NDUFAB1 - NDUFAB1 - Wikipedia

NDUFAB1
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2DNW
Identifikátory
Aliasy	NDUFAB1, ACP, FASN2A, SDAP, NADH: podjednotka ubichinon oxidoreduktázy AB1, ACP1
Externí ID	OMIM: 603836 MGI: 4936891 HomoloGene: 80336 Genové karty: NDUFAB1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	23,596,316 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • Aktivita NADH dehydrogenázy (ubichinon); • vazba mastných kyselin; • acylová vazba; • aktivita acylového nosiče; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba fosfopantetheinu;
Buněčná složka	• mitochondriální membrány; • komplex mitochondriálních dýchacích řetězců I.; • mitochondriální matice; • mitochondriální vnitřní membrána; • transport elektronů; • nukleoplazma; • mitochondrie; • cytosol; • mitochondriální velká ribozomální podjednotka;
Biologický proces	• metabolismus lipidů; • metabolický proces mastných kyselin; • proces biosyntézy mastných kyselin; • lipoylace proteinů; • oxidačně-redukční proces; • lipid Proces biosyntézy; • sestava komplexu mitochondriálních dýchacích řetězců I.; • transport mitochondriálních elektronů, NADH na ubichinon;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4706
	102634451
	ENSG00000004779
	ENSMUSG00000091989
	O14561
	n / a
	NM_005003
	n / a
	NP_004994
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1 beta subkomplex, 5, 16 kDa je protein že u lidí je kódován NDUFAB1 gen.^[4] Protein NDUFAB1 je podjednotkou NADH dehydrogenáza (ubichinon), který se nachází v mitochondriální vnitřní membrána a je největším z pěti komplexů elektronový transportní řetězec.^[5]

Struktura

Gen NDUFAB1 je lokalizován na p rameni chromozom 16 na pozici 12,2 a zabírá 15 327 párů bází.^[4] Gen NDUFAB1 produkuje protein 17,4 kDa složený ze 156 aminokyseliny.^[6]^[7] NDUFAB1 je podjednotka enzymu NADH dehydrogenáza (ubichinon), největší z dýchacích komplexů. Konstrukce je ve tvaru L s dlouhou, hydrofobní transmembránový doména a hydrofilní doména pro periferní rameno, která zahrnuje všechna známá redoxní centra a vazebné místo NADH.^[5] NDUFAB1 je jednou z přibližně 31 hydrofobních podjednotek, které tvoří transmembránovou oblast komplexu I. Bylo poznamenáno, že N-terminál hydrofobní doména má potenciál být složena do alfa šroubovice přes vnitřní mitochondriální membrána s C-terminál hydrofilní doména interagující s globulárními podjednotkami komplexu I. Vysoce konzervovaný dvoudoménová struktura naznačuje, že tato vlastnost je zásadní pro funkci proteinu a že hydrofobní doména působí jako kotva pro NADH dehydrogenáza (ubichinon) komplex na vnitřní mitochondriální membráně.^[4]

Funkce

Lidský gen NDUFAB1 kóduje podjednotku Komplex I. z dýchací řetězec, který přenáší elektrony z NADH na ubichinon.^[4] NDUFAB1 je však doplňkovou podjednotkou komplexu, o které se předpokládá, že se nepodílí na katalýze.^[8] Zpočátku, NADH váže se na komplex I a přenáší dva elektrony na isoalloxazinový kruh z flavin mononukleotid (FMN) protetické rameno k vytvoření FMNH₂. Elektrony jsou přenášeny řadou klastry železo-síra (Fe-S) v protetickém rameni a nakonec na koenzym Q10 (CoQ), který je redukován na ubichinol (CoQH₂). Tok elektronů mění redoxní stav proteinu, což vede ke konformační změně a strK. posun ionizovatelného postranního řetězce, který pumpuje čtyři vodíkové ionty z mitochondriální matrice.^[5]

Klinický význam

V genomová asociační studie (GWAS) metaanalýza prováděné mezi evropskými a afroamerickými populacemi, NDUFAB1 gen a dva další geny (MFAP3L a PALB2 ) byly identifikovány jako genetická místa významně spojená s úzkostné poruchy (REKLAMY). Protože komorbidita AD vychází z jejich sdíleného genetického základu, těchto kandidátů genetické loci se mohou stát terapeutickými cíli pro léčbu AD.^[9] Navíc studie k identifikaci lék s malou molekulou cíle pro Fallotova tetralogie (TOF), a kongenitální malformace srdce, našel NDUFAB1 gen je hlavním genem náboje odlišně exprimovaných genů v TOF.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000004779 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C ^d „Entrez Gene: NDUFAB1 NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1, alfa / beta subkomplex, 1, 8 kDa“.
^ ^A ^b ^C Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). „Kapitola 18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.
^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
^ „NDUFAB1 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 podkomplex alfa / beta podjednotka 1“. Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).
^ „NDUFAB1 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 podkomplex alfa / beta podjednotka 1“. UniProt: centrum pro informace o proteinech. Konsorcium UniProt. Citováno 24. března 2015.
^ Otowa T, Maher BS, Aggen SH, McClay JL, van den Oord EJ, Hettema JM (12. 11. 2014). „Celogenomové a genové asociační studie úzkostných poruch v evropských a afroamerických vzorcích“. PLOS ONE. 9 (11): e112559. Bibcode:2014PLoSO ... 9k2559O. doi:10.1371 / journal.pone.0112559. PMC 4229211. PMID 25390645.
^ Gu Q, Chen XT, Xiao YB, Chen L, Wang XF, Fang J, Chen BC, Hao J (červen 2014). "Identifikace různě exprimovaných genů a léků s malou molekulou pro Tetralogy of Fallot bioinformatickou strategií". Pediatrická kardiologie. 35 (5): 863–9. doi:10.1007 / s00246-014-0868-8. PMID 24463614. S2CID 24162298.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000004779 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-4] A ^b ^C ^d „Entrez Gene: NDUFAB1 NADH dehydrogenáza (ubichinon) 1, alfa / beta subkomplex, 1, 8 kDa“.

[Biochem-5] A ^b ^C Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). „Kapitola 18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.

[COPaKB-6] Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.

[url_COPaKB-7] „NDUFAB1 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 podkomplex alfa / beta podjednotka 1“. Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB).

[uniprot-8] „NDUFAB1 - NADH dehydrogenáza [ubichinon] 1 podkomplex alfa / beta podjednotka 1“. UniProt: centrum pro informace o proteinech. Konsorcium UniProt. Citováno 24. března 2015.

[a25390645-9] Otowa T, Maher BS, Aggen SH, McClay JL, van den Oord EJ, Hettema JM (12. 11. 2014). „Celogenomové a genové asociační studie úzkostných poruch v evropských a afroamerických vzorcích“. PLOS ONE. 9 (11): e112559. Bibcode:2014PLoSO ... 9k2559O. doi:10.1371 / journal.pone.0112559. PMC 4229211. PMID 25390645.

[a24463614-10] Gu Q, Chen XT, Xiao YB, Chen L, Wang XF, Fang J, Chen BC, Hao J (červen 2014). "Identifikace různě exprimovaných genů a léků s malou molekulou pro Tetralogy of Fallot bioinformatickou strategií". Pediatrická kardiologie. 35 (5): 863–9. doi:10.1007 / s00246-014-0868-8. PMID 24463614. S2CID 24162298.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]