Projekt genetiky myší - Mouse Genetics Project

The Projekt genetiky myší (MGP) je ve velkém měřítku mutant výroba myší a fenotypizace program zaměřený na identifikaci nových modelové organismy nemoci.[1][2][3][4]

Založeno na Wellcome Trust Sanger Institute, projekt používá knockout myši většinu z nich generoval International Knockout Mouse Consortium. U každé mutantní linie se skupiny sedmi samců a sedmi samic myší pohybují potrubím standardní analýzy zaměřeným na detekci znaků, které se liší od zdravých C57BL / 6 myši.[1] Potrubí shromažďuje mnoho měření životaschopnosti, plodnosti, tělesné hmotnosti, infekce, sluchu, morfologie, hematologie, chování, chemie krve a imunity a porovnává je s divoký typ řízení pomocí statistik smíšený model.[5] Tyto údaje jsou okamžitě sdíleny mezi vědeckou a lékařskou výzkumnou komunitou na zakázku otevřený přístup databáze,[6] a souhrny se zobrazují v dalších online zdrojích, včetně Myší genomová informatika databáze a na Wikipedii Gene Wiki.[4]

V červenci 2013 uvádí MGP, že má více než 900 mutantních linií otevřeně k dispozici mezinárodní výzkumné komunitě,[4] a mít „věcně úplnou“ analýzu pro více než 650 mutantních linií,[6] z nichž více než 75 procent má alespoň jeden abnormální fenotyp.[1] Mezi ně patří nové objevy genů podílejících se na nemoci, včetně nálezů:

Viz také

Reference

  1. ^ A b C Ayadi A, Birling MC, Bottomley J a kol. (Říjen 2012). „Iniciativy pro rozsáhlé fenotypování myší: přehled Evropské kliniky pro myší choroby (EUMODIC) a projektu genetiky myší Wellcome Trust Sanger Institute“. Mamm. Genom. 23 (9–10): 600–10. doi:10.1007 / s00335-012-9418-r. PMC  3463797. PMID  22961258.
  2. ^ Gerdin AK (2010). „Genetický program Sanger Mouse: Vysoce výkonná charakterizace knockoutovaných myší“. Acta Ophthalmologica. 88 (S248): 0. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  3. ^ A b van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). „Sada nástrojů pro genetiku myší: odhalení funkce a mechanismu“. Genome Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC  3218837. PMID  21722353.
  4. ^ A b C White JK, Gerdin AK, Karp NA a kol. (Červenec 2013). „Generace v celém genomu a systematické fenotypování knockoutovaných myší odhaluje nové role pro mnoho genů“. Buňka. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC  3717207. PMID  23870131.
  5. ^ Karp NA, Melvin D, Mott RF (2012). „Robustní a citlivá analýza fenotypů knockoutovaných myší“. PLOS ONE. 7 (12): e52410. doi:10.1371 / journal.pone.0052410. PMC  3530558. PMID  23300663.
  6. ^ A b Portál myších zdrojů, Wellcome Trust Sanger Institute.
  7. ^ Alderton GK (březen 2011). "Genomická nestabilita: Rozšíření dosahu Fanconiho anémie". Nat. Rev. Rakovina. 11 (3): 158–159. doi:10.1038 / nrc3027. PMID  21451554.
  8. ^ Crossan GP, ​​van der Weyden L, Rosado IV, Langevin F, Gaillard PH, McIntyre RE, Gallagher F, Kettunen MI, Lewis DY, Brindle K, Arends MJ, Adams DJ, Patel KJ (únor 2011). „Narušení myšího Slx4, regulátoru strukturně specifických nukleáz, fenokopie Fanconiho anémie“. Nat. Genet. 43 (2): 147–52. doi:10,1038 / ng.752. PMC  3624090. PMID  21240276.
  9. ^ Bassett JH, Gogakos A, White JK, Evans H, Jacques RM, van der Spek AH, Ramirez-Solis R, Ryder E, Sunter D, Boyde A, Campbell MJ, Croucher PI, Williams GR (2012). „Rychlá fenotypizace skeletu 100 knockoutovaných myší identifikuje 9 nových genů, které určují sílu kostí“. PLoS Genet. 8 (8): e1002858. doi:10.1371 / journal.pgen.1002858. PMC  3410859. PMID  22876197.
  10. ^ McIntyre RE, Lakshminarasimhan Chavali P, Ismail O, Carragher DM, Sanchez-Andrade G, Forment JV, Fu B, Del Castillo Velasco-Herrera M, Edwards A, van der Weyden L, Yang F, Ramirez-Solis R, Estabel J, Gallagher FA, Logan DW, Arends MJ, Tsang SH, Mahajan VB, Scudamore CL, White JK, Jackson SP, Gergely F, Adams DJ (2012). „Narušení myši Cenpj, regulátoru biogeneze centriolu, fenokopie Seckelův syndrom“. PLoS Genet. 8 (11): e1003022. doi:10.1371 / journal.pgen.1003022. PMC  3499256. PMID  23166506.
  11. ^ Nijnik A, Clare S, Hale C, Chen J, Raisen C, Mottram L, Lucas M, Estabel J, Ryder E, Adissu H, Adams NC, Ramirez-Solis R, White JK, Steel KP, Dougan G, Hancock RE ( Července 2012). „Role transportéru sfingosin-1-fosfátu Spns2 ve funkci imunitního systému“. J. Immunol. 189 (1): 102–11. doi:10,4049 / jimmunol.1200282. PMC  3381845. PMID  22664872.
  12. ^ Nijnik A, Clare S, Hale C, Raisen C, McIntyre RE, Yusa K, Everitt AR, Mottram L, Podrini C, Lucas M, Estabel J, Goulding D, Adams N, Ramirez-Solis R, White JK, Adams DJ, Hancock RE, Dougan G (únor 2012). „Kritická role histonové H2A-deubikvitinázy Mysm1 při hemopoéze a diferenciaci lymfocytů“. Krev. 119 (6): 1370–9. doi:10.1182 / krev-2011-05-352666. PMID  22184403.

externí odkazy