem. 273 (6): 3212–5. doi:10.1074 / jbc.273.6.3212. PMID 9452433.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]