Methylacidiphilum fumariolicum - Methylacidiphilum fumariolicum

Methylacidiphilum fumariolicum je autotrofní bakterie poprvé popsaná v roce 2007 roste na sopečných bazénech poblíž Neapol, Itálie. Roste v bahně teploty mezi 50 ° C - 60 ° C a kyselé pH 2–5. Je schopen okysličovat metan plyn.^[1] Využívá to amonný, dusičnan nebo atmosférický dusík jako zdroj dusíku a fixuje oxid uhličitý.^[2]

Vzhledem k přítomnosti a lanthanid závislý methanol dehydrogenáza enzym je jeho růst přísně závislý na množství kovy vzácných zemin.^[1]

Ne biotické interakce mezi M. fumariolicum a další organismy jsou známy, pravděpodobně kvůli extrémnímu prostředí, které bakterie potřebují, aby mohly růst.

Biologie

Genom

Genom M. fumariolicum je 2,36 Mbp ve velikosti s a Obsah GC 40,9% a 2 283 genů kódujících proteiny.^[3]

Metabolismus

Energii získává metan oxidace na methanolu a enzymem methanol dehydrogenáza což je přísně závislé na použití kovů vzácných zemin jako kofaktory. Obvykle se používá lanthan jako základní kofaktor, ale ukázalo se, že jej lze nahradit jinými lanthanoidy jako cer, praseodym nebo neodym bez negativních účinků as samarium, evropské nebo gadolinium pouze zpomaluje rychlost růstu bakterií.^[1]

Využívá Cyklus Calvina Bensona Basshama opravit oxid uhličitý a použít jej jako zdroj uhlíku. Ve skutečnosti koncentrace CO₂ pod 0,3% (v / v) zhoršuje růst o M. fumariolicum.^[4]

M. fumariolicum bylo zjištěno, že je citlivější na kyslík než většina ostatních proteobakteriální methanotrofy. Pravděpodobně kvůli tomu, že používá dusičnan v době fixace dusíkem o kterém je známo, že je citlivý na kyslík.^[5]

Reference