Mycobacterium africanum - Mycobacterium africanum

Mycobacterium africanum
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Aktinobakterie
Objednat:
Actinomycetales
Podřád:
Corynebacterineae
Rodina:
Mycobacteriaceae
Rod:
Mycobacterium
Druh:
M. africanum
Binomické jméno
Mycobacterium africanum
Castets et al. 1969,[1] ATCC 25420

Mycobacterium africanum je druh Mycobacterium který se nejčastěji vyskytuje v západoafrických zemích, kde se odhaduje, že způsobuje až 40% plicní tuberkulózy.[2] Příznaky infekce se podobají příznakům M. tuberculosis.

Je členem Komplex Mycobacterium tuberculosis.[3]

Taxonomie

Existuje sedm hlavních linií v Komplex Mycobacterium tuberculosis (MTBC), u linií 5 a 6 klasifikovaných jako Mycobacterium africanum. MTBC linie 5 je M. africanum typ 1, západoafrický 1 (MAF1) a je klasifikován na základě charakteristické delece regionu diferenciace (RD) 711. MAF1 se běžně vyskytuje v Guinejském zálivu. MTBC linie 6 je také známá jako M. africanum typ 1, západoafrický 2 (MAF2) a je klasifikován na základě vypuštění RD702. MAF2 převládá v západní Africe. M. africanum typ 2, východoafrický, byl dříve rozpoznán jako kmen Mycobacterium africanum; nedávno byl překlasifikován na Mycobacterium tuberculosis genotyp „Uganda“ ve vedlejší linii linie MTBC 4.[4]

Dějiny

M. africanum byl poprvé popsán jako poddruh v MTBC s fenotypovými vlastnostmi mezi nimi M. tuberculosis a M. bovis, založený na biochemickém testování Castets v roce 1968. Časná genetická analýza ukázala, že se liší od M. tuberculosis kvůli genomové deleci RD9 a odlišné GyrB nukleotidovou sekvenci a odlišnou od M. bovis v důsledku intaktních RD12 a RD4.[5]

Mikrobiologie

M. africanum se pěstuje v médiu obsahujícím pyruvát za podmínek s nízkým obsahem kyslíku a vytváří charakteristické „dysgonické“ kolonie. Na rozdíl od M. tuberculosis, M. africanum vykazuje katalázovou aktivitu, je dusičnanově negativní a je citlivý na hydrazid thiopen-2-karboxylové kyseliny (TCH) a pyrazinamid (PZA). M. africanum také roste pomaleji než M. tuberculosis, obvykle trvá 10 týdnů, než se vytvoří kolonie, místo 3 až 4 M. tuberculosis.[6]

Epidemiologie

M. africanum se nejčastěji vyskytuje v západoafrických zemích.[7] Jde o infekci pouze u lidí a šíří se vzdušnou cestou od jedinců s otevřenými případy onemocnění.

Není zcela pochopeno, proč distribuce M. africanum je omezena na západní Afriku, v jiných regionech se vyskytují pouze sporadické případy.[8] Fylogenetické důkazy to ukazují M. africanum v rané fázi odbočil z moderních linií Mtb v Americe, Evropě a Asii. Některé výzkumy to naznačují M. africanum je přizpůsoben západoafrickým populacím. M. africanum mohou být překonány jinými liniemi Mtb v jiných regionech; genetické studie však nezjistily žádný rozdíl v počtu genů virulence nebo genetické rozmanitosti mezi nimi M. tuberculosis a M. africanum. Nebyl identifikován žádný rezervoár zvířat Mycobacterium africanum navzdory tomu, že byla nalezena různá divoká zvířata.[9]

Má podobný stupeň infekčnosti jako běžný M. tuberculosis organismu, ale je méně pravděpodobné, že u imunokompetentního jedince progreduje do klinického onemocnění.[10] Nicméně, M. africanum u HIV pozitivního pacienta je pravděpodobnější postup od infekce k onemocnění. V zemích, kde M. africanum je endemický, představuje důležitý oportunní infekce pozdějších stadiích onemocnění HIV.[11]

Patogeneze

Není zcela pochopeno, jak genetické rozdíly mezi M. africanum a M. tuberculosis vést k nižší patogenitě prvního. Je však známo, že oblast rozdílu 9 (RD9) chybí M. africanum ale přítomný v M. tuberculosis.[12]

M. africanum má také významné rozdíly v lipidovém katabolismu a metabolismu. Navíc jsou narušeny cesty virulence, jako je regulon dosR / Rv0081 nebo regulace ESAT-6 M. africanum.[13]

Léčba

Kvůli podobným příznakům a různým podmínkám růstu mezi Mycobacterium tuberculosis a africanum, kultivační metody jsou nespolehlivé pro diagnostiku. Genotypizace založená na molekulární biologii zlepšila identifikaci. Zejména „spoligotypizace“ nebo „typ spacerového oligonukleotidu“ je metoda založená na rychlé polymerázové řetězové reakci pro genotypizaci kmenů v MTBC. Nedávno byly vyvinuty rychlé testy laterálního toku založené na antigenu mpt64 nalezeném u všech členů MTBC.[14]

M. africanum má nižší míru progrese z latence do aktivního onemocnění než M. tuberculosis. M. africanum tuberkulóza je léčena stejným režimem jako tuberkulóza způsobená M. tuberculosis. Celková míra vyléčení je podobná, ale jako více M. africanum pacienti pravděpodobně budou HIV pozitivní, mohou mít vyšší úmrtnost na jiné nemoci spojené s HIV.[15]

Typ kmene

ATCC 25420 = CIP 105147

Reference

  1. ^ Castets, M .; Rist, N .; Boisvert, H. (1969). „La variété africaine du bacille tuberculeux humain“. Médecine d'Afrique Noire. 16: 321–2.
  2. ^ de Jong, B .; Antonio, M .; Gagneux, S. (28. září 2010). „Mycobacterium africanum - přehled důležité příčiny lidské tuberkulózy v západní Africe“. PLOS opomíjené tropické nemoci. 4 (9): e744. doi:10.1371 / journal.pntd.0000744. PMC  2946903. PMID  20927191.
  3. ^ Vasconcellos SE, Huard RC, Niemann S a kol. (2010). "Výrazné genotypové profily dvou hlavních subtypů Mycobacterium africanum". BMC Infect. Dis. 10: 80. doi:10.1186/1471-2334-10-80. PMC  2859774. PMID  20350321.
  4. ^ de Jong, B .; Antonio, M .; Gagneux, S. (28. září 2010). „Mycobacterium africanum - přehled důležité příčiny lidské tuberkulózy v západní Africe“. PLOS opomíjené tropické nemoci. 4 (9): e744. doi:10.1371 / journal.pntd.0000744. PMC  2946903. PMID  20927191.
  5. ^ Yeboah-Manu, Dorothy; de Jong, Bouke C .; Gehre, Florian (2017). "Biologie a epidemiologie Mycobacterium africanum". V Sebastien Gagneux (ed.). Variace kmene v komplexu Mycobacterium tuberculosis: jeho role v biologii, epidemiologii a kontrole. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 1019. Cham: Springer International Publishing. 117–133. doi:10.1007/978-3-319-64371-7_6. ISBN  978-3-319-64371-7. PMID  29116632.
  6. ^ Yeboah-Manu, Dorothy; de Jong, Bouke C .; Gehre, Florian (2017). "Biologie a epidemiologie Mycobacterium africanum". V Sebastien Gagneux (ed.). Variace kmene v komplexu Mycobacterium tuberculosis: jeho role v biologii, epidemiologii a kontrole. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 1019. Cham: Springer International Publishing. 117–133. doi:10.1007/978-3-319-64371-7_6. ISBN  978-3-319-64371-7. PMID  29116632.
  7. ^ de Jong, B .; Antonio, M .; Gagneux, S. (28. září 2010). „Mycobacterium africanum - přehled důležité příčiny lidské tuberkulózy v západní Africe“. PLOS opomíjené tropické nemoci. 4 (9): e744. doi:10.1371 / journal.pntd.0000744. PMC  2946903. PMID  20927191.
  8. ^ de Jong, B .; Antonio, M .; Gagneux, S. (28. září 2010). „Mycobacterium africanum - přehled důležité příčiny lidské tuberkulózy v západní Africe“. PLOS opomíjené tropické nemoci. 4 (9): e744. doi:10.1371 / journal.pntd.0000744. PMC  2946903. PMID  20927191.
  9. ^ Yeboah-Manu, Dorothy; de Jong, Bouke C .; Gehre, Florian (2017). "Biologie a epidemiologie Mycobacterium africanum". V Sebastien Gagneux (ed.). Varianta kmene v komplexu Mycobacterium tuberculosis: jeho role v biologii, epidemiologii a kontrole. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 1019. Cham: Springer International Publishing. 117–133. doi:10.1007/978-3-319-64371-7_6. ISBN  978-3-319-64371-7. PMID  29116632.
  10. ^ de Jong, B .; Hill, P .; Aiken, A .; Awine, T .; Martin, A .; Adetifa, I .; Jackson-Sillah, D .; Fox, A .; DeRiemer, K .; Gagneux, S .; Borgdorff, M .; McAdam, K .; Corrah, T .; Malý, P .; Adegbola, R. (2008). „Postup k aktivní tuberkulóze, ale ne přenos, liší se podle linie Mycobacterium tuberculosis v Gambii“. The Journal of Infectious Diseases. 198 (7): 1037–1043. doi:10.1086/591504. PMC  2597014. PMID  18702608.
  11. ^ de Jong, B .; Hill, P .; Brookes, R .; Otu, J .; Peterson, K .; Malý, P .; Adegbola, R. (14. října 2005). „Mycobacterium africanum: nový oportunní patogen při infekci HIV?“. AIDS. 19 (15): 1714–1715. doi:10.1097 / 01.aids.0000185991,54595,41. PMID  16184053.
  12. ^ Brosch R, Gordon SV, Marmiesse M a kol. (Březen 2002). "Nový evoluční scénář pro Mycobacterium tuberculosis komplex". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (6): 3684–9. Bibcode:2002PNAS ... 99,3684B. doi:10.1073 / pnas.052548299. PMC  122584. PMID  11891304.
  13. ^ Yeboah-Manu, Dorothy; de Jong, Bouke C .; Gehre, Florian (2017). "Biologie a epidemiologie Mycobacterium africanum". V Sebastien Gagneux (ed.). Varianta kmene v komplexu Mycobacterium tuberculosis: jeho role v biologii, epidemiologii a kontrole. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 1019. Cham: Springer International Publishing. 117–133. doi:10.1007/978-3-319-64371-7_6. ISBN  978-3-319-64371-7. PMID  29116632.
  14. ^ Yeboah-Manu, Dorothy; de Jong, Bouke C .; Gehre, Florian (2017). "Biologie a epidemiologie Mycobacterium africanum". V Sebastien Gagneux (ed.). Varianta kmene v komplexu Mycobacterium tuberculosis: jeho role v biologii, epidemiologii a kontrole. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 1019. Cham: Springer International Publishing. 117–133. doi:10.1007/978-3-319-64371-7_6. ISBN  978-3-319-64371-7. PMID  29116632.
  15. ^ de Jong, B .; Hill, P .; Brookes, R .; Otu, J .; Peterson, K .; Malý, P .; Adegbola, R. (14. října 2005). „Mycobacterium africanum: nový oportunní patogen při infekci HIV?“. AIDS. 19 (15): 1714–1715. doi:10.1097 / 01.aids.0000185991,54595,41. PMID  16184053.

Bibliografie

externí odkazy