Seznam chemických databází - List of chemical databases
Toto je seznam webových stránek, které obsahují seznamy chemických látek nebo databáze chemických informací. Další podrobnosti o obsahu těchto a dalších zdrojů naleznete v a Wikibook informačních zdrojů.
| zkratka | celé jméno | operátor | vybírá | obsahuje | předpona id | kvalitní | odkaz | záznamů |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3DMET | Databáze trojrozměrných struktur přírodních metabolitů | přírodní metabolity z vydaných knih | KEGG INCHI se usmívá | kurátor a potvrzeno | „3DMET“. | 18,255 | ||
| Herec | Agentura na ochranu životního prostředí | toxikologické informace; výskyt | "Herec". | 893,280 | ||||
| AtomWork | Databáze anorganických materiálů | Národní institut pro vědu o materiálech | krystalové struktury | „AtomWork“. | 82,000 | |||
| Beilstein | Databáze Beilstein | Elsevier | organické sloučeniny | vlastnosti | uzavřený přístup | |||
| BIAdb | Databáze benzylisochinolinových alkaloidů | „BIAdb“. | 846 | |||||
| BindingDB | Vazební databáze | Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences na Kalifornské univerzitě v San Diegu | nekovalentní asociace molekul v roztoku | ChEMBL se usmívá InChiKey cíle | "BindingDB". | |||
| BindingMOAD | Závazná matka všech databází | struktury proteinových ligandů | „BindingMOAD“. | 36047 | ||||
| BMDB | Bovinní databáze metabolomu | Collaborative Drug Discovery | BMDB | ručně vybráno a zaškrtnuto | "BMDB". | 7859 | ||
| BMRB | Databáze biologických magnetických rezonancí | University of Wisconsin | biologické molekuly včetně ligandů, kofaktorů, peptidů, sacharidů | NMR spektroskopie | „BMRB“. | |||
| BRENDA | Technická univerzita v Braunschweigu | enzymové ligandy | „BRENDA“. | |||||
| Databáze karotenoidů | karotenoidy | CA | „Karotenoidy“. | 1195 | ||||
| CCRIS | Informační systém pro výzkum chemické karcinogeneze | Národní lékařská knihovna | látky ovlivňující nádory | CCRIS | z primární literatury, recenzované odborníky | „CCRIS podmnožina PubChem“. | 9562[1][2] | |
| Veřejné CDD | kandidáti na drogy | omezený přístup | 3,000,000 | |||||
| ChEBI | Chemické entity biologického zájmu | ELIXÍR | malé chemické sloučeniny | od PDBeChem ChEMBL KEGG IntEnz | "ChEBI". | 60,000 | ||
| Chematica | Merck | organické chemikálie | výpočet reakční dráhy; Beilstein CAS ÚSMĚVY | proprietární | 7,000,000 | |||
| ChEMBL | Chemikálie z Evropské laboratoře molekulární biologie | EMBL | molekuly s vlastnostmi podobnými lékům | "ChEMBL". | 1,961,000 | |||
| ChemDB | chemická databáze | malé molekuly | "ChemDB". | 5,000,000 | ||||
| ChemExper | Chemický adresář Chemexper | katalog chemikálií | Struktura CASno SMILES | "ChemExper". | ||||
| Chemická kniha | "Chemická kniha". | |||||||
| Chemický registr | od 20 000 prodejců | CASno hlavně od větších dodavatelů | "Chemický registr". | 1,750,000 | ||||
| ChemSpider | Royal Society of Chemistry | ze 275 zdrojů dat | "ChemSpider". | 88,000,000 | ||||
| TRESKA | Otevřená databáze krystalografie | Vilniuská univerzita | malé molekuly (open source) | atomové souřadnice krystalové struktury | TRESKA | kurátor | "TRESKA". | 460,500 |
| Souhrn běžných názvů pesticidů | Alan Wood | Pesticidy s ISO běžné názvy | struktura, CASNO, název IUPAC, SMILES, InChI | kurátor | „Pesticidy“. | 1,800 | ||
| CompTox | Řídicí panel chemikálií CompTox | Americká agentura na ochranu životního prostředí | chemické látky hodnocené na potenciální zdravotní rizika | „CompTox“. | ||||
| CosIng | Kosmetické přísady | Evropská komise | kosmetické přísady | "CosIng". | ||||
| CrystalWorks | Rada pro vědecká a technologická zařízení | „CrystalWorks“. | ||||||
| CSD | Cambridge strukturální databáze | Cambridge krystalografické datové centrum | „CSD“. | 1,038,250 | ||||
| CSDB | Databáze struktur sacharidů | Zelinský institut organické chemie | sacharidy | odkazy na struktury | ID CSDB | „CSDB“. | ||
| CTD | Srovnávací databáze toxikogenomiky | Katedra biologických věd na North Carolina State University | MeSH CAS Č. ChEBI PubChem geny, dráhy | "CTD". | ||||
| DDB | Dortmundská datová banka | čisté sloučeniny, směsi, hydráty plynů | fyzikální vlastnosti | „DDB“. | ||||
| DETHERM | DECHEMA | termofyzikální vlastnosti | „DETHERM“. | 75,000 | ||||
| DrugBank | University of Alberta | léky | „DrugBank“. | |||||
| DrugCentral | léčiva | výrobky obsahující látku | „DrugCentral“. | |||||
| DTP / NCI | Kolekce DTP Open Compound | Národní onkologický institut Rozvojový terapeutický program | Léčba rakoviny | Číslo národního servisního střediska pro chemoterapii rakoviny | „DTP / NCI“. | 250,000 | ||
| ECHA | Databáze REACH | Evropská agentura pro chemické látky | EINECS ELINCS NLP | CAS Č. HP Vyznačuje prostornost piktogramů | „ECHA / REACH“. | 23,000 | ||
| EAWAG-BBD | Databáze biokatalýzy / biodegradace | Eawag: Švýcarský federální institut pro vodní vědu a technologii | CAS SMILES pubchem drah | „EAWAG-BBD“. | 1396 | |||
| eMolekuly | chemikálie pro screening léků | seznam dodavatelů a katalogová čísla | „eMolekuly“. | 8,000,000[3] | ||||
| ENCS | Seznam japonských existujících a nových chemických látek | regulované chemikálie | „ENCS (v japonštině)“. | |||||
| Vyhodnocená kinetická data | IUPAC | rychlostní konstanty | kurátor | „Vyhodnocená kinetická data“. | ||||
| FDA SRS | Registrační systém pro správu potravin a léčiv | Americká národní lékařská knihovna | přísady ve výrobcích regulovaných FDA | UNII palce | „FDA SRS“. | 781,000 | ||
| FEMA | Knihovna složek příchutí | Sdružení výrobců příchutí a extraktů | Číslo CAS CFR FEMA | "FEMA". | ||||
| FooDB | Databáze potravin | University of Alberta | Složky potravin a přísady | „FooDB“. | 70926 | |||
| GlyTouCan | mezinárodní úložiště glykanové struktury | Ministerstvo školství, kultury, sportu, vědy a technologie | glykany | WURCS GlycoCT PubChem CID | G | „Glycan Repository“. | 122194 | |
| Gmelin | Databáze Gmelin | Elsevier | anorganické a organokovové sloučeniny | uzavřený přístup | 1,500,000 | |||
| G-SRS | Globální systém registrace látek | CAS PubChem ChEMBL INN UNII | "G-SRS". | 109,260 | ||||
| GMD | Databáze metabolomu Golm | GC / MS metabolitů | „GMD“. | |||||
| Průvodce po farmakologii | IUPHAR | drogy a cíle | INN CAS CHEBI ChEMBL DrugBank PubChem | „Průvodce po farmakologii“. | ||||
| Henryho zákon konstanty | Max Planck Institute for Chemistry | těkavé sloučeniny | Henryho zákonné konstanty | z literatury | „Henryho zákonné konstanty“. | 17350 | ||
| HMDB | Lidská databáze metabolomu | Genome Kanada | metabolity nalezené v lidském těle | biochemické údaje, klinické údaje | HMDB | "HMDB". | 114,222[4] | |
| ICSC | Mezinárodní karty chemické bezpečnosti ILO | Mezinárodní organizace práce | CAS, číslo ES, číslo UN | „ICSC“. | 1784 | |||
| ICSD | Databáze struktur anorganických krystalů | FIZ Karlsruhe GmbH | „ICSD“. | 161,030 | ||||
| IEDB | Databáze imunních epitopů | Národní institut pro alergie a infekční nemoci | Epitopy hlavně peptidy a sacharidy | „IEDB“. | 3002 nepeptidů | |||
| JECDB | Japonsko Existující chemická databáze | CAS EINECS RTECS SDBS TSCA graf počtu článků za rok | „JECDB“. | |||||
| J-GLOBAL | Nikaji | Japonská agentura pro vědu a technologii | „J-GLOBAL“. | |||||
| KEGG | Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes | Centrum bioinformatiky na Kyoto University | Sloučeniny glykany (také enzymy, reakce, cesty) | CAS CHEBI ChEMBL MASSBANK NIKKAJI PubChem PDB-CCD | „KEGG“. | |||
| K.i Databáze | PDSP | vazba ligandu | "Ki databáze". | |||||
| Batoh | Nara Institute of Science and Technology | InChI CAS SMILES organismy | C00 | "Batoh". | ||||
| ŘÁDKY | Knihovna integrovaných síťových celulárních podpisů | malé molekuly | PubChem ChEMBL se usmívá InChI | LSM | „LINCS“. | 43,700 | ||
| LipidBank | Japonská konference o biochemii lipidů | lipidy | „LipidBank“. | 7,009 | ||||
| LMSD | Databáze struktur LIPID MAPS | Lipidy | HMDB ChEBI PubChem InChI | LMFA | „LMSD“. | 44701 | ||
| LOLI | Seznam seznamů | bezpečnostní listy, regulace | "LOLI". | |||||
| Mcule | dodané chemikálie | InChI, SMILES, SDF, fyzikálně-chemické vlastnosti | "Mcule". | 45,000,000 | ||||
| MediaDB | Ústav pro systémovou biologii | růstová média | „MediaDB“. | 288 | ||||
| Index společnosti Merck | Royal Society of Chemistry | léky | „Merck-Index“. | 11,500 | ||||
| Pletivo | Lékařské předměty | Americká národní lékařská knihovna | biomedicínský tezaurus | hierarchie deskriptorů literatury s MeSH ID | "Pletivo". | |||
| MetaCyc | SRI International | metabolické cesty; metabolity | „MetaCyc“. | |||||
| MetaboLights | EMBL-EBI | MTBL | „MetaboLights“. | |||||
| MetaNetX | metabolické sítě | MNXM | „MetaNetX“. | |||||
| METLIN | Databáze metabolitů a chemických entit | tandemová hmotnostní spektrometrie metabolitů | „METLIN“. | 960,000 | ||||
| ModelSeed | KEGG MetaCyc metabolické cesty | CPD | „ModelSeed“. | |||||
| MolPort | katalog chemikálií | „MolPort“. | ||||||
| MoNA | Mass Bank of North America | hmotnostní spektra | splash legg chemspider pubchem chebi CAS | "MoNA". | 200,000 | |||
| Kapesní vodítko NIOSH | NIOSH Kapesní průvodce chemickými nebezpečími | Národní institut pro bezpečnost a ochranu zdraví při práci | běžně používané chemikálie | expoziční limity | „NIOSH“. | 677 | ||
| NIST Webbook | Webbook NIST Chemistry | Národní institut pro standardy a technologie | spektra CAS ionizační energie hmotnostní spektrum, InChI | C + CAS | „NIST Webbook“. | |||
| NMRShiftDB | Univerzita v Kolíně nad Rýnem | organický | spektra nukleární magnetické rezonance | „NMRShiftDB“. | 43,581 | |||
| NORMAN SLE | Výměna seznamů podezřelých NORMAN | monitorování životního prostředí | „NORMAN SLE“. | 110,000 | ||||
| OrgSyn | Organické syntézy | Organic Syntheses, Inc. | Spolehlivé chemické reakce | Prohledávatelné experimentální postupy | Recenzováno | „Vyhledávání OrgSyn“. | ||
| PDB PDBe | Proteinová datová banka v Evropě | EMBL-EBI | má některé chemikálie i bílkoviny | "PDBe". | ||||
| OBLAST PATENTU | WIPO | „PATENTSCOPE“. | 16,000,000 | |||||
| PDB | RSCB Proteinová datová banka | "PDB". | 166,891 | |||||
| PharmGKB | Shriramovo centrum pro bioinženýrství a Chemické inženýrství | drogové cíle | informace o předepisování | kurátor | "PharmGKB". | |||
| Průzkumník fenolu | polyfenoly nacházející se v potravinách | "Fenol-Explorer". | 500 | |||||
| Phosida | PHOsphorylation Ste DAtabase | proteinové modifikace | "Phosida". | |||||
| PoLyInfo | Polymerní databáze | Národní institut pro vědu o materiálech | fyzikální vlastnosti | „PoLyInfo“. | 26,000 | |||
| PPDB | Databáze vlastností pesticidů | Oddělení výzkumu zemědělství a životního prostředí, University of Hertfordshire | Pesticidy a jejich metabolity | Chemická struktura, fyzikálně-chemické vlastnosti, lidské zdraví a ekotoxikologické údaje | kurátor | „PPDB“. | 2000[5] | |
| ProCarDB | Prokaryotická bakteriální karotenoidová databáze | IMTECH | odkazy na spektra | „ProCarDB“. | 1800 | |||
| PubChem | Národní lékařská knihovna Národní centrum pro biotechnologické informace | ze 748 zdrojů dat | Struktury, názvy a identifikátory, chemické a fyzikální vlastnosti, spektrální informace, související záznamy, prodejci chemikálií, farmakologie a biochemie, použití a výroba, bezpečnost a rizika, toxicita, literatura, patenty, biomolekulární interakce a cesty, výsledky biologických testů | "PubChem". | 103,000,000 | |||
| Reaxys | Elsevier | chemické sloučeniny | Prohledávatelné chemické reakce | „O společnosti Reaxys“. | 118,000,000 | |||
| Ref-DB | Re-referenced Protein Chemical shift Database | proteiny z BioMagResBank | Znovu odkazovaný posun NMR | „Ref-DB“. | 2162 | |||
| Rhea | Švýcarský institut pro bioinformatiku | biochemické reakce | ChEBI | kurátor | "Rhea". | |||
| RÖMPP | Thieme Gruppe | „RÖMPP“. | ||||||
| RTECS | Registr toxických účinků chemických látek | Dassault Systèmes | Toxicita, literatura | „Biovia-RTECS“. | 160,000 | |||
| RxNav | Americká národní lékařská knihovna | léky | interakce | „RxNav“. | ||||
| SciFinder | Služba Chemical Abstracts z Americká chemická společnost | organické, anorganické chemikálie, bílkoviny | CAS č | pouze placený přístup | 130,000,000 | |||
| ScrubChem | poškrábaný z PubChem | "ScrubChem". | 2,282,992 | |||||
| SDBS | Spektrální databáze pro Organické sloučeniny | Národní institut pokročilé průmyslové vědy a technologie (AIST), Japonsko | japonský | Spektra: IR Raman MASS ESR 11H NMR 13C NMR | „SDBS“. | |||
| Databáze metabolomu séra | Metabolomické inovační centrum | nachází se v krevním séru | "Sérový metabolome DB". | 4,651 | ||||
| Nástroj pro výběr rozpouštědel | ACS Green Chemistry Institute | Rozpouštědla | Analýza základních složek fyzikálních vlastností | kurátor | "Nástroj pro výběr rozpouštědel". | 272[6] | ||
| SPRESIweb | InfoChem Gesellschaft für chemische Information mbH | organické molekuly a reakce | organické struktury | z literatury | "SPRESI". | 5,800,000 | ||
| SpringerMateriály | Springer | pevné materiály | Fyzikální vlastnosti CAS InChI | z literatury | „SpringerMaterials“. | 155,165 + 494,942 | ||
| STEH | EMBL | od společností Biocarta, BioCyc, GO, KEGG a Reactome | Interakce chemicko-proteinové | kurátor a předpovídal | "STEH". | 500,000 | ||
| SuperDRUG2 | Skupina pro strukturální bioinformatiku | drogové cíle | cíle, dávka, vedlejší účinky, Canonical SMILES, Standard InChI, Standard InChIKey, DrugBank, ChEMBL, DrugCentral, KEGG, PubChem, CASRN | SD | „SuperDRUG2“. | 4,600 | ||
| Super přírodní II | přírodní chemické látky | SMILES prodejci | SN00 | „Super Natural II“. | 325,508 | |||
| SureChEMBL | Evropská laboratoř molekulární biologie | látky v patentech | patentový text | „SureChEMBL“. | ||||
| SwissLipids | Švýcarský institut pro bioinformatiku | lipidy | SLM: | „SwissLipids“. | ||||
| Cíle TDR | Výzkum tropických nemocí | Laboratoř trypanosomatiky | drogy a cíle | „Cíle TDR“. | 2,000,000 | |||
| TTD | Databáze terapeutických cílů | Zhejiang University | drogy a cíle | ÚSMĚVY INCHI CAS PubChem | „TTD“. | 37,316 | ||
| T3DB | Databáze toxinů a toxinových cílů Databáze toxických expozic | University of Alberta | toxiny a toxinové cíle | T3D | „T3DB“. | 3,678 | ||
| UniProt | Znalostní databáze UniProt | bílkoviny | sekvence, modifikace, umístění, organismus, podobné | „UniProt“. | ||||
| USA DOT | Americké ministerstvo dopravy | Průvodce nouzovými odezvami DOT + další | hromadně přepravované chemikálie | UN číslo OSN identifikační číslo, průvodce reakcí na nebezpečí | „Průvodce nouzovými odezvami“ (PDF). | 3000 | ||
| UV / VIS spektrální atlas | MPI-Mainz UV / VIS spektrální atlas plynných molekul atmosférického zájmu | Max Planck Institute for Chemistry | plynné molekuly | absorpční průřezy | z literatury | „UV / VIS Spectral Atlas“. | 7313 | |
| YMDB | Databáze metabolomu kvasinek | Metabolomické inovační centrum | metabolity kvasinek | 48 datových polí | YMDB | „YMDB“. | 16042 | |
| ZINEK | ZINC není komerční | University of California, San Francisco | prodejné látky | EPA DSS TOX, CHEMBL, HMDB, KEGG, PDB, SMILES | "ZINEK". | 200,000,000 |
Reference
- ^ „Informační systém pro výzkum chemické karcinogeneze (CCRIS) - zdroj dat PubChem“. pubchem.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2020-08-07.
- ^ „Stáhnout údaje CCRIS (Informační systém pro výzkum karcinogeneze)“. www.nlm.nih.gov. Citováno 2020-08-07.
- ^ „Vize - eMolekuly“. www.emolecules.com. Citováno 2020-07-27.
- ^ „Databáze lidských metabolomů: O databázi lidských metabolomů“. hmdb.ca. Citováno 2020-07-27.
- ^ Lewis, Kathleen A .; Tzilivakis, John; Warner, Douglas J .; Green, Andrew (2016). "Mezinárodní databáze pro hodnocení a řízení rizik pesticidů". Hodnocení lidských a ekologických rizik: Mezinárodní věstník. 22 (4): 1050–1064. doi:10.1080/10807039.2015.1133242. hdl:2299/17565. S2CID 87599872.
- ^ Diorazio, Louis J .; Hose, David R. J .; Adlington, Neil K. (2016). „Směrem k holističtějšímu rámci pro výběr rozpouštědel“. Výzkum a vývoj organických procesů. 20 (4): 760–773. doi:10.1021 / acs.oprd.6b00015.